More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0361 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0361  patatin  100 
 
 
323 aa  643    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  55.83 
 
 
317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  56.93 
 
 
315 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  58.24 
 
 
293 aa  301  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  58.37 
 
 
349 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  55.16 
 
 
316 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  55.15 
 
 
358 aa  292  5e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  56.69 
 
 
311 aa  292  7e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  56.37 
 
 
302 aa  291  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  53.96 
 
 
347 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  53.6 
 
 
306 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  53.79 
 
 
474 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  55.98 
 
 
302 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  53.6 
 
 
347 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  55.81 
 
 
306 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  55.81 
 
 
305 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  55.81 
 
 
305 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  53.6 
 
 
347 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  55.64 
 
 
308 aa  288  9e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  60.26 
 
 
358 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  54.29 
 
 
319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  55.47 
 
 
301 aa  281  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  52.19 
 
 
318 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  52.42 
 
 
318 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  52.52 
 
 
327 aa  275  6e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  52.99 
 
 
302 aa  271  8.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  56.68 
 
 
298 aa  269  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  51.06 
 
 
348 aa  269  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  53.6 
 
 
308 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  49.48 
 
 
345 aa  264  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  55.04 
 
 
347 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  55.04 
 
 
347 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  49.49 
 
 
330 aa  262  4.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  52.38 
 
 
346 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  43.97 
 
 
346 aa  255  8e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  44.3 
 
 
346 aa  255  9e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  59.81 
 
 
223 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  38.51 
 
 
334 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  39.27 
 
 
335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2248  patatin  39.18 
 
 
346 aa  195  9e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000483093  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  43.95 
 
 
311 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  42.48 
 
 
320 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  42.48 
 
 
320 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  42.48 
 
 
333 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1099  Patatin  47.66 
 
 
216 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  38.49 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  38.28 
 
 
273 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  37.14 
 
 
260 aa  178  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  39.31 
 
 
300 aa  172  9e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  38.61 
 
 
262 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  36.44 
 
 
256 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  38.68 
 
 
263 aa  169  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1250  Patatin  40.93 
 
 
315 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  40.74 
 
 
263 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  40.33 
 
 
263 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  40.33 
 
 
263 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  40.33 
 
 
263 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  39.92 
 
 
263 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  39.92 
 
 
263 aa  166  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  39.92 
 
 
263 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  39.92 
 
 
263 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  37.29 
 
 
728 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  40.33 
 
 
263 aa  165  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  40.33 
 
 
263 aa  165  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  37.33 
 
 
727 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  38.08 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  36.95 
 
 
751 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  36.66 
 
 
728 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  37.5 
 
 
275 aa  160  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  37.16 
 
 
275 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  37.16 
 
 
275 aa  155  9e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  37.6 
 
 
324 aa  153  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  35.62 
 
 
310 aa  151  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  35.53 
 
 
733 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  35.56 
 
 
767 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1715  patatin  36.29 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000010772 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  34.19 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  34.19 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  34.63 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  36.31 
 
 
728 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  34.51 
 
 
272 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  35.67 
 
 
728 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  43.9 
 
 
323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  46.93 
 
 
335 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  34.96 
 
 
259 aa  146  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  45.41 
 
 
323 aa  146  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  35.96 
 
 
738 aa  145  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  34.8 
 
 
728 aa  146  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  33.68 
 
 
760 aa  145  9e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  35.09 
 
 
852 aa  143  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  45.79 
 
 
315 aa  143  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  33.33 
 
 
737 aa  143  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  37.79 
 
 
335 aa  142  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  36.33 
 
 
803 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  36.33 
 
 
803 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  36.33 
 
 
803 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  35.99 
 
 
804 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  42.86 
 
 
354 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  36.33 
 
 
796 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  33 
 
 
343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0388322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>