More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C5977 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C5977  ThiJ/PfpI  100 
 
 
228 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  47.53 
 
 
233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  44.02 
 
 
231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  40.09 
 
 
228 aa  194  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  40.09 
 
 
228 aa  194  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  42.6 
 
 
228 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  47.98 
 
 
227 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.98 
 
 
227 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.98 
 
 
227 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4230  hypothetical protein  40.71 
 
 
232 aa  178  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2555  twin-arginine translocation pathway signal  43.94 
 
 
285 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  42.79 
 
 
234 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.66 
 
 
224 aa  176  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  45.27 
 
 
224 aa  175  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  46.08 
 
 
242 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.53 
 
 
242 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  41.33 
 
 
242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2887  ThiJ/PfpI  44.95 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00139108  normal  0.0511878 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  41.33 
 
 
232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  41.33 
 
 
232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  41.33 
 
 
691 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  41.33 
 
 
242 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  40.89 
 
 
232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  40.89 
 
 
242 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4368  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.08 
 
 
276 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2579  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.11 
 
 
227 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.17 
 
 
225 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2705  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.67 
 
 
227 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4332  ThiJ/PfpI  43.86 
 
 
239 aa  168  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  41.84 
 
 
229 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  42.99 
 
 
238 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  44.5 
 
 
229 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4315  ThiJ/PfpI domain protein  45.73 
 
 
232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.99 
 
 
234 aa  164  9e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  42.99 
 
 
234 aa  164  9e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.28 
 
 
225 aa  164  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  40.83 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2643  ThiJ family protein  38.01 
 
 
241 aa  162  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2847  ThiJ/PfpI family protein  39.81 
 
 
276 aa  161  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00201065  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  43.96 
 
 
261 aa  161  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  39.09 
 
 
225 aa  161  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  39.17 
 
 
220 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.11 
 
 
227 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5986  ThiJ/PfpI family protein  44.49 
 
 
227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0549226 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.62 
 
 
230 aa  155  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0965747 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.73 
 
 
234 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.73 
 
 
234 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3391  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.18 
 
 
262 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694944  normal  0.106605 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.75 
 
 
231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4131  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.5 
 
 
277 aa  152  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1474  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.93 
 
 
232 aa  151  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.5 
 
 
239 aa  150  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  44.04 
 
 
232 aa  149  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  40.7 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  40.7 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.5 
 
 
231 aa  142  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  39.61 
 
 
243 aa  141  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1672  ThiJ/PfpI domain protein  42.57 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.875327 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6949  ThiJ/PfpI family protein  36.53 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0470534  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2005  isonitrile hydratase, putative  42.57 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.88 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  39 
 
 
212 aa  138  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0050  ThiJ/PfpI domain protein  39.22 
 
 
279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.36 
 
 
232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2391  ThiJ/PfpI domain protein  47.24 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.86 
 
 
246 aa  129  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4536  DJ-1/PfpI family protein  40.48 
 
 
261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  40.51 
 
 
233 aa  128  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.84 
 
 
245 aa  121  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  36.84 
 
 
245 aa  121  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.84 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2879  ThiJ/PfpI  40.24 
 
 
201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2244  ThiJ/PfpI domain protein  38.39 
 
 
222 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121957  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.38 
 
 
231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4265  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.83 
 
 
251 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130601  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0161  ThiJ/PfpI domain protein  37.56 
 
 
214 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0374821  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1653  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.39 
 
 
240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.86 
 
 
284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.492617 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6260  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.86 
 
 
284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7236  ThiJ/PfpI family protein  33.33 
 
 
326 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0671264 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4724  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
284 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 
284 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043204  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5955  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 
284 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0469  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.5 
 
 
226 aa  104  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  34.72 
 
 
297 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10051  hypothetical protein  45.52 
 
 
187 aa  102  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 
209 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.65 
 
 
210 aa  98.6  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.09 
 
 
233 aa  96.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.16 
 
 
207 aa  95.9  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2559  ThiJ/PfpI  48.82 
 
 
148 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0761  DJ-1/PfpI family protein  35.85 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1771  DJ-1/PfpI family protein  35.85 
 
 
232 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2029  putative isonitrile hydratase  35.85 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  32.14 
 
 
198 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0688  putative isonitrile hydratase  35.85 
 
 
246 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1054  DJ-1/PfpI family protein  35.85 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  25.64 
 
 
202 aa  90.1  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0777  putative isonitrile hydratase  35.85 
 
 
246 aa  89.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  26.74 
 
 
241 aa  88.6  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>