24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0083 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0083    100 
 
 		 1699 bp  3368    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0118321  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  85.51 
 
 		 1770 bp  706    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  82.11 
 
 		 1671 bp  268  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  90.07 
 
 		 1707 bp  168  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  85.64 
 
 		 1692 bp  165  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  83.59 
 
 		 1689 bp  133  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  81.42 
 
 		 1743 bp  129  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  81.1 
 
 		 1734 bp  123  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  84.43 
 
 		 1713 bp  91.7  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  85.06 
 
 		 1650 bp  69.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  85.92 
 
 		 1764 bp  61.9  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  92.86 
 
 		 1689 bp  60  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  88.68 
 
 		 1842 bp  58  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  96.77 
 
 		 1188 bp  54  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  96.67 
 
 		 1320 bp  52  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  96.67 
 
 		 1119 bp  52  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2582  PhoH family protein  100 
 
 		 1479 bp  52  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  100 
 
 		 3402 bp  50.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2029  PhoH family protein  100 
 
 		 1722 bp  50.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.877213 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  88.64 
 
 		 1182 bp  48.1  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  96.43 
 
 		 1095 bp  48.1  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1399  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  93.75 
 
 		 1269 bp  48.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.235617  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  96.43 
 
 		 1119 bp  48.1  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3302  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  93.75 
 
 		 1419 bp  48.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.334689  normal  0.605218 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>