218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6309 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  428  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  65.7 
 
 		 207 aa  278  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  59.22 
 
 		 209 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  57.92 
 
 		 209 aa  237  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  56.59 
 
 		 209 aa  234  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  56.5 
 
 		 202 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  55 
 
 		 207 aa  230  9e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  55 
 
 		 207 aa  229  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  55.22 
 
 		 201 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  55.5 
 
 		 201 aa  225  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  55 
 
 		 201 aa  224  7e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  55.72 
 
 		 209 aa  223  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  55.72 
 
 		 230 aa  222  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  54.5 
 
 		 206 aa  221  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  54 
 
 		 205 aa  221  6e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  54.5 
 
 		 201 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  53.03 
 
 		 206 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  50.5 
 
 		 210 aa  210  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  49.75 
 
 		 205 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  52.5 
 
 		 207 aa  207  9e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  52.85 
 
 		 209 aa  206  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  48.77 
 
 		 205 aa  205  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  48.51 
 
 		 208 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  48.77 
 
 		 205 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  48.53 
 
 		 205 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  49.75 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  48.79 
 
 		 209 aa  198  6e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  49.28 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  48.02 
 
 		 205 aa  194  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  45.63 
 
 		 207 aa  194  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  46.38 
 
 		 209 aa  190  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  48.29 
 
 		 184 aa  187  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  46.15 
 
 		 209 aa  187  9e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  46.15 
 
 		 209 aa  187  9e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  46.15 
 
 		 209 aa  187  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  46.15 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.15 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  46.15 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  46.41 
 
 		 210 aa  186  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  46.83 
 
 		 208 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  47.5 
 
 		 216 aa  185  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  45.81 
 
 		 218 aa  184  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  41.95 
 
 		 208 aa  184  7e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  46.34 
 
 		 208 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  47 
 
 		 203 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  47.57 
 
 		 208 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  45.85 
 
 		 208 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  47.85 
 
 		 221 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  45.37 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  46.12 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  46.12 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  45.63 
 
 		 208 aa  175  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  46.74 
 
 		 202 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  45.32 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3787  hypothetical protein  55.97 
 
 		 140 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  41.03 
 
 		 200 aa  140  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  41.9 
 
 		 203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  39.79 
 
 		 201 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  38.19 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.19 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  38.07 
 
 		 212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  39.78 
 
 		 201 aa  125  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  35.57 
 
 		 201 aa  124  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  36.68 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  36.68 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  38.71 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  40.78 
 
 		 194 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.31 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  40.78 
 
 		 194 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  40.78 
 
 		 194 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  37.17 
 
 		 208 aa  121  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  35.86 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  37.07 
 
 		 201 aa  118  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.82 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  36.7 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  38.83 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  39.34 
 
 		 230 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  39.34 
 
 		 230 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  38.29 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.59 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  35.8 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  33.67 
 
 		 292 aa  99.8  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  37.7 
 
 		 229 aa  99.4  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  36.26 
 
 		 209 aa  99  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  34.01 
 
 		 218 aa  94  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  31.18 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  36.9 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  30.46 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5792  hypothetical protein  32.64 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.926616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  33.94 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  33.7 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.06 
 
 		 206 aa  84.7  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  34.9 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  37.06 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  34.94 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  29.89 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  35.54 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  31.18 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78913  flavoprotein oxygenase  30.95 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.32 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>