286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0126 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0126  allophanate hydrolase  100 
 
 		 325 aa  656    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.254359  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1884  urea amidolyase-related protein  66.15 
 
 		 334 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2955  urea amidolyase related protein  65.73 
 
 		 331 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2160  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  66.15 
 
 		 334 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0361  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  66.15 
 
 		 334 aa  424  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0897  urea amidolyase-related protein  66.15 
 
 		 334 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1183  urea amidolyase-related protein  66.15 
 
 		 334 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0270  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  65.84 
 
 		 334 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1719  urea amidolyase-like protein  65.84 
 
 		 334 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0365  urea amidolyase related protein  65.42 
 
 		 331 aa  421  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6284  allophanate hydrolase  65.42 
 
 		 331 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0599  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  65.52 
 
 		 325 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2934  urea amidolyase-related protein  64.58 
 
 		 324 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131824  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2720  Urea amidolyase-related protein  65.2 
 
 		 324 aa  411  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.592152  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2120  urea amidolyase related protein  65.52 
 
 		 323 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00861242  normal  0.545781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2922  urea amidolyase related protein  65.3 
 
 		 323 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2770  urea amidolyase related protein  65.62 
 
 		 323 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2860  urea amidolyase related protein  65.3 
 
 		 323 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0238503  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4581  urea amidolyase related protein  65.02 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.625746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0009  urea amidolyase related protein  66.12 
 
 		 325 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.871318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5870  hypothetical protein  61.23 
 
 		 325 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06480  putative hydrolase  60.62 
 
 		 325 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000202222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2381  urea amidolyase related protein  61.23 
 
 		 325 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2439  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  62.23 
 
 		 323 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.598305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3255  Urea carboxylase  58.82 
 
 		 323 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.612176 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2477  urea amidolyase related protein  59.5 
 
 		 335 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4042  urea amidolyase related protein  48.61 
 
 		 325 aa  293  3e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  36.96 
 
 		 334 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  38.62 
 
 		 329 aa  212  7e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  39.38 
 
 		 323 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  40.62 
 
 		 1212 aa  207  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  39.94 
 
 		 1208 aa  204  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  37.54 
 
 		 1822 aa  204  2e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  40.43 
 
 		 1204 aa  202  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2789  urea amidolyase related protein  41.18 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  39.5 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  41.59 
 
 		 1200 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  40.68 
 
 		 1201 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  40.06 
 
 		 1204 aa  199  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  41.37 
 
 		 1231 aa  199  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  40.44 
 
 		 314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  40.06 
 
 		 310 aa  196  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  39.88 
 
 		 1207 aa  197  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  37.99 
 
 		 1204 aa  196  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  38.94 
 
 		 1200 aa  196  6e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  39.13 
 
 		 1208 aa  195  9e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2593  urea amidolyase related protein  40.12 
 
 		 326 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  39.69 
 
 		 309 aa  192  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  35.22 
 
 		 329 aa  192  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  39.1 
 
 		 1203 aa  192  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  34.91 
 
 		 329 aa  192  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2273  urea amidolyase related protein  36.01 
 
 		 323 aa  192  7e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  37.81 
 
 		 1204 aa  192  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  39.06 
 
 		 1209 aa  192  8e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  35.52 
 
 		 329 aa  192  8e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  35.58 
 
 		 328 aa  192  9e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  38.25 
 
 		 353 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  34.59 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  34.91 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  35.85 
 
 		 329 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  39.68 
 
 		 1226 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  35.53 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  37.54 
 
 		 310 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  37.54 
 
 		 310 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  37.54 
 
 		 310 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  37.54 
 
 		 310 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  41.75 
 
 		 1228 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  35.85 
 
 		 329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  37.92 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  37.18 
 
 		 350 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2826  urea amidolyase related protein  38.3 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196428  hitchhiker  0.00928055 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  39.14 
 
 		 1209 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  35.51 
 
 		 320 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  35.51 
 
 		 320 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  37.23 
 
 		 310 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  39.1 
 
 		 1488 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  39.12 
 
 		 310 aa  189  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  39.8 
 
 		 1201 aa  189  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  38.84 
 
 		 359 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  39.2 
 
 		 371 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  38.84 
 
 		 359 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  40.72 
 
 		 1210 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  39.2 
 
 		 371 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  38.84 
 
 		 359 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  39.2 
 
 		 371 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  39.2 
 
 		 371 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  38.08 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  38.08 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  38.08 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  38.08 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  37.79 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  37.61 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  41.78 
 
 		 1203 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  38.08 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  39.56 
 
 		 316 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  36.34 
 
 		 1206 aa  186  4e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  37.31 
 
 		 310 aa  186  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  37.96 
 
 		 316 aa  186  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  37.08 
 
 		 349 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  37.08 
 
 		 348 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>