More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5870 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
463 aa  944    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  66.59 
 
 
491 aa  635    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  66.38 
 
 
462 aa  635    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  66.81 
 
 
462 aa  640    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  67.03 
 
 
521 aa  640    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  67.53 
 
 
462 aa  640    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  66.23 
 
 
462 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  65.92 
 
 
462 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  63.31 
 
 
463 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  63.76 
 
 
463 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  63.76 
 
 
463 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  63.09 
 
 
463 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  62.95 
 
 
465 aa  549  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  61.83 
 
 
465 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  60.49 
 
 
463 aa  535  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3223  FAD dependent oxidoreductase  60.18 
 
 
465 aa  514  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188463  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  53.58 
 
 
466 aa  481  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  53.58 
 
 
466 aa  475  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  44.2 
 
 
466 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  42.58 
 
 
486 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  40.58 
 
 
470 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  39.96 
 
 
473 aa  288  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0634  FAD dependent oxidoreductase  34.92 
 
 
476 aa  257  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3646  hypothetical protein  38.48 
 
 
469 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0271589 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 
454 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  34.86 
 
 
496 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  33.77 
 
 
482 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 
472 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  33.48 
 
 
473 aa  176  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  33.04 
 
 
480 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 
460 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 
465 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 
460 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 
456 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 
456 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  30.84 
 
 
466 aa  170  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 
466 aa  169  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 
456 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 
433 aa  169  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  29.09 
 
 
464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 
463 aa  167  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 
463 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 
483 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  32.16 
 
 
464 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  32.52 
 
 
475 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 
462 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 
457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  29.7 
 
 
473 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 
453 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  30.82 
 
 
472 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  32.47 
 
 
434 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  32.09 
 
 
480 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  31.11 
 
 
482 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  30.86 
 
 
460 aa  160  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 
472 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 
460 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 
460 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 
462 aa  157  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 
474 aa  156  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  31.26 
 
 
476 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  28.28 
 
 
465 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  28.07 
 
 
427 aa  155  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 
475 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 
464 aa  155  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 
439 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 
425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 
434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 
468 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 
466 aa  153  8e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 
459 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 
470 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 
486 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 
443 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 
427 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 
457 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 
460 aa  151  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 
462 aa  151  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 
468 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 
468 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 
468 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 
434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 
434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  28.89 
 
 
428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 
427 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 
430 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 
427 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2808  oxidoreductase, putative  27.86 
 
 
455 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479983  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 
449 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 
434 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 
433 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  30.03 
 
 
431 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 
431 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  29.61 
 
 
468 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  30.4 
 
 
439 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  28.76 
 
 
427 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  28.43 
 
 
440 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  28.76 
 
 
427 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  30.21 
 
 
468 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  30.21 
 
 
468 aa  144  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>