275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6287 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6287  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
198 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3534  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50.56 
 
 
194 aa  189  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744175  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2068  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.73 
 
 
198 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2441  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.62 
 
 
206 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.543578  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0122  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.85 
 
 
218 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3540  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.71 
 
 
222 aa  177  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.312737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4162  NAD  49.72 
 
 
203 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48440  putative NAD(P)H dehydrogenase  47.03 
 
 
201 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.54354e-09  normal  0.129613 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3642  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.85 
 
 
198 aa  176  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.335878 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3066  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.46 
 
 
198 aa  175  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0837  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.88 
 
 
199 aa  173  1e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3074  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.46 
 
 
197 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.56 
 
 
197 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.627512  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3388  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.88 
 
 
193 aa  165  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3083  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.76 
 
 
209 aa  128  5e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118928  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0608  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.59 
 
 
194 aa  99.8  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.95 
 
 
193 aa  97.1  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5100  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  33.95 
 
 
193 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4683  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.95 
 
 
193 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000925813  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5061  hypothetical protein  33.33 
 
 
193 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5095  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  33.95 
 
 
193 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0139  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  33.33 
 
 
193 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.277932  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4666  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.72 
 
 
193 aa  95.1  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5101  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  33.33 
 
 
193 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19550  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  33.33 
 
 
265 aa  94.4  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154769  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5191  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  32.72 
 
 
193 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4826  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  32.72 
 
 
193 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109009  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.67 
 
 
244 aa  93.2  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3331  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  32.32 
 
 
191 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3697  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.59 
 
 
197 aa  90.5  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  0.563531 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3358  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30.81 
 
 
191 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1125  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  31.76 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3112  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30.81 
 
 
191 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460138  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4047  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.1 
 
 
256 aa  89  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00915897 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3453  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.12 
 
 
192 aa  88.2  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  4.56035e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2777  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.23 
 
 
184 aa  88.2  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3317  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30.61 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3499  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.13 
 
 
196 aa  87  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1917  NAD(P)H dehydrogenase quinone family protein  30.1 
 
 
198 aa  86.3  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048206  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3099  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.81 
 
 
191 aa  85.5  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.426933  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4164  quinone reductase  29.9 
 
 
259 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.477196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3330  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  30.81 
 
 
191 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4550  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.73 
 
 
197 aa  85.9  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.617173  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3002  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30.81 
 
 
191 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0168994  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1088  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.37 
 
 
261 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4986  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  31.77 
 
 
222 aa  84.7  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.354623 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2859  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.43 
 
 
290 aa  84.3  1e-15  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3310  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  33.63 
 
 
191 aa  84  1e-15  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0066019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1921  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  33.63 
 
 
191 aa  84.3  1e-15  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.63 
 
 
191 aa  83.6  2e-15  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.700131  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0321  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.35 
 
 
206 aa  83.2  2e-15  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0573  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  25.64 
 
 
206 aa  83.2  2e-15  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7957  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.21 
 
 
195 aa  82.4  4e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.507514  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2434  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.24 
 
 
247 aa  82  5e-15  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00256261  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0657  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.75 
 
 
196 aa  82  6e-15  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4553  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.54 
 
 
218 aa  81.6  8e-15  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4963  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  29.84 
 
 
259 aa  81.3  1e-14  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1767  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  33.93 
 
 
189 aa  80.9  1e-14  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1308  putative NAD(P)H oxidoreductase(quinone)  30 
 
 
213 aa  80.9  1e-14  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0705  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40 
 
 
195 aa  80.5  1e-14  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2561  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.77 
 
 
259 aa  80.9  1e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1267  putative NAD(P)H dehydrogenase (quinone) protein  34.69 
 
 
194 aa  79.3  4e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2368  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.65 
 
 
232 aa  78.2  7e-14  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1404  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.91 
 
 
259 aa  78.2  8e-14  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.411972 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17880  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  30.85 
 
 
264 aa  77.8  9e-14  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.615091  normal  0.443705 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1362  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  30.49 
 
 
259 aa  77.4  1e-13  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0148022  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2450  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.43 
 
 
199 aa  77.4  1e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.298237  normal  0.966087 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1407  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  31.41 
 
 
265 aa  77  2e-13  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.458712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4131  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.25 
 
 
259 aa  76.6  2e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5496  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.32 
 
 
261 aa  77  2e-13  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.993327 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2332  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.27 
 
 
262 aa  76.6  2e-13  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3642  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  29.32 
 
 
261 aa  75.9  3e-13  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750916  normal  0.729686 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1476  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.19 
 
 
193 aa  76.3  3e-13  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3208  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.25 
 
 
272 aa  76.3  3e-13  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.485932 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3275  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.07 
 
 
204 aa  76.3  3e-13  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1379  quinone dependent NADH dehydrogenase  38.53 
 
 
195 aa  76.3  3e-13  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144954  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04777  NAD(P)H quinone oxidoreductase  27.15 
 
 
222 aa  75.9  3e-13  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1673  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.84 
 
 
193 aa  75.9  4e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  8.46124e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0823  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.84 
 
 
266 aa  75.1  7e-13  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2429  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.72 
 
 
255 aa  74.7  8e-13  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.391574 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1711  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  29.32 
 
 
263 aa  74.7  9e-13  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3342  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.86 
 
 
230 aa  74.3  9e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.241608  normal  0.325854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3119  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.94 
 
 
197 aa  73.9  1e-12  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.415856  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65760  NAD(P)H quinone oxidoreductase  32.26 
 
 
234 aa  73.9  1e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299621  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2320  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.47 
 
 
198 aa  74.3  1e-12  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304506  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3177  hypothetical protein  28.95 
 
 
203 aa  73.9  1e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3056  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.36 
 
 
194 aa  73.6  2e-12  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3256  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.27 
 
 
194 aa  73.6  2e-12  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144602  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3569  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.32 
 
 
270 aa  73.9  2e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.178217 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0353  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  28.8 
 
 
258 aa  73.2  2e-12  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4017  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  28.87 
 
 
258 aa  73.2  2e-12  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117199  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0979  hypothetical protein  30.82 
 
 
196 aa  73.2  2e-12  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.58351  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3903  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  28.87 
 
 
258 aa  73.2  2e-12  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.96153 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4668  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.84 
 
 
193 aa  73.2  2e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2166  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  28.8 
 
 
258 aa  73.2  3e-12  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.7083  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0261  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  28.8 
 
 
258 aa  73.2  3e-12  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254456  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2695  hypothetical protein  30.82 
 
 
196 aa  72.8  3e-12  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.59295  normal  0.489101 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1893  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  28.8 
 
 
258 aa  73.2  3e-12  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.58124  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20800  NAD(P)H quinone oxidoreductase  28.79 
 
 
265 aa  72.8  3e-12  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689455  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4596  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.23 
 
 
259 aa  72.8  3e-12  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>