More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5857 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  100 
 
 
230 aa  461  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  85.9 
 
 
234 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0222  ABC transporter related  83.7 
 
 
232 aa  363  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0284  ABC transporter related  84.14 
 
 
232 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  hitchhiker  3.95766e-06 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3402  ABC efflux pump, ATPase subunit  84.58 
 
 
232 aa  362  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0029159  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0303  ABC transporter related  83.7 
 
 
232 aa  362  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0537962  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0230  ABC transporter related  83.26 
 
 
232 aa  362  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  2.98e-07 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2803  ABC transporter related  83.26 
 
 
232 aa  361  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0893633  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  82.38 
 
 
235 aa  361  6e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0206  ABC transporter related  84.14 
 
 
232 aa  349  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  unclonable  7.713e-12 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  70.67 
 
 
231 aa  330  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  69.33 
 
 
231 aa  327  1e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  71.82 
 
 
228 aa  326  2e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  70.78 
 
 
231 aa  322  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  69.09 
 
 
229 aa  318  6e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  69.55 
 
 
229 aa  316  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  71.69 
 
 
230 aa  315  3e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  65.45 
 
 
235 aa  296  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  64.41 
 
 
268 aa  286  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  61.82 
 
 
240 aa  283  2e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  60.73 
 
 
229 aa  281  5e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  58.9 
 
 
229 aa  268  5e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  55.45 
 
 
235 aa  265  4e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  58.45 
 
 
232 aa  265  6e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  56.11 
 
 
231 aa  263  1e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  56.02 
 
 
225 aa  259  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2260  ABC transporter related  55.56 
 
 
232 aa  259  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549292  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1620  ABC transporter, ATPase subunit  54.67 
 
 
241 aa  253  2e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2582  ABC transporter related  55.86 
 
 
234 aa  251  8e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  51.82 
 
 
239 aa  226  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  49.32 
 
 
242 aa  223  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  46.36 
 
 
237 aa  219  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  46.15 
 
 
230 aa  218  5e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  48.85 
 
 
221 aa  218  6e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 
222 aa  218  9e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  49.07 
 
 
228 aa  217  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  46.12 
 
 
220 aa  217  1e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  46.67 
 
 
240 aa  217  2e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  49.3 
 
 
226 aa  215  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  49.3 
 
 
226 aa  214  6e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  49.3 
 
 
226 aa  214  6e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  48.21 
 
 
288 aa  215  6e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  49.3 
 
 
226 aa  214  6e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  49.3 
 
 
226 aa  214  6e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  49.3 
 
 
226 aa  214  6e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 
226 aa  214  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  49.3 
 
 
226 aa  214  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  47.09 
 
 
235 aa  214  1e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  44.44 
 
 
239 aa  213  2e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  48.83 
 
 
226 aa  213  2e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  47 
 
 
229 aa  213  2e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  45.91 
 
 
248 aa  213  3e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  47.75 
 
 
237 aa  213  3e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  45.91 
 
 
230 aa  212  4e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  46.4 
 
 
266 aa  212  4e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  48.42 
 
 
249 aa  211  6e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  44.44 
 
 
232 aa  211  6e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  46.15 
 
 
240 aa  211  7e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0367  ABC transporter related  48.02 
 
 
244 aa  211  7e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  47.53 
 
 
241 aa  211  8e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  44.75 
 
 
246 aa  211  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  48.83 
 
 
226 aa  210  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  47.03 
 
 
226 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  48.42 
 
 
258 aa  210  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37949e-10 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  46.82 
 
 
229 aa  209  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  44.75 
 
 
226 aa  210  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  47.87 
 
 
241 aa  209  4e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  46.15 
 
 
255 aa  209  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  44.7 
 
 
228 aa  208  5e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  47.3 
 
 
246 aa  208  6e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  47.89 
 
 
226 aa  208  6e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  45.7 
 
 
244 aa  207  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  45.61 
 
 
653 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  45.05 
 
 
233 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  43.72 
 
 
235 aa  207  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1291  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  45.45 
 
 
235 aa  206  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.286185 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  46.33 
 
 
240 aa  206  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  3.60668e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  45.5 
 
 
252 aa  206  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  47.71 
 
 
291 aa  206  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  45.74 
 
 
237 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  44.55 
 
 
230 aa  206  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  4.35089e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  45.54 
 
 
230 aa  206  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2391  ABC transporter related  48.62 
 
 
253 aa  206  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  43.44 
 
 
224 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  45.22 
 
 
644 aa  206  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  45.74 
 
 
237 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  46.61 
 
 
255 aa  206  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  44.8 
 
 
238 aa  205  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 
224 aa  205  5e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 
224 aa  205  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 
224 aa  205  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  45.29 
 
 
240 aa  205  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  43.44 
 
 
224 aa  205  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 
224 aa  205  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  45 
 
 
239 aa  204  7e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  42.73 
 
 
225 aa  204  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  41.1 
 
 
293 aa  204  7e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2724  ABC transporter related  43.44 
 
 
252 aa  204  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2781  ABC transporter related  43.44 
 
 
252 aa  204  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  43.84 
 
 
232 aa  204  9e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>