More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0490 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0490  heat shock protein DnaJ-like  100 
 
 
326 aa  658    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  68.2 
 
 
327 aa  458  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  66.98 
 
 
315 aa  427  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2220  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  67.49 
 
 
325 aa  427  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.159655  normal  0.021204 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  58.86 
 
 
315 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  64.47 
 
 
313 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  56.01 
 
 
313 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  61.32 
 
 
308 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2130  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  63.58 
 
 
323 aa  364  1e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192509  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6288  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  56.65 
 
 
313 aa  346  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.524726  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1428  heat shock protein DnaJ-like protein  59.42 
 
 
321 aa  344  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  52.83 
 
 
315 aa  342  4e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0723  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  56.31 
 
 
326 aa  333  3e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1124  heat shock protein DnaJ domain protein  56.27 
 
 
326 aa  331  9e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.405615 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1431  heat shock protein DnaJ family  55.76 
 
 
318 aa  314  9.999999999999999e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  50.47 
 
 
341 aa  311  1e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  50.47 
 
 
313 aa  311  1e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  50.93 
 
 
320 aa  309  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0618  heat shock protein DnaJ domain protein  53.54 
 
 
331 aa  299  4e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0639  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  53.54 
 
 
331 aa  298  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  49.38 
 
 
324 aa  289  5.0000000000000004e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2478  heat shock protein DnaJ domain protein  50.16 
 
 
304 aa  289  6e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  47.96 
 
 
319 aa  281  8.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  52.6 
 
 
313 aa  276  4e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3102  curved DNA-binding protein  50.95 
 
 
310 aa  272  6e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177095  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2700  chaperone DnaJ domain protein  50.95 
 
 
310 aa  272  6e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.062215  hitchhiker  0.0000000117807 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.79 
 
 
324 aa  268  5.9999999999999995e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2984  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.53 
 
 
331 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3374  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.01 
 
 
347 aa  258  9e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  47.65 
 
 
295 aa  256  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2217  hypothetical protein  48.57 
 
 
296 aa  253  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  48.57 
 
 
296 aa  252  5.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2014  chaperone DnaJ-like  47.37 
 
 
316 aa  237  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122637  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  43.57 
 
 
297 aa  235  6e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  41.12 
 
 
324 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  39.09 
 
 
335 aa  231  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  41.46 
 
 
330 aa  230  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0047  heat shock protein DnaJ-like  39.88 
 
 
330 aa  228  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.940459  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  41.54 
 
 
313 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  41.8 
 
 
306 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  41.8 
 
 
306 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  41.8 
 
 
306 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  41.8 
 
 
306 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  41.8 
 
 
306 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1856  chaperone DnaJ domain protein  43.5 
 
 
328 aa  226  6e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000127856  normal  0.0651455 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  42.24 
 
 
306 aa  225  8e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.81 
 
 
316 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  41.93 
 
 
306 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  41.93 
 
 
306 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  41.93 
 
 
306 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  41.93 
 
 
306 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  41.93 
 
 
306 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  41.93 
 
 
306 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  41.93 
 
 
306 aa  223  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1171  chaperone DnaJ-like  42.9 
 
 
304 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  41.61 
 
 
306 aa  223  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  44.34 
 
 
315 aa  219  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0049  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.31 
 
 
339 aa  216  4e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.19 
 
 
317 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  42.45 
 
 
314 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  42.14 
 
 
314 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02638  curved DNA binding protein  45.2 
 
 
299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0647  chaperone DnaJ domain protein  41.83 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  39.38 
 
 
313 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.05 
 
 
323 aa  211  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0039  heat shock protein DnaJ  40.25 
 
 
332 aa  210  3e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  38.75 
 
 
314 aa  206  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  37.9 
 
 
307 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0577  chaperone DnaJ-like  41.23 
 
 
316 aa  203  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344875  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3860  curved DNA-binding protein CbpA  42.54 
 
 
309 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.167572  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1433  DnaJ protein  44.23 
 
 
293 aa  204  2e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6429  chaperone DnaJ domain protein  38.87 
 
 
324 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  44.31 
 
 
318 aa  202  7e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  40.18 
 
 
320 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  37.28 
 
 
326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  40.74 
 
 
319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.74 
 
 
319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1364  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.87 
 
 
293 aa  197  3e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0285  chaperone DnaJ domain protein  39.68 
 
 
319 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  39.69 
 
 
294 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.09 
 
 
325 aa  194  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4024  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.42 
 
 
316 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115039  normal  0.0763204 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  38.19 
 
 
287 aa  192  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.03 
 
 
289 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4435  chaperone DnaJ domain protein  38.07 
 
 
311 aa  189  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.42 
 
 
287 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4905  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.32 
 
 
318 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113006 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2022  heat shock protein DnaJ-like  36.84 
 
 
333 aa  186  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190531  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  35.02 
 
 
301 aa  185  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  34.01 
 
 
339 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  34.48 
 
 
340 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1130  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.17 
 
 
351 aa  184  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  33.81 
 
 
337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  41.46 
 
 
318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  41.03 
 
 
318 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  34.96 
 
 
335 aa  182  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00580  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  36.51 
 
 
297 aa  181  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  41.16 
 
 
318 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.84 
 
 
319 aa  179  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.69 
 
 
334 aa  179  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>