144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5568 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 270 aa  548  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  77.17 
 
 		 281 aa  421  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  48.47 
 
 		 281 aa  248  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  51.69 
 
 		 306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  47.62 
 
 		 257 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  46.61 
 
 		 257 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  47.22 
 
 		 257 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  47.22 
 
 		 257 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  50.85 
 
 		 306 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  50.85 
 
 		 306 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  50.85 
 
 		 306 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  50.85 
 
 		 297 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  46.09 
 
 		 257 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  50.85 
 
 		 256 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  50.85 
 
 		 253 aa  238  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  50.85 
 
 		 253 aa  238  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  47.5 
 
 		 253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  45.7 
 
 		 257 aa  235  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  46.67 
 
 		 253 aa  229  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  47.46 
 
 		 273 aa  228  7e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  48.03 
 
 		 263 aa  228  7e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  48.03 
 
 		 263 aa  228  7e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  45.42 
 
 		 253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  50 
 
 		 263 aa  219  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  43.85 
 
 		 268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  27.78 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.27 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  27 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  27.94 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.56 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.32 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.84 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.18 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.49 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.39 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.14 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.58 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.97 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.93 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.26 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19670  ectoine hydroxylase  27.32 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.79 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0615  hypothetical protein  22.27 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.25162  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.33 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.51 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.09 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.09 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  22.8 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  30.94 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2447  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.39 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.57 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.94 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.19 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  25.59 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.79 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34780  ectoine hydroxylase  23.68 
 
 		 300 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.965609  normal  0.242617 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.79 
 
 		 275 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.76 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.88 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5697  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.12 
 
 		 305 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  24.58 
 
 		 314 aa  52.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1161  ectoine hydroxylase  21.05 
 
 		 306 aa  52.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1849  ectoine hydroxylase  23.64 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.85 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.73 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.08 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.92 
 
 		 265 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  23.14 
 
 		 311 aa  50.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.31 
 
 		 275 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.13 
 
 		 230 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3838  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.27 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  23.58 
 
 		 304 aa  50.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4896  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.63 
 
 		 282 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3795  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.43 
 
 		 268 aa  49.7  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3132  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.66 
 
 		 268 aa  49.7  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5446  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.21 
 
 		 282 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3003  ectoine hydroxylase  22.63 
 
 		 332 aa  49.3  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.05 
 
 		 282 aa  49.3  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4809  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.65 
 
 		 273 aa  49.3  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00887466  normal  0.569054 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3622  hypothetical protein  24.02 
 
 		 279 aa  49.3  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.73 
 
 		 293 aa  48.9  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.18 
 
 		 292 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5239  hypothetical protein  28.85 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.611643 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2952  ectoine hydroxylase  25.61 
 
 		 306 aa  48.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3328  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.23 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638889 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0110  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.08 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.806567 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09246  toxin biosynthesis proten (Fum3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14710)  21.4 
 
 		 298 aa  47.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5728  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.78 
 
 		 287 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0147  CmaB  28.79 
 
 		 354 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0830798  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1224  CmaB  28.79 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.63 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  28.07 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.63 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1661  cmaB protein  28.79 
 
 		 352 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.057676  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3228  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.33 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0247  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.97 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4611  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.63 
 
 		 282 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361058  hitchhiker  0.00169766 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2304  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.33 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5186  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.1 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839073 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>