More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5849 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  660    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  79.45 
 
 
325 aa  526  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  51.82 
 
 
333 aa  330  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  52.88 
 
 
330 aa  318  7e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  52.88 
 
 
330 aa  318  9e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  54.67 
 
 
325 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  47.38 
 
 
333 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  53.4 
 
 
339 aa  316  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  53.24 
 
 
339 aa  315  6e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  50.17 
 
 
328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0125  hypothetical protein  51.67 
 
 
331 aa  313  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  49.09 
 
 
331 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  50.31 
 
 
328 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  52.82 
 
 
333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  50.46 
 
 
328 aa  312  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  49.83 
 
 
328 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  50.17 
 
 
330 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  47.04 
 
 
327 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  48.73 
 
 
327 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  52.15 
 
 
345 aa  309  5e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  49.84 
 
 
328 aa  309  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  52.15 
 
 
345 aa  309  5e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  47.81 
 
 
330 aa  308  5.9999999999999995e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  47.81 
 
 
330 aa  308  5.9999999999999995e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  53.74 
 
 
328 aa  308  8e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  47.6 
 
 
336 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  50.65 
 
 
339 aa  306  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  51.64 
 
 
324 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  48.06 
 
 
314 aa  302  5.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  50 
 
 
331 aa  302  6.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  49.49 
 
 
327 aa  301  9e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  48.95 
 
 
331 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  50 
 
 
328 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  46.57 
 
 
344 aa  299  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  46.92 
 
 
349 aa  297  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  48.3 
 
 
332 aa  296  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  45.4 
 
 
327 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  49.5 
 
 
360 aa  296  4e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  45.26 
 
 
334 aa  295  5e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  50.78 
 
 
335 aa  295  6e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  47.35 
 
 
328 aa  295  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  45.12 
 
 
344 aa  293  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  45.76 
 
 
335 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  47.21 
 
 
325 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  47.53 
 
 
336 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  46.6 
 
 
327 aa  290  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  46.6 
 
 
325 aa  290  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  47.18 
 
 
337 aa  289  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  47.12 
 
 
335 aa  289  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  50.62 
 
 
334 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  45.45 
 
 
325 aa  288  6e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  43.11 
 
 
336 aa  289  6e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  49.16 
 
 
324 aa  288  9e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  51.16 
 
 
335 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  49.15 
 
 
332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  46.98 
 
 
320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  47.97 
 
 
324 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  43.79 
 
 
322 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0621  hypothetical protein  46.67 
 
 
357 aa  285  9e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  46 
 
 
331 aa  285  9e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  46.5 
 
 
332 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  46.5 
 
 
322 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  45.71 
 
 
358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  46.15 
 
 
349 aa  283  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  46.89 
 
 
335 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  49.83 
 
 
327 aa  282  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  47.16 
 
 
332 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  48.84 
 
 
386 aa  282  7.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  48.26 
 
 
328 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  47.16 
 
 
334 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  45.08 
 
 
330 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  46.6 
 
 
339 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  45.22 
 
 
326 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  45.08 
 
 
356 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  47.65 
 
 
339 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  46.71 
 
 
333 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  45.15 
 
 
330 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  47.97 
 
 
326 aa  279  4e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  46.56 
 
 
324 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  46.76 
 
 
327 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  44.65 
 
 
326 aa  279  5e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  46.82 
 
 
339 aa  278  7e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  45.68 
 
 
323 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  42.64 
 
 
334 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  46.18 
 
 
304 aa  277  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  47.23 
 
 
331 aa  277  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  45.68 
 
 
330 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  46.08 
 
 
321 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  42.72 
 
 
331 aa  276  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  46.36 
 
 
330 aa  276  4e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  42.72 
 
 
331 aa  276  4e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  46.36 
 
 
330 aa  276  4e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  46.31 
 
 
334 aa  276  5e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  46.15 
 
 
326 aa  275  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  47.3 
 
 
339 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  43.48 
 
 
331 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  50.34 
 
 
323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  45.48 
 
 
334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  49.32 
 
 
328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  43.89 
 
 
325 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>