155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0552 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  100 
 
 		 227 aa  454  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4393  flagellar assembly protein FliH  44.21 
 
 		 245 aa  185  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3079  flagellar assembly protein FliH  40 
 
 		 244 aa  176  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131312  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3805  flagellar assembly protein FliH  40 
 
 		 244 aa  176  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1115  flagellar assembly protein FliH  44.93 
 
 		 247 aa  169  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.222897 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  41.95 
 
 		 303 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  32.62 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  33.71 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  29.73 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  32.04 
 
 		 231 aa  98.6  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  31.82 
 
 		 268 aa  95.9  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  30.58 
 
 		 296 aa  93.2  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  30.59 
 
 		 245 aa  88.6  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  30.59 
 
 		 245 aa  88.6  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  28.51 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  30.59 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  31.31 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  32.46 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  31.2 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  34.13 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3063  flagellar assembly protein H  32.93 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  25.56 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0220  flagellar assembly protein H  32.34 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188523  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  31.98 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  34.12 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  34.13 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  31.74 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0415  flagellar assembly protein H  31.74 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6415  flagellar assembly protein H  32.34 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491071 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2977  flagellar assembly protein H  32.34 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.575281 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3111  flagellar assembly protein H  31.74 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  31.58 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  31.74 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2144  flagellar assembly protein H  31.74 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0232  flagellar assembly protein H  31.74 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3402  flagellar assembly protein H  31.74 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  29.36 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  32.93 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  26.9 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3085  flagellar assembly protein H  31.14 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0955445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  30.41 
 
 		 267 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  32.34 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4170  flagellar assembly protein FliH  31.05 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3772  flagellar assembly protein H  27.52 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.939362 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0164  flagellar assembly protein H  27.68 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  32.4 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  32.54 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2933  flagellar assembly protein H  27.93 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2452  flagellar assembly protein H  32.34 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0964661  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3066  flagellar assembly protein H  32.34 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00102567  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0843  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  32.98 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2902  flagellar assembly protein FliH  32.14 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  29.56 
 
 		 339 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  31.82 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  30.99 
 
 		 252 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  27.06 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  27.33 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2716  flagellar assembly protein H  30.49 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353539 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1708  flagellar assembly protein FliH  30.49 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.246476  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  29.07 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  29.07 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  29.26 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  27.04 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  27.91 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0081  flagellar assembly protein H  28.99 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  29.26 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  29.44 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  29.88 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2531  flagellar assembly protein H  29.3 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1244  flagellar assembly protein H  29.88 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2173  flagellar assembly protein H  29.88 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.125202  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1702  flagellar assembly protein H  29.88 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  27.78 
 
 		 316 aa  61.6  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  31.25 
 
 		 300 aa  61.6  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  30.49 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2406  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  26.4 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  26.78 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1190  flagellar biosynthesis protein  31.33 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  27.8 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3920  flagellar assembly protein FliH  31.65 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0428484 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  25 
 
 		 334 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0435  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  24.4 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00322204  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3836  flagellar assembly protein FliH  32.08 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739706  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0690  flagellar assembly protein FliH  23.98 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  26.29 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  26.23 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  25 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  26.23 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  25 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  27.62 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  26.71 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0232  flagellar assembly protein H  26.74 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.310336 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0713  flagellar assembly protein H  26.74 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2187  flagellar assembly protein H  30.57 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.528884 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0633  flagellar assembly protein H  26.74 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2949  flagellar assembly protein H  28.57 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1271  flagellar assembly protein H  30.57 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.640019 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2134  flagellar assembly protein H  30.57 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271327 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2129  flagellar assembly protein H  30.57 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.30816 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1878  flagellar assembly protein FliH  28.49 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479163  normal  0.528624 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>