More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0423 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 462 aa  931    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  55.31 
 
 		 463 aa  499  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  46.88 
 
 		 465 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  46.88 
 
 		 465 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  46.22 
 
 		 465 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  45.71 
 
 		 466 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.74 
 
 		 461 aa  382  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  45.87 
 
 		 463 aa  375  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  45.53 
 
 		 462 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.89 
 
 		 465 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  43.76 
 
 		 463 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.66 
 
 		 456 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.01 
 
 		 456 aa  363  4e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000009553 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.51 
 
 		 467 aa  359  5e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 		 467 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.46 
 
 		 458 aa  355  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.82 
 
 		 461 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.61 
 
 		 467 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.76 
 
 		 467 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  42.21 
 
 		 470 aa  332  1e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.87 
 
 		 468 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.87 
 
 		 468 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.87 
 
 		 468 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 		 477 aa  329  8e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  43.6 
 
 		 446 aa  326  7e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.27 
 
 		 473 aa  323  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3411  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 		 466 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.648729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 468 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.3 
 
 		 450 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.67 
 
 		 450 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.12 
 
 		 445 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 		 475 aa  309  8e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 		 449 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  41.48 
 
 		 443 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  42.7 
 
 		 431 aa  307  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  40.61 
 
 		 455 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  41.27 
 
 		 443 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 469 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 		 480 aa  296  7e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  37.95 
 
 		 482 aa  295  8e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  37.95 
 
 		 482 aa  295  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 480 aa  295  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  37.95 
 
 		 482 aa  294  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  37.74 
 
 		 480 aa  293  4e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  37.74 
 
 		 482 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 462 aa  291  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  37.97 
 
 		 482 aa  291  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  37.53 
 
 		 468 aa  291  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  37.5 
 
 		 475 aa  286  7e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 480 aa  285  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 471 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  34.95 
 
 		 491 aa  276  6e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  34.59 
 
 		 491 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2166  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 455 aa  275  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.51 
 
 		 468 aa  274  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  35.92 
 
 		 464 aa  270  5e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  34.38 
 
 		 491 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  36.52 
 
 		 459 aa  269  8e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 		 464 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0198  two-component system sensor protein, histidine kinase  34.76 
 
 		 446 aa  265  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00722417  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001640  signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 461 aa  264  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  35.45 
 
 		 464 aa  263  6e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  35.23 
 
 		 464 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  35.23 
 
 		 464 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  35.23 
 
 		 464 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  35.23 
 
 		 464 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  35.23 
 
 		 464 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  34.96 
 
 		 463 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  36.93 
 
 		 465 aa  260  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0029  IrlS  35.59 
 
 		 715 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.93 
 
 		 469 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  42.68 
 
 		 483 aa  253  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 469 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  42.68 
 
 		 484 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  42.68 
 
 		 436 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 		 472 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 469 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  42.36 
 
 		 484 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 481 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 469 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1306  heavy metal sensor histidine kinase  34.79 
 
 		 454 aa  250  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175805  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  34.62 
 
 		 463 aa  249  6e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0835  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 465 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 		 458 aa  246  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1126  heavy metal sensor kinase  33.84 
 
 		 454 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470151  normal  0.220682 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4392  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 474 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 474 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 468 aa  243  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3841  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 474 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0343  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 		 458 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 489 aa  240  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 460 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 477 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 476 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  33.85 
 
 		 476 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 		 477 aa  237  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 474 aa  236  7e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2429  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 474 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>