230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0434 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  100 
 
 		 441 aa  847    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 403 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  43.54 
 
 		 383 aa  259  8e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  43.92 
 
 		 369 aa  249  8e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  45.24 
 
 		 404 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  45.24 
 
 		 404 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  44.65 
 
 		 408 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  42.06 
 
 		 400 aa  236  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  36.19 
 
 		 385 aa  236  7e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  43.47 
 
 		 403 aa  231  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  42.35 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  43.8 
 
 		 439 aa  227  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  42.43 
 
 		 373 aa  226  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  44.06 
 
 		 405 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  43.43 
 
 		 373 aa  223  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  43.68 
 
 		 402 aa  222  9e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  43.68 
 
 		 402 aa  222  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  43.8 
 
 		 405 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  43.68 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  43.77 
 
 		 409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1383  major facilitator superfamily MFS_1  48.14 
 
 		 384 aa  221  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2902  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  43.41 
 
 		 402 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3406  putative amino acid ABC transporter, permease protein  43.41 
 
 		 402 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1638  putative amino acid ABC transporter, permease protein  43.41 
 
 		 402 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2963  putative amino acid ABC transporter, permease protein  43.41 
 
 		 402 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.798243  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  42.22 
 
 		 451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  42.9 
 
 		 393 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  39.73 
 
 		 384 aa  213  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 		 387 aa  212  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 386 aa  202  9.999999999999999e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  38.66 
 
 		 378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  37.02 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  37.68 
 
 		 397 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  41.43 
 
 		 388 aa  196  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  36.74 
 
 		 396 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  38.26 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  40.36 
 
 		 400 aa  190  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  38.07 
 
 		 379 aa  189  7e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  35.84 
 
 		 397 aa  187  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  36.21 
 
 		 417 aa  186  8e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3207  major facilitator transporter  42.25 
 
 		 401 aa  183  7e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  39.26 
 
 		 419 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  37.12 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  37.3 
 
 		 407 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  37.82 
 
 		 383 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  36.54 
 
 		 383 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 405 aa  179  7e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  36.11 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  40.5 
 
 		 391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  36.73 
 
 		 386 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  35.32 
 
 		 389 aa  172  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  35.6 
 
 		 389 aa  170  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  35 
 
 		 385 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  35 
 
 		 385 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  37.89 
 
 		 405 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  37.43 
 
 		 391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  35.66 
 
 		 378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  35.66 
 
 		 378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  36.04 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  35.66 
 
 		 378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  35.66 
 
 		 378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  35.66 
 
 		 378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  35.66 
 
 		 378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  37.2 
 
 		 401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  37.84 
 
 		 377 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  34.67 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  35.39 
 
 		 378 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  39.78 
 
 		 392 aa  163  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 		 379 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 384 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 383 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  40.7 
 
 		 470 aa  160  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 384 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  36.61 
 
 		 383 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 384 aa  159  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  38.42 
 
 		 403 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  36.59 
 
 		 385 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 384 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 		 408 aa  158  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  35.91 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3065  MFS family transporter  38.3 
 
 		 377 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 384 aa  152  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2067  putative transport protein (permease)  38.98 
 
 		 379 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 		 387 aa  152  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 398 aa  150  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 387 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 387 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3793  major facilitator transporter  37.93 
 
 		 377 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.510326  normal  0.658705 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  34.82 
 
 		 392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  35.42 
 
 		 403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  33.72 
 
 		 392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6960  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 411 aa  147  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  35.16 
 
 		 387 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>