53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_D6454 on replicon NC_007337
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007337  Reut_D6454  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 93 aa  188  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0121069  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2157  addiction module toxin, RelE/StbE family  97.85 
 
 		 93 aa  186  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541282  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4296  addiction module antitoxin  98.92 
 
 		 93 aa  186  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000000263758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1164  addiction module antitoxin  80.65 
 
 		 93 aa  157  4e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3781  hypothetical protein  74.19 
 
 		 93 aa  147  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5117  addiction module antitoxin  73.63 
 
 		 93 aa  143  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3909  addiction module antitoxin  72.04 
 
 		 93 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.342792  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36930  addiction module toxin, RelE/StbE family  69.89 
 
 		 93 aa  136  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4381  addiction module toxin, RelE/StbE family  68.82 
 
 		 93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.554909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3345  addiction module antitoxin  62 
 
 		 100 aa  119  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110991  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2504  addiction module toxin, RelE/StbE family  53.76 
 
 		 93 aa  100  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17080  plasmid stabilization system protein/addiction module toxin  56.47 
 
 		 92 aa  100  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4250  addiction module antitoxin  72.46 
 
 		 101 aa  100  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0906167 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2146  addiction module toxin, RelE/StbE family  72.46 
 
 		 82 aa  100  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2035  hypothetical protein  48.39 
 
 		 93 aa  86.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0970  hypothetical protein  47.25 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000401968  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0547  putative plasmid stabilisation system protein  41.76 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151138  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0505  hypothetical protein  45.56 
 
 		 93 aa  73.9  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1103  hypothetical protein  36.84 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3186  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.3 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1196  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.66 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1713  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.11 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11410  addiction module toxin, RelE/StbE family  46.07 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4998  addiction module antitoxin  42.86 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0831  PZ12b  38.46 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.262689  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0001  addiction module antitoxin  46.67 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000155913  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1376  addiction module toxin, RelE/StbE  39.56 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.13187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0479  addiction module antitoxin  38.37 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.233146  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0253  hypothetical protein  40.22 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0943  addiction module antitoxin  38.46 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015998  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3395  addiction module antitoxin  40.22 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0815  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.26 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3574  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.87 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3768  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.67 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3382  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.13 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0258  hypothetical protein  39.13 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00224  hypothetical protein  39.13 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00220  predicted toxin of the YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  39.13 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3886  hypothetical protein  38.04 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0223  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.96 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.50496  normal  0.992926 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1495  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.52 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1750  hypothetical protein  36.08 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00200719  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0303  hypothetical protein  32.26 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.217401  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1860  addiction module antitoxin  35.16 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.998901  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4838  addiction module antitoxin  37.62 
 
 		 111 aa  52.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2862  addiction module antitoxin  41.94 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1075  hypothetical protein  38.04 
 
 		 90 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3824  hypothetical protein  35.87 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.617883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0841  addiction module toxin, RelE/StbE family  51.16 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.37027  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0997  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.07 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4250  hypothetical protein  37.78 
 
 		 55 aa  43.5  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0508  toxin-antitoxin system, toxin component, RelE family  31.71 
 
 		 91 aa  42  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0213724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1311  plasmid stabilization system protein  29.79 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.648885  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>