More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0064 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1804  ferrous iron transport protein B  55.52 
 
 		 621 aa  662    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529813  normal  0.0419932 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1860  ferrous iron transport protein B  57.33 
 
 		 617 aa  644    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0251  ferrous IRON transport B transmembrane protein  62.83 
 
 		 621 aa  706    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.563283  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2434  ferrous iron transport protein B  63.54 
 
 		 633 aa  742    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4061  ferrous iron transport protein B  61.2 
 
 		 621 aa  682    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5429  ferrous iron transport B domain-containing protein  62.13 
 
 		 617 aa  659    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895542  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3948  ferrous iron transport protein B  61.2 
 
 		 621 aa  682    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1443  ferrous iron transport protein B  64.56 
 
 		 631 aa  703    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0983772  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0064  ferrous iron transport protein B  100 
 
 		 628 aa  1248    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.956131  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5890  Fe2+ transport system protein B  61.06 
 
 		 620 aa  705    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1329  ferrous iron transport protein B  57.89 
 
 		 637 aa  671    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2176  ferrous iron transport protein B  61.77 
 
 		 647 aa  712    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00098  ferrous iron transport protein B  57.78 
 
 		 621 aa  662    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.069629  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0623  ferrous iron transport protein B  56.99 
 
 		 637 aa  664    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.356093  normal  0.228705 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1161  ferrous iron transport protein B  64.26 
 
 		 632 aa  737    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.233706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1471  transport protein B  75.44 
 
 		 629 aa  879    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47490  ferrous iron transport protein B  59.47 
 
 		 615 aa  627  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1922  ferrous iron transport protein B  57.17 
 
 		 617 aa  627  1e-178  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2975  ferrous iron transport protein B  54.52 
 
 		 626 aa  620  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.949455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4039  ferrous iron transport protein B  54.59 
 
 		 625 aa  619  1e-176  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1111  ferrous iron transport protein B  54.19 
 
 		 626 aa  617  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0954  ferrous iron transport protein B  52.99 
 
 		 626 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5116  ferrous iron transport protein B  53.15 
 
 		 626 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1058  ferrous iron transport protein B  52.17 
 
 		 626 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2451  ferrous iron transport protein B  52.8 
 
 		 621 aa  594  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2849  ferrous iron transport protein B  53.04 
 
 		 618 aa  589  1e-167  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0676  ferrous iron transport protein B  49.2 
 
 		 636 aa  582  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2987  ferrous iron transport protein B  52.92 
 
 		 619 aa  561  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0512994 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6110  ferrous iron transport protein B  52.62 
 
 		 625 aa  561  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218757  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3726  ferrous iron transport protein B  36.09 
 
 		 696 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3827  ferrous iron transport protein B  34.82 
 
 		 700 aa  445  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.792233 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1078  ferrous iron transport protein B  36.6 
 
 		 665 aa  436  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.996842  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2567  ferrous iron transport protein B  38.09 
 
 		 753 aa  424  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0962  ferrous iron transport protein B  35.17 
 
 		 699 aa  415  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03990  ferrous iron transport protein B-like protein  33.19 
 
 		 699 aa  399  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.625523  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0784  ferrous iron transport protein B  33.71 
 
 		 711 aa  396  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1451  ferrous iron transport protein B  36.7 
 
 		 705 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0248254  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  35.87 
 
 		 666 aa  395  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0871  ferrous iron transport protein B  50.36 
 
 		 716 aa  389  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2011  GTP-binding protein, HSR1-related  41.28 
 
 		 648 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606318  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  37.39 
 
 		 666 aa  384  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  34.6 
 
 		 664 aa  382  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  34.6 
 
 		 664 aa  382  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  33.95 
 
 		 631 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  33.5 
 
 		 587 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  33.82 
 
 		 662 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  33.82 
 
 		 587 aa  375  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  36.43 
 
 		 688 aa  372  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1709  ferrous iron transport protein B  38.02 
 
 		 618 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5086  ferrous iron transport protein B  35.51 
 
 		 712 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000565138  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  35.32 
 
 		 631 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0882  ferrous iron transport protein B  32.68 
 
 		 720 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000109469  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  33.97 
 
 		 665 aa  360  4e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  34.85 
 
 		 662 aa  353  8e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0890  ferrous iron transport protein B  33.09 
 
 		 684 aa  348  2e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  32.18 
 
 		 662 aa  342  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  32.12 
 
 		 691 aa  333  7.000000000000001e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  34.29 
 
 		 676 aa  331  3e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  31.84 
 
 		 721 aa  330  3e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2464  ferrous iron transport protein B  30.69 
 
 		 712 aa  329  9e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.967572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  32.49 
 
 		 649 aa  327  3e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  32.49 
 
 		 712 aa  325  2e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  30.91 
 
 		 716 aa  323  4e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  32.95 
 
 		 668 aa  319  7.999999999999999e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1739  ferrous iron transport protein B  30.4 
 
 		 646 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00069018  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  29.88 
 
 		 669 aa  312  9e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4234  ferrous iron transport protein B  39.95 
 
 		 722 aa  312  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2878  ferrous iron transport protein B  30.1 
 
 		 606 aa  307  4.0000000000000004e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0506695 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0654  ferrous iron transport protein B  34.62 
 
 		 693 aa  306  7e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0259  ferrous iron transport protein B  30.44 
 
 		 628 aa  306  9.000000000000001e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00038951  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0901  ferrous iron transport protein B  28.39 
 
 		 708 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000608812  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0543  ferrous iron transport protein B  31.49 
 
 		 669 aa  304  4.0000000000000003e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00422143  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0286  Fe2+ transport system protein B  30.7 
 
 		 704 aa  303  9e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  33.01 
 
 		 774 aa  300  4e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  30.06 
 
 		 715 aa  300  5e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  35.58 
 
 		 664 aa  298  2e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2584  ferrous iron transporter B  30.92 
 
 		 751 aa  298  2e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  36.44 
 
 		 662 aa  296  6e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  36.17 
 
 		 662 aa  295  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2711  ferrous iron transporter B  30.92 
 
 		 751 aa  296  1e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  36.23 
 
 		 662 aa  293  5e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  36.23 
 
 		 662 aa  293  5e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56680  ferrous iron transport protein B  34.62 
 
 		 766 aa  293  5e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1938  ferrous iron transport protein B  37.58 
 
 		 647 aa  293  6e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31907  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  35.55 
 
 		 662 aa  293  8e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1597  GTP-binding protein HSR1-related  35.82 
 
 		 617 aa  292  1e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  36.23 
 
 		 662 aa  292  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  36.23 
 
 		 662 aa  292  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  36.02 
 
 		 662 aa  291  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2809  ferrous iron transport protein B  32.96 
 
 		 597 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  36.02 
 
 		 662 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3383  ferrous iron transport protein B  35.7 
 
 		 683 aa  289  9e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.378196 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0108  ferrous iron transport protein B  35.8 
 
 		 712 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1929  ferrous iron transport protein B  36.09 
 
 		 712 aa  287  5e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000762105  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1097  ferrous iron transport protein B  33.49 
 
 		 595 aa  286  8e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0465  ferrous iron transport protein B  33.93 
 
 		 770 aa  286  8e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  39.04 
 
 		 844 aa  286  1.0000000000000001e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  30.3 
 
 		 784 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1569  ferrous iron transport protein B  29.39 
 
 		 646 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0441  ferrous iron transport protein B  35.58 
 
 		 700 aa  283  5.000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>