198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5583 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  100 
 
 		 1020 aa  1964    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  55.34 
 
 		 1017 aa  849    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  39.44 
 
 		 1020 aa  547  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  37.15 
 
 		 1018 aa  499  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  35.62 
 
 		 1018 aa  499  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  34.84 
 
 		 1018 aa  495  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  35.38 
 
 		 1018 aa  489  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  33.65 
 
 		 1018 aa  477  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  35.26 
 
 		 1020 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  32.98 
 
 		 1018 aa  458  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  34.42 
 
 		 1018 aa  443  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  34.5 
 
 		 1018 aa  445  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  35.05 
 
 		 1018 aa  446  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  34.43 
 
 		 1018 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  34.3 
 
 		 1018 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  34.34 
 
 		 1018 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  34.43 
 
 		 1018 aa  443  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  34.63 
 
 		 1018 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  29.3 
 
 		 1049 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  27.58 
 
 		 1029 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  27.92 
 
 		 1029 aa  375  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  27.81 
 
 		 1029 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  27.65 
 
 		 1029 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  27.97 
 
 		 1029 aa  369  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  26.3 
 
 		 1039 aa  369  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  27.43 
 
 		 1029 aa  366  1e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  27.43 
 
 		 1029 aa  366  1e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  26.96 
 
 		 1029 aa  365  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  27.43 
 
 		 1029 aa  365  3e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  27.33 
 
 		 1029 aa  364  4e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  27.33 
 
 		 1029 aa  364  4e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  31.72 
 
 		 1024 aa  328  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  22.17 
 
 		 1009 aa  271  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  24.21 
 
 		 1011 aa  248  3e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  48.85 
 
 		 1013 aa  240  9e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  53.23 
 
 		 1018 aa  207  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  29.41 
 
 		 906 aa  197  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  45.59 
 
 		 881 aa  189  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  26.65 
 
 		 1088 aa  189  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  49.47 
 
 		 953 aa  187  7e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  28.5 
 
 		 1030 aa  185  4.0000000000000006e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  27.11 
 
 		 1009 aa  177  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  27.11 
 
 		 1009 aa  177  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  50.62 
 
 		 1006 aa  177  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  47.42 
 
 		 986 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  28.11 
 
 		 1038 aa  176  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  44.81 
 
 		 1081 aa  174  7.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  45.16 
 
 		 1291 aa  169  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  46.35 
 
 		 1249 aa  168  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  43.59 
 
 		 962 aa  164  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  52.8 
 
 		 1025 aa  164  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  38.41 
 
 		 995 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  52.46 
 
 		 986 aa  155  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2960  DNA repair exonuclease, SbcC  46.35 
 
 		 1191 aa  150  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.263309 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  46.07 
 
 		 1046 aa  149  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  45.86 
 
 		 1047 aa  145  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  49.46 
 
 		 1023 aa  143  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  27.55 
 
 		 1033 aa  143  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  50.25 
 
 		 989 aa  142  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  37.77 
 
 		 1046 aa  136  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  50.93 
 
 		 995 aa  134  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  44.19 
 
 		 1022 aa  134  7.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1225  putative exonuclease  55.21 
 
 		 1058 aa  131  8.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  48.15 
 
 		 1009 aa  126  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  27.43 
 
 		 1085 aa  121  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  31.45 
 
 		 1346 aa  121  7e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  33.89 
 
 		 1224 aa  120  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  40.8 
 
 		 1091 aa  120  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  26.15 
 
 		 1108 aa  120  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  34.68 
 
 		 1223 aa  118  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  39.39 
 
 		 1223 aa  117  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  24.87 
 
 		 1059 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  37.58 
 
 		 1164 aa  115  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  40.66 
 
 		 1091 aa  114  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  27.53 
 
 		 1114 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  31.14 
 
 		 1230 aa  114  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  52.25 
 
 		 1307 aa  113  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  52.25 
 
 		 1303 aa  113  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  30.06 
 
 		 1226 aa  113  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  41.94 
 
 		 1214 aa  112  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  41.94 
 
 		 1214 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  33.22 
 
 		 1227 aa  112  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  47.41 
 
 		 1219 aa  112  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  39.9 
 
 		 1211 aa  111  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  40.68 
 
 		 1211 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  41.48 
 
 		 1213 aa  110  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  29.39 
 
 		 1165 aa  109  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  35.57 
 
 		 815 aa  109  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  39.36 
 
 		 1214 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1540  SMC domain protein  40 
 
 		 1182 aa  107  8e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  40.23 
 
 		 1214 aa  107  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  40.23 
 
 		 1214 aa  107  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  40.23 
 
 		 1214 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  37.21 
 
 		 1234 aa  106  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  33.43 
 
 		 1238 aa  105  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  34.91 
 
 		 1227 aa  104  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  27.67 
 
 		 904 aa  103  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  32.21 
 
 		 1227 aa  103  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  37 
 
 		 824 aa  103  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  26.18 
 
 		 1172 aa  102  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>