178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0115 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0115  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 232 aa  478  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  70.51 
 
 		 220 aa  299  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3318  DSBA oxidoreductase  69.86 
 
 		 227 aa  298  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  70.51 
 
 		 220 aa  298  3e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  67.27 
 
 		 248 aa  295  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2296  DSBA oxidoreductase  64.71 
 
 		 221 aa  288  5.0000000000000004e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00720993  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  61.97 
 
 		 215 aa  271  7e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  60.56 
 
 		 215 aa  262  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  57.14 
 
 		 220 aa  259  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  58.77 
 
 		 212 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  58.14 
 
 		 215 aa  249  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0261  DSBA oxidoreductase  61.9 
 
 		 213 aa  249  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0132035 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3987  DSBA oxidoreductase  61.97 
 
 		 228 aa  245  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  55.61 
 
 		 222 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  54.88 
 
 		 221 aa  238  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  53.18 
 
 		 221 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1948  DSBA oxidoreductase  57.21 
 
 		 216 aa  231  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1642  DSBA oxidoreductase  50.93 
 
 		 218 aa  228  5e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.420211  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  51.85 
 
 		 217 aa  228  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  50.7 
 
 		 214 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  49.77 
 
 		 215 aa  216  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5788  DSBA oxidoreductase  53.05 
 
 		 215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487063 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  46.82 
 
 		 221 aa  212  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  44.55 
 
 		 216 aa  189  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  43.72 
 
 		 217 aa  186  4e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  43.26 
 
 		 222 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0970  DSBA oxidoreductase  44.55 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227612 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.91 
 
 		 219 aa  169  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  39.44 
 
 		 214 aa  167  9e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  39.07 
 
 		 215 aa  165  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  39.53 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  41.04 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  37.85 
 
 		 213 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  36.15 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  38.03 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0963  DSBA oxidoreductase  38.33 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0391729  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  38.79 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  37.85 
 
 		 221 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  37.85 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 		 223 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  34.7 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  35.78 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0952  DSBA oxidoreductase  33.48 
 
 		 219 aa  131  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440606  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  34.38 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  34.38 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1542  DSBA oxidoreductase  37.73 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  36.07 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  35.21 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  35.35 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  32.88 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  34.74 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  36.57 
 
 		 235 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  35.59 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 		 233 aa  125  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  34.25 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1441  DSBA oxidoreductase  35 
 
 		 214 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0402577 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2852  polyketide biosynthesis associated protein  33.64 
 
 		 214 aa  121  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  34.01 
 
 		 216 aa  121  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  34.12 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  34.6 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  32.73 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  34.39 
 
 		 237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  35.68 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  36.24 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  35.94 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4948  DSBA oxidoreductase  35.89 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.576797 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  33.65 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  33.65 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  36.45 
 
 		 222 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  34.12 
 
 		 243 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  33.81 
 
 		 256 aa  111  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  34.8 
 
 		 230 aa  111  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  34.12 
 
 		 243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1267  frnE protein  33.18 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  34.11 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0796  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  33.18 
 
 		 208 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  33.18 
 
 		 243 aa  108  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  35.41 
 
 		 237 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  34.76 
 
 		 235 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1893  DSBA oxidoreductase  33.64 
 
 		 238 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  31.6 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  32.06 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  31.92 
 
 		 213 aa  106  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  32.09 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  32.35 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4148  DSBA oxidoreductase  34.25 
 
 		 241 aa  105  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5763  DSBA oxidoreductase  36.54 
 
 		 218 aa  105  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1034  DSBA oxidoreductase  31.48 
 
 		 215 aa  105  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  30.99 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0550  polyketide biosynthesis associated protein  31.73 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  30.19 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  34.65 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0979  DSBA oxidoreductase  30.37 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00033798  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0591  DSBA oxidoreductase  33.03 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.699138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>