266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5582 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  100 
 
 		 381 aa  753    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  74.54 
 
 		 381 aa  570  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  46.7 
 
 		 400 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  46.7 
 
 		 400 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  44.09 
 
 		 381 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  48.43 
 
 		 383 aa  340  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  43.83 
 
 		 381 aa  340  2e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  44.09 
 
 		 381 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  43.83 
 
 		 381 aa  338  7e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  43.83 
 
 		 381 aa  338  7e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  46.17 
 
 		 400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  46.48 
 
 		 399 aa  333  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  41.99 
 
 		 381 aa  333  3e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  42.78 
 
 		 381 aa  330  3e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  44.47 
 
 		 380 aa  323  3e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  42.52 
 
 		 381 aa  317  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0051  nuclease SbcCD, D subunit  38.68 
 
 		 388 aa  315  8e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  42.13 
 
 		 381 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1735  nuclease SbcCD, D subunit  39.28 
 
 		 385 aa  294  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.053148  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  40.32 
 
 		 377 aa  293  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  39.68 
 
 		 385 aa  292  7e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  39.68 
 
 		 385 aa  292  7e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  39.68 
 
 		 385 aa  292  7e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  39.68 
 
 		 385 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  42.37 
 
 		 379 aa  291  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  39.42 
 
 		 385 aa  290  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  40.05 
 
 		 379 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2325  putative exonuclease SbcD  39.28 
 
 		 385 aa  290  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2166  nuclease SbcCD, D subunit  38.5 
 
 		 385 aa  290  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226896  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  38.5 
 
 		 385 aa  288  8e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  34.57 
 
 		 374 aa  283  3.0000000000000004e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2999  putative exonuclease SbcD  38.5 
 
 		 385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.141006  normal  0.0321972 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  31.1 
 
 		 374 aa  261  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  32.89 
 
 		 373 aa  260  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  32.89 
 
 		 373 aa  260  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  43.99 
 
 		 386 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  46.13 
 
 		 379 aa  249  5e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  37.2 
 
 		 375 aa  249  6e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  43.55 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  44.89 
 
 		 387 aa  236  4e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  44.64 
 
 		 386 aa  232  7.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  41.72 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1889  nuclease SbcCD, D subunit  41.74 
 
 		 407 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0592363  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  41.76 
 
 		 366 aa  227  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4361  nuclease SbcCD, D subunit  42.71 
 
 		 383 aa  224  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.820345  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  39.54 
 
 		 382 aa  223  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  36.86 
 
 		 381 aa  223  3e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  41.83 
 
 		 375 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  39.19 
 
 		 418 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  38.96 
 
 		 386 aa  217  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01060  exonuclease SbcD  35.71 
 
 		 409 aa  215  9.999999999999999e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3945  ATP-dependent dsDNA exonuclease protein  37.8 
 
 		 379 aa  212  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  40.85 
 
 		 390 aa  209  8e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  40 
 
 		 392 aa  207  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01260  Exodeoxyribonuclease I subunit D  41.5 
 
 		 394 aa  203  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  32.45 
 
 		 372 aa  196  6e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2390  exonuclease SbcD, putative  33.87 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.303161  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0520  nuclease SbcCD, D subunit  29.04 
 
 		 371 aa  193  4e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0123  nuclease SbcCD, D subunit  45.03 
 
 		 389 aa  192  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0170  nuclease SbcCD, D subunit, putative  30.52 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  37.21 
 
 		 407 aa  177  3e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  31.25 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  34.86 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  35.76 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  30.95 
 
 		 390 aa  149  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  28.57 
 
 		 405 aa  143  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  33.97 
 
 		 409 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2025  nuclease SbcCD, D subunit  32.76 
 
 		 412 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3717  nuclease SbcCD, D subunit  32.28 
 
 		 412 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  26.04 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  26.04 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  34.25 
 
 		 409 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  26.82 
 
 		 409 aa  136  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  29.05 
 
 		 425 aa  136  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1557  nuclease SbcCD, D subunit  31.41 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436101  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  27.91 
 
 		 408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3765  exonuclease SbcD  29.79 
 
 		 414 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0831731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1715  exonuclease SbcD  30.59 
 
 		 414 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3216  exodeoxyribonuclease I subunit D  29.93 
 
 		 414 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569023 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1150  exodeoxyribonuclease I subunit D  36.86 
 
 		 418 aa  132  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  31.61 
 
 		 414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1585  nuclease SbcCD, D subunit  30.79 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583238  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  29.03 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  32.79 
 
 		 425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  30.36 
 
 		 410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  30.42 
 
 		 425 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  33.11 
 
 		 406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  27.32 
 
 		 400 aa  129  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  27.32 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  27.32 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  26.75 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  27.32 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  27.32 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  27.32 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  27.46 
 
 		 408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  27.32 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  27.32 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  29.37 
 
 		 410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  27.32 
 
 		 400 aa  127  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  27.34 
 
 		 401 aa  126  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>