165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0015 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1482  anion transporter  80.84 
 
 		 473 aa  718    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168166  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0015  anion transporter  100 
 
 		 475 aa  940    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00186698  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  42.86 
 
 		 466 aa  378  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26970  anion transporter  40.44 
 
 		 517 aa  375  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1529  anion transporter  43.04 
 
 		 473 aa  369  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00336443  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2718  anion transporter  41.68 
 
 		 472 aa  363  4e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2775  anion transporter  41.68 
 
 		 472 aa  363  4e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0347  anion transporter  42 
 
 		 467 aa  362  1e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2328  anion transporter family protein  41.1 
 
 		 472 aa  358  9.999999999999999e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4103  anion transporter  41.87 
 
 		 470 aa  350  4e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0104  anion transporter  37.95 
 
 		 476 aa  348  2e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0938  anion transporter  40.88 
 
 		 492 aa  345  1e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.842448 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0043  anion transporter  39.28 
 
 		 470 aa  335  9e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0037  anion transporter  39.49 
 
 		 470 aa  335  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2302  anion transporter  39.75 
 
 		 488 aa  333  4e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3266  anion transporter  37.14 
 
 		 494 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.0632125 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1465  anion transporter  39.92 
 
 		 490 aa  311  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0923  anion transporter  39.38 
 
 		 489 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0741  anion transporter  40.13 
 
 		 490 aa  307  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0476  sodium:sulfate symporter family protein  39.11 
 
 		 471 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2872  anion transporter  38.22 
 
 		 477 aa  301  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675436  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2892  anion transporter  38.22 
 
 		 477 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.151263 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0824  anion transporter  38.22 
 
 		 477 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.595752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0793  anion transporter  38 
 
 		 477 aa  301  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0797  anion transporter  38.22 
 
 		 477 aa  301  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516558  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0874  anion transporter  38 
 
 		 477 aa  300  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2766  anion transporter  37.42 
 
 		 490 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3900  Sodium/sulphate symporter  35.47 
 
 		 501 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3771  anion transporter  36.58 
 
 		 484 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3949  anion transporter  36.71 
 
 		 484 aa  283  7.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0733465  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49439  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  39.28 
 
 		 414 aa  280  4e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.315345  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0370  anion transporter  35.23 
 
 		 484 aa  280  4e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  33.76 
 
 		 475 aa  277  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  33.54 
 
 		 475 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  33.54 
 
 		 475 aa  276  5e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0506  di- and tricarboxylate transporter  34.34 
 
 		 479 aa  276  8e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28272  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  35.37 
 
 		 527 aa  273  5.000000000000001e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.133761  normal  0.927166 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0686  anion transporter  36.15 
 
 		 478 aa  272  9e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2725  anion transporter  35.1 
 
 		 469 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0162733 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1274  anion transporter  34.97 
 
 		 469 aa  270  4e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1092  anion transporter  35.26 
 
 		 501 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4303  anion transporter  35.26 
 
 		 501 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.971581  decreased coverage  0.00704571 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2412  anion transporter  33.56 
 
 		 481 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37045  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  30.87 
 
 		 495 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.011137  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3912  anion transporter  34.16 
 
 		 483 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1050  anion transporter  33.68 
 
 		 501 aa  241  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1726  anion transporter  35.6 
 
 		 506 aa  238  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.980484 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0700  sodium:sulfate symporter family protein  30.82 
 
 		 476 aa  236  6e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00580  citrate:succinate antiporter  30.82 
 
 		 487 aa  236  7e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3013  anion transporter  30.82 
 
 		 487 aa  236  7e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0421609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3032  anion transporter  30.82 
 
 		 487 aa  236  7e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  30.82 
 
 		 487 aa  236  7e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0634  citrate transporter  30.82 
 
 		 487 aa  236  7e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00569  hypothetical protein  30.82 
 
 		 487 aa  236  7e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2559  anion transporter  33.19 
 
 		 502 aa  233  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133462  normal  0.0525533 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0631  sodium:sulfate symporter family protein  30.27 
 
 		 476 aa  232  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0777  sodium:sulfate symporter family protein  29.65 
 
 		 487 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.406229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0658  sodium:sulfate symporter family protein  29.65 
 
 		 487 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0672  sodium:sulfate symporter family protein  30.27 
 
 		 487 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0731  sodium:sulfate symporter family protein  29.45 
 
 		 487 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3165  anion transporter  31.85 
 
 		 487 aa  225  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02933  predicted tartrate:succinate antiporter  30.7 
 
 		 487 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0637  anion transporter  30.7 
 
 		 487 aa  205  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000275084  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4375  anion transporter  30.7 
 
 		 487 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00267264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0636  anion transporter  30.7 
 
 		 487 aa  205  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02883  hypothetical protein  30.7 
 
 		 487 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00124392  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3356  anion transporter  30.7 
 
 		 487 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000525621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3527  anion transporter  30.7 
 
 		 487 aa  205  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412852  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3243  anion transporter  30.28 
 
 		 487 aa  202  7e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  28.78 
 
 		 493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  26.49 
 
 		 491 aa  107  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  27.85 
 
 		 533 aa  95.9  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  22.42 
 
 		 459 aa  91.7  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  27.11 
 
 		 532 aa  90.1  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  21.57 
 
 		 489 aa  89.4  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  26.39 
 
 		 483 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  24.39 
 
 		 514 aa  87  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  28.33 
 
 		 485 aa  86.7  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  26.38 
 
 		 568 aa  86.3  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  26.52 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  25.69 
 
 		 507 aa  84.3  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  30.26 
 
 		 505 aa  83.6  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  24.57 
 
 		 482 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0089  2-oxoglutarate/malate translocator  32.17 
 
 		 116 aa  81.3  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  25.99 
 
 		 517 aa  80.9  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  25.99 
 
 		 517 aa  80.9  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  26.36 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  25.14 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  25.54 
 
 		 518 aa  77.8  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  23.88 
 
 		 486 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  24.14 
 
 		 510 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  25.06 
 
 		 478 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  21.39 
 
 		 470 aa  74.7  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  25.86 
 
 		 489 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0085  anion transporter  42.05 
 
 		 111 aa  72  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  21.49 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  22.58 
 
 		 607 aa  70.5  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  24.78 
 
 		 531 aa  70.1  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  27.76 
 
 		 526 aa  69.3  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  28.87 
 
 		 482 aa  67.4  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>