32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0082 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0082  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  463  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000224621  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2980  hypothetical protein  53.92 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2821  hypothetical protein  49.3 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.163509 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1032  general secretion pathway protein B  34.18 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0264257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0472  hypothetical protein  43.94 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0789  hypothetical protein  44.78 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22870  hypothetical protein  38.24 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.327708  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1157  general secretion pathway protein B  36.96 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3156  general secretion pathway protein B  36.96 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.997514  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1234  general secretion pathway protein B  36.96 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0914005  normal  0.846255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1201  general secretion pathway protein B  36.96 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2498  general secretion pathway protein B  29.59 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234384 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0836  general secretion pathway protein B  36.96 
 
 		 370 aa  53.1  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.19872  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298  general secretion pathway protein B  36.11 
 
 		 368 aa  50.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2982  general secretion pathway protein B  36.11 
 
 		 369 aa  50.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0060  general secretion pathway protein B, putative  34.72 
 
 		 269 aa  49.7  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2022  putative general secretion pathway protein B  35.37 
 
 		 256 aa  49.3  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000127173  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3074  general secretion pathway protein B  36.11 
 
 		 366 aa  48.9  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.212053  hitchhiker  0.00000136484 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1168  general secretion pathway protein B  33.33 
 
 		 328 aa  48.9  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000621685  hitchhiker  0.00000787826 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1086  general secretion pathway protein B  35.05 
 
 		 339 aa  48.9  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.970223  hitchhiker  0.0086707 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1010  general secretion pathway protein B  36.89 
 
 		 375 aa  48.5  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00086545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2977  general secretion pathway protein B  36.11 
 
 		 371 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.391436  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2895  general secretion pathway protein B  36.11 
 
 		 377 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1147  hypothetical protein  25.18 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  29.77 
 
 		 916 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0973  general secretion pathway protein B  35 
 
 		 358 aa  45.8  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.637256  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1586  hypothetical protein  26.59 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1117  general secretion pathway protein B  33.33 
 
 		 355 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2821  general secretion pathway protein B  33.33 
 
 		 420 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000107284  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44694  metalloprotease  30.43 
 
 		 1028 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  36.62 
 
 		 1281 aa  43.5  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3280  hypothetical protein  25.81 
 
 		 381 aa  42.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.539633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>