80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6398 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 288 aa  594  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2814  hypothetical protein  54.21 
 
 		 289 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0110408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6796  phytanoyl-CoA dioxygenase  49.15 
 
 		 291 aa  291  9e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09246  toxin biosynthesis proten (Fum3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14710)  34.44 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09227  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00230)  34.71 
 
 		 416 aa  138  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2807  hypothetical protein  33.82 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00870169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.97 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.97 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.96 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3154  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.16 
 
 		 302 aa  108  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0588837  normal  0.0946962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5728  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.89 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11097  conserved hypothetical protein  26.37 
 
 		 320 aa  103  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00013392  normal  0.168344 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2677  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.64 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2590  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.15 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.93 
 
 		 315 aa  97.4  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.4 
 
 		 282 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.74 
 
 		 285 aa  93.2  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2527  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.98 
 
 		 292 aa  92.4  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  35.5 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0231349 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2975  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.04 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.988163  normal  0.298504 
 
 
-
 
NC_006686  CND00500  conserved hypothetical protein  27.41 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08106  conserved hypothetical protein  27.24 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386049 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7153  hypothetical protein  34.87 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  26.69 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  32 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.68 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1305  hypothetical protein  25.59 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.64 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5239  hypothetical protein  28.87 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.611643 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.65 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.24 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.25 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2885  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.09 
 
 		 398 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.971655  hitchhiker  0.000000189088 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2769  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.08 
 
 		 395 aa  53.9  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1776  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.6 
 
 		 275 aa  53.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0218629 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3404  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin, putative  25.6 
 
 		 252 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622866 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4205  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.69 
 
 		 404 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.351992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.04 
 
 		 230 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.4 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3564  hypothetical protein  30.89 
 
 		 239 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  25.97 
 
 		 271 aa  50.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1020  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.14 
 
 		 296 aa  50.4  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09254  conserved hypothetical protein  38.67 
 
 		 148 aa  49.7  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0342927 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2406  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.34 
 
 		 398 aa  49.3  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  24.89 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3531  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.91 
 
 		 393 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3038  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.03 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.69 
 
 		 259 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2233  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.97 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2614  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.15 
 
 		 387 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3967  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.24 
 
 		 400 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2171  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.97 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03160  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 433 aa  46.6  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661561  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4033  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.26 
 
 		 396 aa  47  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.94 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.37 
 
 		 239 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  30.7 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1239  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.71 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.424145 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3772  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30 
 
 		 395 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561015  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11532  hypothetical protein  29.51 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.547495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3484  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.55 
 
 		 395 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.660208 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  22.78 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1851  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.4 
 
 		 391 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3795  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.4 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4710  coronamic acid synthetase CmaB  29.91 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25566  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.52 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3328  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.6 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638889 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1813  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 393 aa  43.9  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.864664 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04607  conserved hypothetical protein  39.44 
 
 		 146 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0380015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.84 
 
 		 270 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  23.64 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.13 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2304  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.96 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1428  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.07 
 
 		 382 aa  43.5  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1704  MmcH, putative  24.62 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.408123  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1278  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.34 
 
 		 389 aa  43.5  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0445475  normal  0.279697 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03000  conserved hypothetical protein  25.81 
 
 		 394 aa  43.5  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.472148  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.61 
 
 		 257 aa  42.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  33.33 
 
 		 296 aa  42.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.85 
 
 		 270 aa  42.4  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>