More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5541 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  100 
 
 
394 aa  795  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  80.1 
 
 
394 aa  628  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  53.33 
 
 
393 aa  421  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  34.9 
 
 
392 aa  237  3e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  32.49 
 
 
394 aa  218  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.49 
 
 
406 aa  209  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  30.67 
 
 
408 aa  209  7e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  32.15 
 
 
393 aa  208  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.11 
 
 
404 aa  207  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.47 
 
 
414 aa  207  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.93 
 
 
406 aa  205  9e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  31.68 
 
 
393 aa  205  9e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  31.32 
 
 
417 aa  205  1e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32.52 
 
 
406 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32.52 
 
 
406 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  3.04018e-08 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.21 
 
 
443 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32.52 
 
 
406 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  7.97081e-10 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  32.4 
 
 
395 aa  203  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  2.19699e-09 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32.52 
 
 
406 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  7.37026e-08 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  34.35 
 
 
420 aa  202  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  33.08 
 
 
401 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  31.76 
 
 
406 aa  202  1e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.62 
 
 
433 aa  200  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.33 
 
 
414 aa  200  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.41 
 
 
412 aa  200  4e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  30.15 
 
 
394 aa  199  5e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  32.64 
 
 
407 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  32.99 
 
 
393 aa  199  7e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  32.99 
 
 
393 aa  198  1e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  31.19 
 
 
406 aa  198  1e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  1.07568e-08 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.1 
 
 
419 aa  197  2e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  33.93 
 
 
896 aa  197  2e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.33 
 
 
414 aa  198  2e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.41 
 
 
420 aa  197  2e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.1 
 
 
419 aa  197  2e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.93 
 
 
408 aa  197  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.09 
 
 
417 aa  197  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.94 
 
 
406 aa  197  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.67 
 
 
406 aa  197  4e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  2.83455e-05 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  30.94 
 
 
406 aa  196  5e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.94 
 
 
406 aa  196  5e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.94 
 
 
406 aa  196  5e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  6.02764e-07 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  34.07 
 
 
434 aa  196  5e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  30.94 
 
 
406 aa  196  5e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  32.73 
 
 
420 aa  196  7e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.69 
 
 
406 aa  196  7e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  5.54851e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.94 
 
 
406 aa  195  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  5.7861e-05 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19482  cysteine desulfurase for iron-sulfur cluster formation suf  33.67 
 
 
496 aa  195  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.09 
 
 
421 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  7.71215e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.66 
 
 
412 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.59 
 
 
414 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.1 
 
 
419 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  29.8 
 
 
406 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.94 
 
 
406 aa  194  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32.92 
 
 
406 aa  194  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  2.89207e-05 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.17 
 
 
406 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.53 
 
 
418 aa  194  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.17 
 
 
406 aa  193  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.92 
 
 
420 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  2.91669e-06 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  30.05 
 
 
406 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  30.05 
 
 
406 aa  193  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.8 
 
 
406 aa  193  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.53 
 
 
418 aa  193  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.39 
 
 
406 aa  193  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  30.05 
 
 
406 aa  193  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  29.8 
 
 
406 aa  193  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  29.8 
 
 
406 aa  193  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  31.82 
 
 
421 aa  193  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2122  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.88 
 
 
435 aa  192  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0104519  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  33.85 
 
 
393 aa  192  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  32.07 
 
 
879 aa  192  7e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.63 
 
 
885 aa  192  8e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.67 
 
 
419 aa  192  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  31.97 
 
 
420 aa  192  9e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.66 
 
 
414 aa  192  9e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  35.07 
 
 
391 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  30.73 
 
 
410 aa  191  1e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.9 
 
 
644 aa  192  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.28 
 
 
428 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  32.58 
 
 
395 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.58 
 
 
406 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.1207e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  30.05 
 
 
406 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.86 
 
 
410 aa  190  3e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  29.56 
 
 
406 aa  190  3e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  29.56 
 
 
406 aa  190  3e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.25 
 
 
411 aa  190  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.23 
 
 
426 aa  189  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  28.92 
 
 
413 aa  189  7e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.03 
 
 
413 aa  189  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.8 
 
 
441 aa  189  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0407  cysteine desulphurases, SufS  33.58 
 
 
428 aa  189  8e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  32.38 
 
 
424 aa  189  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.83 
 
 
414 aa  189  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.67 
 
 
444 aa  188  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  31.86 
 
 
407 aa  189  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2039  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.74 
 
 
610 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.03 
 
 
413 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.53 
 
 
413 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  30.03 
 
 
410 aa  188  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.53 
 
 
413 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>