More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0183 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0183  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 
267 aa  531  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685184  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6089  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  78 
 
 
270 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2966  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  73.03 
 
 
266 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2914  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  71.15 
 
 
269 aa  387  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2888  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  71.2 
 
 
263 aa  381  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117638  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4569  phosphonate ABC transporter, permease protein  67.19 
 
 
259 aa  371  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03975  phosphonate/organophosphate ester transporter  66.16 
 
 
272 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0307  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  66.8 
 
 
259 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.685305  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5616  phosphonate ABC transporter, permease protein  67.19 
 
 
259 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4179  phosphonate ABC transporter permease  72.24 
 
 
288 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4657  phosphonate ABC transporter, permease protein  67.19 
 
 
259 aa  364  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3923  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  67.19 
 
 
259 aa  364  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0773  phosphonate ABC transporter permease  74.02 
 
 
292 aa  363  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.741951  normal  0.989098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4344  phosphonate ABC transporter, permease protein  68.4 
 
 
259 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20330  phosphonate ABC tranporter permease protein  73.36 
 
 
264 aa  359  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.293398  normal  0.582568 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1747  phosphonate ABC transporter permease PhnE  73.36 
 
 
264 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415612  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4605  phosphonate ABC transporter, permease protein  66.41 
 
 
259 aa  358  3e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0827  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  70.4 
 
 
267 aa  357  8e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.152622  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4522  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  65.43 
 
 
280 aa  339  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4621  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  65.4 
 
 
280 aa  338  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.438003 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0837  ABC phosphonate transporter, inner membrane subunit PhnE  68.38 
 
 
280 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3336  phosphonate ABC transporter, permease protein  66.81 
 
 
271 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3348  phosphonates ABC transporter, permease protein  66.81 
 
 
271 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3302  phosphonate ABC transporter, permease protein  66.81 
 
 
271 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2249  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  70.74 
 
 
262 aa  326  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.859646  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2596  phosphonates ABC transporter, permease protein  66.38 
 
 
271 aa  325  7e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2409  phosphonates ABC transporter, permease protein  66.38 
 
 
271 aa  325  7e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1187  phosphonates ABC transporter, permease protein  66.38 
 
 
271 aa  325  7e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0326  phosphonates ABC transporter, permease protein  66.38 
 
 
271 aa  325  7e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2557  phosphonates ABC transporter, permease protein  69.87 
 
 
262 aa  324  8.000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108995  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3857  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  57.94 
 
 
277 aa  298  7e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  57.94 
 
 
277 aa  298  7e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0261  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  52.78 
 
 
271 aa  264  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03936  hypothetical protein  63.54 
 
 
205 aa  260  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0394  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  50.56 
 
 
679 aa  218  7.999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.417915 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03935  hypothetical protein  72.13 
 
 
122 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3257  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.56 
 
 
272 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814913  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3326  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  43.69 
 
 
365 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1319  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  44.66 
 
 
287 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758207  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4996  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.38 
 
 
264 aa  169  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0396446  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3240  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.82 
 
 
276 aa  168  8e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655899  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3991  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.82 
 
 
276 aa  168  8e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608155  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2185  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43.88 
 
 
290 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1280  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.39 
 
 
276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3390  phosphonate ABC transporter, permease  36.47 
 
 
264 aa  166  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0936447  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3473  phosphonate ABC transporter permease  36.47 
 
 
264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410084  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3702  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.47 
 
 
264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000191718 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3748  phosphonate ABC transporter permease  36.47 
 
 
264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1522  phosphonate ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 
264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0252842  normal  0.0146163 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3439  phosphonate ABC transporter, permease  36.47 
 
 
264 aa  165  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2297  ABC phosphonate permease  42.06 
 
 
268 aa  165  8e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3793  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.08 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.893389  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3744  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.08 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000212765  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5856  putative PhnE protein, phosphonate ABC transporter, putative membrane protein  45.59 
 
 
294 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234805  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2918  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.33 
 
 
294 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1320  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.53 
 
 
294 aa  161  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0912  phosphate ABC transporter permease  38.21 
 
 
275 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.166132  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3822  phosphonate ABC transporter permease  39.64 
 
 
300 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571251  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0423  ABC type permease  43.01 
 
 
261 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436548  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0459  ABC type permease  43.01 
 
 
261 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3371  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
264 aa  158  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0022523  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3721  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.64 
 
 
264 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.254444  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3860  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  50.66 
 
 
293 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.206995  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0766  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43.23 
 
 
293 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1322  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.33 
 
 
533 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497345  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0177  phosphonate ABC transporter permease  37.9 
 
 
264 aa  156  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000132377  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6365  phosphonate ABC transporter, permease component  42.72 
 
 
289 aa  155  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0563067  normal  0.924702 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1418  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.44 
 
 
266 aa  155  8e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0873  phosphonate ABC transporter inner membrane subunit  34.52 
 
 
265 aa  155  9e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.122179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3380  putative phosphonate transport system permease protein htxC phnE  40.64 
 
 
273 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0216  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.41 
 
 
341 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4429  phosphonate ABC transporter permease  47.09 
 
 
282 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4036  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.41 
 
 
341 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.311979  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2338  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.94 
 
 
265 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000033517  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5855  putative PhnE protein, phosphonate ABC transporter, putative membrane protein  43.86 
 
 
282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0463216  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4086  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  42.71 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0261465  normal  0.0836049 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2184  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.39 
 
 
290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.122688  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4430  phosphonate ABC transporter permease  43.28 
 
 
293 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4203  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.25 
 
 
294 aa  153  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.852389  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5875  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.29 
 
 
277 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2298  ABC phosphonate permease  37.84 
 
 
271 aa  149  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0182  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.73 
 
 
542 aa  149  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3823  phosphonate ABC transporter permease  47.45 
 
 
282 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.378202  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0127  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.25 
 
 
266 aa  149  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0132  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.25 
 
 
266 aa  149  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2284  phosphonate ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 
266 aa  148  7e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0852833  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1342  phosphonate ABC transporter permease  37 
 
 
293 aa  148  8e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2796  phosphonate ABC transporter, permease protein  37.44 
 
 
293 aa  148  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2875  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2081  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  34.65 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0250  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  34.55 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2680  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.97 
 
 
298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3707  phosphonate ABC transporter permease  36.6 
 
 
292 aa  145  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.324444 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2202  phosphonate ABC transporter inner membrane subunit  38.28 
 
 
542 aa  145  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6356  phosphonate ABC transporter, permease protein  33.72 
 
 
298 aa  145  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.690717  normal  0.762824 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1413  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.75 
 
 
299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0367  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.62 
 
 
272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3945  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.3 
 
 
294 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.351226  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4576  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.58 
 
 
269 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4995  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.42 
 
 
245 aa  143  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250762  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>