44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0227 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0227  hemerythrin HHE cation binding protein  100 
 
 		 193 aa  394  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0293  hemerythrin HHE cation binding protein  74.48 
 
 		 207 aa  298  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0042  hemerythrin HHE cation binding region  71.35 
 
 		 198 aa  288  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1515  hemerythrin HHE cation binding region  71.84 
 
 		 176 aa  264  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  59.9 
 
 		 191 aa  233  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  53.61 
 
 		 194 aa  202  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1354  rhodopsin-like G-protein  48.98 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1209  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  45.03 
 
 		 195 aa  163  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  40.41 
 
 		 191 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2767  hemerythrin HHE cation binding region  39.79 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0539302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7075  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  40.11 
 
 		 191 aa  130  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  38.54 
 
 		 437 aa  123  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5608  hemerythrin HHE cation binding domain protein  37.77 
 
 		 190 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  34.74 
 
 		 196 aa  108  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6235  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.78 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.47 
 
 		 199 aa  104  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  32.11 
 
 		 194 aa  104  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3843  hypothetical protein  30.49 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  30.95 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7704  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.54 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1756  hemerythrin HHE cation binding region  28.49 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1479  hemerythrin HHE cation binding region  26.79 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.786202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  26.56 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  26.79 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  28.42 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6523  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.46 
 
 		 218 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.85 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7884  hypothetical protein  28.33 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.765433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1164  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.49 
 
 		 184 aa  48.1  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7174  hypothetical protein  48.94 
 
 		 307 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0260  hemerythrin HHE cation binding protein  26.95 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1774  hemerythrin HHE cation binding region  27.16 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2516  hemerythrin HHE cation binding region  25 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.97 
 
 		 747 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.105486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5843  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.14 
 
 		 213 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.737154  normal  0.680441 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2661  hypothetical protein  26.62 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3104  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.45 
 
 		 257 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  27.05 
 
 		 177 aa  42  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3347  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30 
 
 		 164 aa  42  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.329659  hitchhiker  0.00378546 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3549  hypothetical protein  26.53 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1584  hypothetical protein  44.68 
 
 		 313 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127319  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1353  hypothetical protein  25.93 
 
 		 180 aa  41.6  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.086878 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1012  hemerythrin HHE cation binding region  22.09 
 
 		 180 aa  41.2  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1937  hypothetical protein  22.56 
 
 		 213 aa  41.2  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000015412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>