40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0095 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0095  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  308  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4072  hypothetical protein  81.62 
 
 		 141 aa  239  9e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4761  hypothetical protein  82.35 
 
 		 139 aa  234  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5272  Barstar (barnase inhibitor)  80.74 
 
 		 159 aa  233  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4860  hypothetical protein  80.88 
 
 		 141 aa  231  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316235  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3467  Barstar (barnase inhibitor)  79.41 
 
 		 141 aa  227  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.667156  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4108  hypothetical protein  79.41 
 
 		 141 aa  227  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4809  hypothetical protein  79.41 
 
 		 187 aa  226  9e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0595881  normal  0.0255133 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6032  hypothetical protein  68.75 
 
 		 192 aa  211  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.141829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0205  hypothetical protein  71.54 
 
 		 132 aa  202  9e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.854944 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3914  hypothetical protein  68.75 
 
 		 131 aa  188  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3011  hypothetical protein  65.62 
 
 		 207 aa  184  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2601  Barstar (barnase inhibitor)  64.84 
 
 		 207 aa  183  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2765  hypothetical protein  64.84 
 
 		 198 aa  181  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.475229 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2602  hypothetical protein  64.8 
 
 		 186 aa  181  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918993 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3395  Barstar (barnase inhibitor)  63.28 
 
 		 186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0011895  hitchhiker  0.0033866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0560  hypothetical protein  62.5 
 
 		 187 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269433  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0225  hypothetical protein  59.42 
 
 		 206 aa  176  8e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2474  barstar family protein  63.2 
 
 		 132 aa  175  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3472  barstar family protein  63.2 
 
 		 195 aa  175  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1191  barstar family protein  63.2 
 
 		 195 aa  176  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3437  barstar family protein  63.2 
 
 		 187 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0247  hypothetical protein  60.14 
 
 		 182 aa  175  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0394  barstar family protein  63.2 
 
 		 187 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1254  barstar family protein  63.2 
 
 		 187 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443809  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3311  barstar family protein  63.2 
 
 		 187 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3474  barstar family protein  63.2 
 
 		 187 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2845  hypothetical protein  61.72 
 
 		 203 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525425  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2985  hypothetical protein  62.5 
 
 		 202 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2752  hypothetical protein  54.42 
 
 		 188 aa  169  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.668584 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0534  hypothetical protein  60.8 
 
 		 187 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0558  hypothetical protein  60.8 
 
 		 187 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.567748 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0633  hypothetical protein  60.8 
 
 		 187 aa  168  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3715  hypothetical protein  60.8 
 
 		 187 aa  168  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.124225 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0150  hypothetical protein  60.8 
 
 		 187 aa  168  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0601  hypothetical protein  60.8 
 
 		 187 aa  168  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00391  hypothetical protein  29.81 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585131  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2671  hypothetical protein  26.05 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.223099 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2094  hypothetical protein  27.56 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.778398  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2183  hypothetical protein  26.77 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.55075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>