198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_D6521 on replicon NC_007337
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  100 
 
 		 1448 aa  2949    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  63.09 
 
 		 1495 aa  691    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  99.72 
 
 		 1448 aa  2944    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  84.57 
 
 		 1580 aa  927    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  41.98 
 
 		 986 aa  514  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  75.49 
 
 		 410 aa  483  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0943  DNA primase  44.75 
 
 		 621 aa  449  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  67.68 
 
 		 1077 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0834  TOPRIM domain-containing protein  53.2 
 
 		 357 aa  362  3e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0951  DNA primase  63.05 
 
 		 354 aa  353  1e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.760511  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0235  domain of unknown function DUF1738  40.62 
 
 		 1716 aa  209  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3508  hypothetical protein  51.2 
 
 		 241 aa  204  9e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3267  hypothetical protein  50.72 
 
 		 341 aa  199  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  41.3 
 
 		 321 aa  198  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  39.46 
 
 		 434 aa  197  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2529  hypothetical protein  36.24 
 
 		 384 aa  197  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  37.54 
 
 		 333 aa  194  7e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1304  domain of unknown function DUF1738  39.94 
 
 		 1457 aa  194  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000590213 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  40.2 
 
 		 314 aa  193  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  38.87 
 
 		 311 aa  191  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  40.07 
 
 		 285 aa  191  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1615  DNA primase TraC  39.62 
 
 		 1449 aa  191  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  39.46 
 
 		 332 aa  188  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  39.46 
 
 		 332 aa  188  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  42.12 
 
 		 326 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  39.13 
 
 		 332 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  42.12 
 
 		 326 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  37.66 
 
 		 328 aa  184  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  37.5 
 
 		 326 aa  183  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  38.31 
 
 		 320 aa  182  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  37.84 
 
 		 295 aa  179  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  36.67 
 
 		 315 aa  178  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  37.05 
 
 		 312 aa  176  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  37.87 
 
 		 338 aa  176  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  36.3 
 
 		 319 aa  175  6.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  36.47 
 
 		 318 aa  174  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  33.96 
 
 		 322 aa  172  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  37.07 
 
 		 285 aa  172  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0034  putative DNA replication primase  34.17 
 
 		 682 aa  172  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000123462  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  35.5 
 
 		 323 aa  172  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  35.71 
 
 		 344 aa  171  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  35.31 
 
 		 336 aa  170  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  36.51 
 
 		 312 aa  171  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  36.16 
 
 		 308 aa  171  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  35.39 
 
 		 335 aa  170  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  36.6 
 
 		 304 aa  167  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0057  DNA primase TraC  44.23 
 
 		 1557 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  35.67 
 
 		 317 aa  167  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  35.46 
 
 		 316 aa  167  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  36.54 
 
 		 300 aa  166  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  36.21 
 
 		 312 aa  165  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  35.91 
 
 		 317 aa  165  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  35.87 
 
 		 320 aa  165  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  35.87 
 
 		 320 aa  165  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  36.04 
 
 		 320 aa  165  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  36.45 
 
 		 284 aa  164  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  37.42 
 
 		 288 aa  164  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  36.3 
 
 		 297 aa  164  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  35.93 
 
 		 318 aa  163  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  36.99 
 
 		 294 aa  161  8e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  37.87 
 
 		 313 aa  160  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  36.58 
 
 		 316 aa  159  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  36.64 
 
 		 320 aa  159  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  33.77 
 
 		 321 aa  159  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  35.78 
 
 		 311 aa  158  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  36.11 
 
 		 301 aa  158  7e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  37.25 
 
 		 327 aa  158  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  34.66 
 
 		 316 aa  157  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  35.93 
 
 		 311 aa  157  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  35.97 
 
 		 299 aa  156  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  35.44 
 
 		 322 aa  157  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  34.56 
 
 		 319 aa  155  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  37.75 
 
 		 362 aa  154  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4151  domain of unknown function DUF1738  36.15 
 
 		 296 aa  154  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  35.41 
 
 		 313 aa  153  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  33.76 
 
 		 301 aa  152  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  34.95 
 
 		 300 aa  152  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0049  DNA primase, putative  34.25 
 
 		 1389 aa  147  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0098  DNA primase  33.8 
 
 		 1255 aa  146  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  32.1 
 
 		 308 aa  144  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  34.3 
 
 		 299 aa  144  9e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  32.88 
 
 		 660 aa  144  9e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4588  hypothetical protein  31.88 
 
 		 304 aa  143  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2664  replication primases  34.43 
 
 		 300 aa  142  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2363  domain of unknown function DUF1738  31.63 
 
 		 275 aa  141  8.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  33.56 
 
 		 308 aa  140  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0527  hypothetical protein  37.85 
 
 		 242 aa  140  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.989296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  31.79 
 
 		 299 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0017  cpp22  30.85 
 
 		 408 aa  139  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.113965  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2455  domain of unknown function DUF1738  34.12 
 
 		 280 aa  139  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  unclonable  0.000000000352571 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4322  hypothetical protein  32.24 
 
 		 308 aa  139  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a034  DNA primase TraC  28.92 
 
 		 411 aa  138  7.000000000000001e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000906567  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0639  hypothetical protein  32.07 
 
 		 276 aa  138  9e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2820  hypothetical protein  36.81 
 
 		 275 aa  137  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3504  antirestriction protein-like protein  70 
 
 		 180 aa  135  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.519078  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3038  hypothetical protein  36.05 
 
 		 248 aa  135  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1646  hypothetical protein  38.16 
 
 		 306 aa  134  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  32.03 
 
 		 312 aa  134  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  31.7 
 
 		 310 aa  134  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0806  hypothetical protein  35.95 
 
 		 247 aa  133  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270897  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>