More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0018 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0018  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
344 aa  700    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  68.9 
 
 
344 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232615  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  68.31 
 
 
345 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  68.6 
 
 
345 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  68.9 
 
 
345 aa  498  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  68.9 
 
 
344 aa  496  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  68.02 
 
 
345 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  66.57 
 
 
346 aa  493  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1387  zinc-binding alcohol dehydrogenase  68.13 
 
 
341 aa  489  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0475  putative oxidoreductase  71.09 
 
 
348 aa  488  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.162605 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3348  alcohol dehydrogenase  69.77 
 
 
347 aa  486  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.442758 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  68.73 
 
 
342 aa  487  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001313  putative NADP-dependent oxidoreductase  67.25 
 
 
344 aa  479  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  66.28 
 
 
345 aa  478  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  66.28 
 
 
345 aa  478  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  66.28 
 
 
345 aa  478  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  66.28 
 
 
345 aa  477  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  65.7 
 
 
345 aa  475  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  66.28 
 
 
345 aa  477  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  66.77 
 
 
343 aa  477  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2055  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  65.7 
 
 
345 aa  475  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178182 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  65.7 
 
 
345 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  64.83 
 
 
344 aa  472  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1571  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  64.83 
 
 
345 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.332785  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0931  oxidoreductase, zinc-binding  67.15 
 
 
347 aa  468  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1752  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  64.53 
 
 
345 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1707  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  64.53 
 
 
345 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.24259  normal  0.344049 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1769  putative NADP-dependent oxidoreductase Yncb  64.53 
 
 
345 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1719  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  65.41 
 
 
345 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1704  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  64.83 
 
 
345 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1095  alcohol dehydrogenase  60.41 
 
 
354 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.172379  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  65.28 
 
 
337 aa  443  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1106  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  68.9 
 
 
345 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380617  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0259  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  68.9 
 
 
345 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1275  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  68.9 
 
 
345 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  64.39 
 
 
337 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1012  zinc-binding alcohol dehydrogenase  60.7 
 
 
349 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0106  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  68.9 
 
 
345 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0318  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  68.9 
 
 
345 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1691  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  68.6 
 
 
345 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.415717  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  63.42 
 
 
339 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1778  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  68.6 
 
 
345 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4220  alcohol dehydrogenase  66.86 
 
 
347 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3312  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  65.6 
 
 
342 aa  425  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3180  alcohol dehydrogenase  59.94 
 
 
342 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459116  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3537  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  59.65 
 
 
342 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5953  alcohol dehydrogenase  65.9 
 
 
352 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95038  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3963  zinc-binding alcohol dehydrogenase  65.9 
 
 
352 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4404  alcohol dehydrogenase  65.9 
 
 
352 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  66.28 
 
 
340 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3174  zinc-binding alcohol dehydrogenase  65.01 
 
 
342 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  61.95 
 
 
339 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4293  alcohol dehydrogenase  65.33 
 
 
352 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  63.53 
 
 
341 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1605  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  64.18 
 
 
352 aa  411  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954411  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3825  alcohol dehydrogenase  65.33 
 
 
352 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.48899 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1442  putative oxidoreductase/dehydrogenase  59.18 
 
 
340 aa  402  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17984  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25100  predicted NADP-dependent oxidoreductase  59.12 
 
 
340 aa  393  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  61.9 
 
 
341 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.808445  normal  0.209407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3192  alcohol dehydrogenase  61.01 
 
 
341 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3611  putative NADP-dependent oxidoreductase  61.01 
 
 
340 aa  388  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.0277118 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.71 
 
 
341 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5815  quinone oxidoreductase  61.58 
 
 
341 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369115  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2244  alcohol dehydrogenase  59.94 
 
 
338 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381714  normal  0.404773 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2201  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.64 
 
 
338 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  0.73824 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2519  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.35 
 
 
338 aa  383  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.74525  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3068  zinc-binding alcohol dehydrogenase  60.34 
 
 
344 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.281772  normal  0.0896091 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4367  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.28 
 
 
344 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179819 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6181  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.79 
 
 
338 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.128263 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.39 
 
 
341 aa  367  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.27647 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2773  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.39 
 
 
341 aa  358  5e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229175  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.04 
 
 
335 aa  352  5e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4427  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.85 
 
 
335 aa  348  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  50.59 
 
 
334 aa  332  6e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  50.74 
 
 
334 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03275  quinone oxidoreductase  52.49 
 
 
342 aa  330  3e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  50.15 
 
 
333 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2135  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.42 
 
 
344 aa  323  4e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.56 
 
 
333 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2006  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.61 
 
 
338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.17413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3362  alcohol dehydrogenase  49.71 
 
 
339 aa  318  6e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.540446  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  49.27 
 
 
333 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1697  alcohol dehydrogenase  50.44 
 
 
338 aa  317  3e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.781815 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2871  alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 
338 aa  316  4e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.390651  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.95 
 
 
337 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.45 
 
 
332 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.1 
 
 
341 aa  313  2.9999999999999996e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0954432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4195  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.7 
 
 
334 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  50.45 
 
 
332 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3414  alcohol dehydrogenase  48.97 
 
 
334 aa  311  7.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  48.96 
 
 
336 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2491  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.71 
 
 
338 aa  311  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.37 
 
 
336 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.37 
 
 
336 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.34 
 
 
334 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3188  alcohol dehydrogenase  47.79 
 
 
334 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.82 
 
 
337 aa  309  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2355  alcohol dehydrogenase  49.42 
 
 
339 aa  309  4e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  47.51 
 
 
333 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.38 
 
 
340 aa  308  5.9999999999999995e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>