More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0089 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0089  proline iminopeptidase  100 
 
 		 333 aa  684    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0887  prolyl aminopeptidase  59.74 
 
 		 320 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0601  proline iminopeptidase  55 
 
 		 320 aa  354  8.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0084  prolyl aminopeptidase  53.82 
 
 		 318 aa  351  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.826118  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2133  proline iminopeptidase  53.67 
 
 		 315 aa  343  2.9999999999999997e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1042  proline iminopeptidase  56.82 
 
 		 316 aa  342  4e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4410  proline iminopeptidase  52.88 
 
 		 321 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.34926 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  52.87 
 
 		 328 aa  335  7e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  50.8 
 
 		 323 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  50.8 
 
 		 323 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  50.8 
 
 		 323 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3526  proline iminopeptidase  52.6 
 
 		 310 aa  332  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1929  prolyl aminopeptidase  52.6 
 
 		 310 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4009  proline iminopeptidase  52.6 
 
 		 310 aa  331  9e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.241684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  50.48 
 
 		 323 aa  331  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  50.16 
 
 		 323 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1088  proline iminopeptidase  51.94 
 
 		 326 aa  330  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.445968 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4251  proline iminopeptidase  51.95 
 
 		 310 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130879  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4115  proline iminopeptidase  51.95 
 
 		 310 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4027  prolyl aminopeptidase  51.3 
 
 		 318 aa  330  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3408  proline iminopeptidase  51.95 
 
 		 310 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.872292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  52.32 
 
 		 320 aa  328  6e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1122  proline iminopeptidase  52.88 
 
 		 316 aa  328  6e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2344  proline iminopeptidase  52.23 
 
 		 316 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.634485  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2440  proline iminopeptidase  52.23 
 
 		 316 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4474  proline iminopeptidase  51.3 
 
 		 310 aa  326  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261766  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  50.32 
 
 		 319 aa  325  5e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0513  proline iminopeptidase  50.16 
 
 		 323 aa  325  7e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1180  proline iminopeptidase  49.05 
 
 		 320 aa  325  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  0.812597 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0431  proline iminopeptidase  50.94 
 
 		 318 aa  325  7e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1626  proline iminopeptidase  51.91 
 
 		 316 aa  325  9e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  51.77 
 
 		 316 aa  325  9e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0314  proline iminopeptidase  50.48 
 
 		 316 aa  324  1e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  48.41 
 
 		 323 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0330  proline iminopeptidase  50.48 
 
 		 342 aa  324  2e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3091  proline iminopeptidase  51.72 
 
 		 319 aa  323  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133982  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3255  proline iminopeptidase  53.25 
 
 		 315 aa  323  3e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.189812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04709  prolyl aminopeptidase protein  50.8 
 
 		 320 aa  322  4e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0407  proline iminopeptidase  50.48 
 
 		 316 aa  322  5e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  48.09 
 
 		 323 aa  322  6e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2193  proline iminopeptidase  53.05 
 
 		 414 aa  322  7e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1033  proline iminopeptidase  49.36 
 
 		 320 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  50 
 
 		 323 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3492  prolyl aminopeptidase  49.84 
 
 		 317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.652932  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  49.68 
 
 		 323 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3920  proline iminopeptidase  50.8 
 
 		 317 aa  318  6e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.805731 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3807  proline iminopeptidase  50.8 
 
 		 317 aa  318  6e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0717  proline iminopeptidase  50.8 
 
 		 320 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.922147  normal  0.435096 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  50.32 
 
 		 317 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1603  prolyl aminopeptidase  50 
 
 		 329 aa  316  3e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2074  proline iminopeptidase  51.77 
 
 		 323 aa  316  4e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1173  proline iminopeptidase  51.77 
 
 		 429 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0886  proline iminopeptidase  51.77 
 
 		 429 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424986  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1492  proline iminopeptidase  50 
 
 		 330 aa  316  4e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0426318  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0279  proline iminopeptidase  51.77 
 
 		 429 aa  316  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237584  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2994  prolyl aminopeptidase  51.27 
 
 		 316 aa  315  5e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0267164  normal  0.7335 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2151  proline iminopeptidase  51.45 
 
 		 312 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0503  proline iminopeptidase  49.24 
 
 		 326 aa  314  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.624874 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1876  proline iminopeptidase  51.45 
 
 		 312 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756215  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1728  proline iminopeptidase  50 
 
 		 436 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0373  proline iminopeptidase  51.45 
 
 		 312 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  50.48 
 
 		 321 aa  312  3.9999999999999997e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  49.68 
 
 		 313 aa  311  7.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2838  proline iminopeptidase  51.57 
 
 		 321 aa  311  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00251437  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  48.72 
 
 		 313 aa  311  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0552  prolyl aminopeptidase  45.54 
 
 		 323 aa  310  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0850  prolyl aminopeptidase  49.68 
 
 		 313 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1598  proline iminopeptidase  49.52 
 
 		 329 aa  309  4e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0763  proline iminopeptidase  49.36 
 
 		 313 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2349  prolyl aminopeptidase  48.1 
 
 		 319 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34102  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2907  prolyl aminopeptidase  46.13 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  48.1 
 
 		 311 aa  300  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2590  proline iminopeptidase  49.21 
 
 		 328 aa  299  6e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3551  proline iminopeptidase  48.39 
 
 		 328 aa  296  3e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  44.44 
 
 		 313 aa  291  8e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1174  prolyl aminopeptidase  48.24 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.651315  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2836  proline iminopeptidase  48.24 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1479  proline iminopeptidase  45.98 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2767  proline iminopeptidase  48.25 
 
 		 322 aa  289  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07350  prolyl aminopeptidase  46.82 
 
 		 332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0712  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  47.1 
 
 		 314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0121198  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf626  proline iminopeptidase  42.44 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0299  prolyl aminopeptidase  46.53 
 
 		 316 aa  280  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0523  prolyl aminopeptidase  44.81 
 
 		 316 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.870437  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1807  hypothetical protein  41.59 
 
 		 319 aa  275  6e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3085  proline iminopeptidase  47.02 
 
 		 345 aa  275  8e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0168  proline iminopeptidase  45.65 
 
 		 323 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0360  proline iminopeptidase  43.18 
 
 		 316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12631  hydrolases or acyltransferases  44.81 
 
 		 316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1808  hypothetical protein  41.59 
 
 		 319 aa  273  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03901  proline iminopeptidase  42.43 
 
 		 316 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0624161  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1894  proline iminopeptidase  45.6 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03911  proline iminopeptidase  41.97 
 
 		 316 aa  268  7e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480314  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03961  proline iminopeptidase  42.33 
 
 		 313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3473  proline iminopeptidase  44.81 
 
 		 329 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.598272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4151  proline iminopeptidase  45.6 
 
 		 329 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3964  proline iminopeptidase  41.08 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3951  proline iminopeptidase  41.4 
 
 		 322 aa  258  7e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2056  proline iminopeptidase  41.38 
 
 		 324 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1856  proline iminopeptidase  41.96 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.0201858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>