More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C5895 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  646  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  60.53 
 
 
325 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  47.81 
 
 
329 aa  310  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  50.17 
 
 
339 aa  297  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  49.03 
 
 
346 aa  296  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  48.87 
 
 
328 aa  292  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  47.1 
 
 
328 aa  290  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  47.1 
 
 
328 aa  289  4e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  45.74 
 
 
332 aa  285  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  48.49 
 
 
339 aa  281  9e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  46.49 
 
 
330 aa  281  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  46.49 
 
 
330 aa  281  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  47.14 
 
 
355 aa  279  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  45.97 
 
 
330 aa  278  9e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  46.26 
 
 
324 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  45.89 
 
 
323 aa  277  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  46.49 
 
 
358 aa  276  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  46.15 
 
 
331 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  45.97 
 
 
327 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  45.95 
 
 
322 aa  276  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  45.64 
 
 
330 aa  276  5e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  45.86 
 
 
328 aa  275  1e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  46.76 
 
 
353 aa  274  2e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  45.82 
 
 
328 aa  272  4e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  45.18 
 
 
336 aa  272  5e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  46.76 
 
 
339 aa  272  6e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  46.2 
 
 
333 aa  271  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  45.7 
 
 
327 aa  270  3e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  46.6 
 
 
328 aa  269  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  48 
 
 
330 aa  269  6e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  43.5 
 
 
337 aa  268  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  44.18 
 
 
349 aa  268  8e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  43.39 
 
 
327 aa  268  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  45.37 
 
 
326 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  43.03 
 
 
344 aa  266  3e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  45.98 
 
 
325 aa  265  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  44.63 
 
 
330 aa  265  8e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  45.42 
 
 
328 aa  265  8e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  45.12 
 
 
325 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  45.48 
 
 
335 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  44.82 
 
 
324 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  44.82 
 
 
344 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  43 
 
 
343 aa  262  5e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  46.6 
 
 
323 aa  262  5e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  43.05 
 
 
325 aa  261  9e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  43.05 
 
 
327 aa  261  9e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  41.27 
 
 
324 aa  261  9e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  44.63 
 
 
333 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  43.22 
 
 
335 aa  261  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  43.57 
 
 
328 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  45.4 
 
 
326 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  40.57 
 
 
330 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  43.77 
 
 
328 aa  259  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  43.03 
 
 
331 aa  259  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  45 
 
 
328 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  42.81 
 
 
326 aa  257  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  41.75 
 
 
310 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.49 
 
 
328 aa  256  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  41.9 
 
 
336 aa  256  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  40.72 
 
 
325 aa  255  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  40.73 
 
 
304 aa  255  7e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  44.3 
 
 
330 aa  255  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  43.39 
 
 
322 aa  255  9e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  43.73 
 
 
323 aa  254  1e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  41.28 
 
 
332 aa  254  1e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  44.78 
 
 
326 aa  254  1e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  45.17 
 
 
334 aa  254  2e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  44 
 
 
360 aa  254  2e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  42.86 
 
 
334 aa  254  2e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  40.47 
 
 
326 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  44.41 
 
 
339 aa  252  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  43.62 
 
 
314 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  42.03 
 
 
330 aa  252  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  42.95 
 
 
324 aa  251  8e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  41.28 
 
 
338 aa  252  8e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  42.86 
 
 
336 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  41.51 
 
 
321 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  40.97 
 
 
331 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  40.97 
 
 
331 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  42.95 
 
 
332 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  40.19 
 
 
343 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  42.37 
 
 
321 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  43.67 
 
 
345 aa  249  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  43.67 
 
 
345 aa  249  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  40.97 
 
 
337 aa  249  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  42.01 
 
 
327 aa  248  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  41.69 
 
 
314 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  42.37 
 
 
336 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  42.47 
 
 
335 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  40.73 
 
 
326 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  43.17 
 
 
323 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  41.42 
 
 
328 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.37 
 
 
327 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  40.13 
 
 
335 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  41.31 
 
 
331 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  44.9 
 
 
322 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  40.63 
 
 
332 aa  246  5e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  37.65 
 
 
356 aa  245  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1400  hypothetical protein  40.98 
 
 
337 aa  245  7e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  39.09 
 
 
332 aa  245  7e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.914226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>