More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5648 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5648  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 304 aa  608  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5829  LysR family transcriptional regulator  57.29 
 
 		 301 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5612  LysR family transcriptional regulator  57.29 
 
 		 301 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0432905  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7013  LysR family transcriptional regulator  56.08 
 
 		 301 aa  341  9e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6347  LysR family transcriptional regulator  56.08 
 
 		 301 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.264946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1482  LysR family transcriptional regulator  56.08 
 
 		 301 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2478  LysR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 299 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.695229 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3567  LysR family transcriptional regulator  59.8 
 
 		 301 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.346329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2207  LysR family transcriptional regulator  59.46 
 
 		 301 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2450  LysR family transcriptional regulator  53.92 
 
 		 305 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2354  LysR family transcriptional regulator  58.45 
 
 		 301 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.373464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03790  Transcriptional regulator, LysR family  55.7 
 
 		 301 aa  324  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0797  LysR family transcriptional regulator  46.76 
 
 		 308 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.433602  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4949  LysR family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 308 aa  295  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.58153 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  48.31 
 
 		 309 aa  286  4e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0593  LysR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 303 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0686  LysR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 303 aa  275  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.866247  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1984  LysR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 303 aa  275  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5499  transcriptional regulator, LysR family  45.64 
 
 		 306 aa  265  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0853142 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2390  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 323 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5764  LysR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 316 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4581  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  40.27 
 
 		 293 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  37.29 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  37.2 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0554  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 301 aa  199  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0255315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  35.03 
 
 		 302 aa  198  9e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  36.51 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1439  transcriptional regulator, LysR family  38.78 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.267648  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2711  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 292 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5843  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 294 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6079  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 294 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.929985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 305 aa  195  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2961  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3236  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0163272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2043  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 310 aa  192  8e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 294 aa  192  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2289  transcriptional regulator, LysR family  37.07 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0824  LysR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2663  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 328 aa  189  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  36.49 
 
 		 289 aa  189  7e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23700  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 303 aa  188  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0115342 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1971  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 355 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4923  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.64 
 
 		 300 aa  188  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1499  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 		 296 aa  187  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456019 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2719  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3767  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  40.32 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  40.32 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1434  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 301 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325668  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1061  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 301 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20810  transcriptional regulator, LysR family  36.55 
 
 		 305 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2250  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3456  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 340 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.695325 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3963  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 324 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2690  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 295 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 294 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2712  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2449  transcriptional regulator, LysR family  35.47 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00856544  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2661  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.583907  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3459  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2409  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.687274  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3902  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4063  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2132  transcriptional regulator, LysR family  33.55 
 
 		 298 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6395  LysR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.158228 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2050  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4303  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  35.59 
 
 		 335 aa  183  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2586  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6067  transcriptional regulator, LysR family  36.39 
 
 		 294 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  36.46 
 
 		 295 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2175  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 292 aa  182  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6129  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 305 aa  182  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3612  transcriptional regulator, LysR family  35.54 
 
 		 307 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.155028 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1939  transcriptional regulator, LysR family  35.09 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.775483 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5886  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.437235  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31630  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.469253  normal  0.129426 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5522  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0758082  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1785  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31030  Transcriptional regulator, LysR family  34.13 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2248  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 320 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.462301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  36.39 
 
 		 301 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 289 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3620  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 291 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>