More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5649 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  100 
 
 
400 aa  763    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  63.13 
 
 
398 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  64.02 
 
 
398 aa  448  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  61.81 
 
 
395 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  61.18 
 
 
405 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  59.09 
 
 
405 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  62.74 
 
 
405 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  59.09 
 
 
405 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  62.04 
 
 
405 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  61.32 
 
 
404 aa  425  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  59.09 
 
 
405 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  61.68 
 
 
404 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  62.68 
 
 
388 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  59.56 
 
 
400 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  59.56 
 
 
400 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  59.29 
 
 
400 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  60.89 
 
 
399 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  60.45 
 
 
399 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  59.69 
 
 
401 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  60.2 
 
 
399 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2449  major facilitator transporter  60.89 
 
 
399 aa  361  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  61.46 
 
 
402 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  48.14 
 
 
393 aa  326  6e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  50.56 
 
 
401 aa  296  6e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  48.53 
 
 
402 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  47.44 
 
 
398 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  44.32 
 
 
396 aa  280  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  42.78 
 
 
389 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  42.78 
 
 
389 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  43.92 
 
 
405 aa  275  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  45.06 
 
 
407 aa  273  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  48.66 
 
 
402 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  45.2 
 
 
406 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  47.24 
 
 
413 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  45.23 
 
 
447 aa  248  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  39.36 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  45.95 
 
 
408 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  41.22 
 
 
399 aa  240  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  47.88 
 
 
409 aa  238  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5771  major facilitator superfamily MFS_1  46.89 
 
 
413 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.926843 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  41.36 
 
 
399 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  41.36 
 
 
399 aa  232  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  41.36 
 
 
399 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  39.44 
 
 
399 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  39.19 
 
 
399 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  40.93 
 
 
416 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  36.57 
 
 
392 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  39.19 
 
 
399 aa  223  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  33.16 
 
 
406 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  33.16 
 
 
406 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  39.89 
 
 
385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  33.16 
 
 
403 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2326  major facilitator transporter  41.53 
 
 
425 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  39.85 
 
 
399 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  41.79 
 
 
406 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  41.74 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  39.95 
 
 
400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  40.11 
 
 
395 aa  213  5.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  42.48 
 
 
406 aa  213  5.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  41.07 
 
 
394 aa  212  9e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  38.28 
 
 
383 aa  211  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  39.3 
 
 
397 aa  210  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  42.32 
 
 
399 aa  210  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  40.88 
 
 
404 aa  209  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  40.38 
 
 
389 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1598  major facilitator transporter  36.15 
 
 
403 aa  206  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.665811  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  39.63 
 
 
394 aa  206  9e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  39.9 
 
 
394 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  39.9 
 
 
394 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  39.9 
 
 
394 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  39.9 
 
 
394 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  41.93 
 
 
399 aa  203  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  38.25 
 
 
410 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  41.07 
 
 
394 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  40.8 
 
 
394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  39.9 
 
 
394 aa  201  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  40.8 
 
 
394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  40.8 
 
 
394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  40.69 
 
 
394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  39.36 
 
 
403 aa  199  7e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  37.15 
 
 
426 aa  199  9e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2698  major facilitator transporter  41.27 
 
 
391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.746968  normal  0.820419 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  37.84 
 
 
394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  39.74 
 
 
389 aa  197  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  40.1 
 
 
399 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3120  major facilitator family transporter  40.6 
 
 
422 aa  196  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00127728  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  39.69 
 
 
415 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  38.38 
 
 
394 aa  196  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  37.4 
 
 
401 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  39.62 
 
 
433 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  37.78 
 
 
387 aa  194  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  40.96 
 
 
399 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  41.77 
 
 
399 aa  193  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  40.96 
 
 
405 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  37.84 
 
 
394 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  40.69 
 
 
399 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  40.69 
 
 
399 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  40.69 
 
 
399 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  39.66 
 
 
415 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  40.69 
 
 
399 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>