More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0198 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  100 
 
 		 326 aa  659    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  69.21 
 
 		 341 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  67.88 
 
 		 302 aa  410  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  67.88 
 
 		 302 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  63.58 
 
 		 302 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  66.23 
 
 		 302 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  65.03 
 
 		 306 aa  388  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3864  thioredoxin domain-containing protein  65.02 
 
 		 295 aa  386  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  50.16 
 
 		 318 aa  294  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  49.37 
 
 		 314 aa  278  7e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0364  thioredoxin domain-containing protein  48.26 
 
 		 312 aa  265  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000110184 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  42.28 
 
 		 282 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  41.95 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  42.95 
 
 		 282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  41.95 
 
 		 282 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  41.06 
 
 		 282 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  41.06 
 
 		 282 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  43.33 
 
 		 918 aa  208  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  40.73 
 
 		 301 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  41.28 
 
 		 282 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  40.94 
 
 		 282 aa  205  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  40.94 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  40.2 
 
 		 280 aa  203  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  39.74 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  37.09 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  39.07 
 
 		 282 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  39.13 
 
 		 281 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  39.46 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  36.33 
 
 		 280 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  36.96 
 
 		 282 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  36.88 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  35.81 
 
 		 280 aa  172  5.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  34.45 
 
 		 287 aa  170  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  35.9 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  34.67 
 
 		 286 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  33.21 
 
 		 287 aa  159  5e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  33.44 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  33.99 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  34.1 
 
 		 285 aa  157  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  30.5 
 
 		 285 aa  156  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  33.76 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  32.46 
 
 		 306 aa  155  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  32.34 
 
 		 306 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  33.77 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  33.55 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  31.72 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  32.69 
 
 		 303 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  32.15 
 
 		 289 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  33.44 
 
 		 302 aa  152  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  30.92 
 
 		 287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  32.59 
 
 		 304 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  33.54 
 
 		 290 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  32.09 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  32.37 
 
 		 306 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  30.99 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  32.15 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  31.66 
 
 		 324 aa  149  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  32.01 
 
 		 317 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  31.63 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  32.05 
 
 		 290 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  31.66 
 
 		 329 aa  149  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  34.47 
 
 		 300 aa  149  7e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  34.84 
 
 		 302 aa  149  9e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  31.63 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  32.48 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  31.8 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  35.16 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  33 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  35.29 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  33 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  35.02 
 
 		 326 aa  146  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  35.83 
 
 		 302 aa  145  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  33.66 
 
 		 286 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  33.71 
 
 		 293 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  30.59 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  31.13 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  33.44 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  31.89 
 
 		 320 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  31.76 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  33.33 
 
 		 274 aa  143  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  33.44 
 
 		 286 aa  143  5e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  33.45 
 
 		 312 aa  142  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  31.13 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  32.49 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  33.22 
 
 		 311 aa  139  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  28.04 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  31.33 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  31.95 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  32.47 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  32.33 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  31.67 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  31.45 
 
 		 336 aa  133  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  32.65 
 
 		 307 aa  132  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  28.75 
 
 		 285 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  35 
 
 		 304 aa  132  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  31.72 
 
 		 324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  30.8 
 
 		 277 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  31.54 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  29.21 
 
 		 334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  32.06 
 
 		 282 aa  129  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>