More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C5947 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  437  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  50.95 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 231 aa  185  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 251 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  41.83 
 
 		 222 aa  147  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 222 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 242 aa  142  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  40.19 
 
 		 228 aa  141  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  40.19 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 222 aa  141  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 227 aa  141  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 223 aa  141  9e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 239 aa  141  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  40.67 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  36.45 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  35.96 
 
 		 216 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  39.41 
 
 		 237 aa  138  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 226 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  40.87 
 
 		 221 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  36.45 
 
 		 216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2908  GntR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 217 aa  134  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 240 aa  132  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  39.22 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  40.49 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  37.25 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  39.22 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 248 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  37.68 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  36.59 
 
 		 227 aa  125  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  35.86 
 
 		 219 aa  121  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 248 aa  121  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  37.13 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3723  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.504621 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1381  transcriptional regulator, GntR family  39.22 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  35.05 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  35.41 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6458  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 216 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.135131 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  37.14 
 
 		 231 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 246 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 254 aa  104  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 227 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4792  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.815698  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  31.31 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 239 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 211 aa  101  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 230 aa  101  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4473  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.729614 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0520  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.656964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.08 
 
 		 228 aa  99.4  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  35.35 
 
 		 233 aa  99  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 222 aa  99  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  35.1 
 
 		 223 aa  98.6  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 223 aa  98.6  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  37.57 
 
 		 234 aa  98.2  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 234 aa  98.2  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 235 aa  97.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 233 aa  97.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2915  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 		 274 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 231 aa  97.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 225 aa  96.3  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 227 aa  96.3  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 229 aa  95.5  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 232 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 229 aa  95.5  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 232 aa  94.7  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 225 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  29.7 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 237 aa  92.8  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 241 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 263 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  30.81 
 
 		 263 aa  92  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 231 aa  92  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>