More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5435 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5435  porin precursor transmembrane protein  100 
 
 		 332 aa  673    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0880  porin  47.99 
 
 		 361 aa  258  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0359628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  47 
 
 		 359 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  48.56 
 
 		 351 aa  239  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  48.55 
 
 		 356 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  45.34 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  47.51 
 
 		 352 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  47.51 
 
 		 352 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  44.2 
 
 		 344 aa  235  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  47.83 
 
 		 356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  43.89 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  43.94 
 
 		 367 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4279  OmpC family outer membrane porin  46.29 
 
 		 361 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5685  porin  44.56 
 
 		 357 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.523942  normal  0.0446871 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2878  porin  45.39 
 
 		 358 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.636826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0429  porin Gram-negative type  45.74 
 
 		 361 aa  210  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.568653 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5908  porin  44.56 
 
 		 357 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359102  decreased coverage  0.00179215 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3015  porin  45.04 
 
 		 358 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  42.43 
 
 		 358 aa  209  7e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  41.78 
 
 		 387 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  42.62 
 
 		 358 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  41.78 
 
 		 358 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2963  porin  44.13 
 
 		 358 aa  206  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  41.45 
 
 		 358 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2354  porin  42.11 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296881  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2988  porin  42.11 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2968  porin  42.11 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  41.67 
 
 		 340 aa  196  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3229  porin  39.24 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.484687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4931  porin  39.24 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  41.97 
 
 		 342 aa  190  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6742  porin  38.61 
 
 		 357 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6266  porin  40.14 
 
 		 357 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1564  porin  40.14 
 
 		 357 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247151  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  43.21 
 
 		 362 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0804  OmpC family outer membrane porin  40.32 
 
 		 363 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3020  outer membrane protein (porin)  40.2 
 
 		 365 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  39.56 
 
 		 341 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1469  outer membrane protein (porin)-like  36.45 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00910235  normal  0.207544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1479  porin Gram-negative type  36.77 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7659  outer membrane protein (porin)  38.96 
 
 		 340 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  33.75 
 
 		 369 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  33.22 
 
 		 344 aa  105  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  35.58 
 
 		 449 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  31.67 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0061  porin  36.4 
 
 		 363 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0431794  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  35.58 
 
 		 363 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  35.58 
 
 		 363 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  35.58 
 
 		 363 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  35.58 
 
 		 363 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  35.58 
 
 		 363 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3712  porin  34.65 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718332  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  34.12 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  33.33 
 
 		 389 aa  99.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  31.89 
 
 		 338 aa  99.4  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  33.45 
 
 		 392 aa  99  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  33.45 
 
 		 392 aa  99  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  30.5 
 
 		 361 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  32.98 
 
 		 350 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  32.76 
 
 		 413 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  30.49 
 
 		 387 aa  96.3  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  30.92 
 
 		 349 aa  95.9  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  38.76 
 
 		 402 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  33.56 
 
 		 354 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  34.22 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  33.96 
 
 		 358 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  31.36 
 
 		 354 aa  93.6  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  35.38 
 
 		 390 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  31 
 
 		 362 aa  92  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  30.59 
 
 		 367 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4547  outer membrane porin signal peptide protein  33.46 
 
 		 385 aa  90.5  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000157102  normal  0.308815 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  29.14 
 
 		 335 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  31.49 
 
 		 351 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  34.36 
 
 		 409 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  34.36 
 
 		 409 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  36.12 
 
 		 391 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  31.78 
 
 		 351 aa  90.1  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  30.99 
 
 		 352 aa  89.7  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  34.11 
 
 		 355 aa  89.4  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4252  porin  30.91 
 
 		 385 aa  89.4  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73857  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1190  outer membrane protein (porin)  34.91 
 
 		 359 aa  89.4  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0135905  normal  0.83536 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4436  porin  31.78 
 
 		 383 aa  89.4  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412738 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  31.99 
 
 		 339 aa  89.4  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  30.22 
 
 		 348 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  36.41 
 
 		 404 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  37.39 
 
 		 385 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  34.75 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5712  porin  33.91 
 
 		 378 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3027  porin  33.09 
 
 		 373 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2394  porin  33.09 
 
 		 373 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636281  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  36.55 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  30.56 
 
 		 362 aa  87.8  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3008  porin  33.09 
 
 		 373 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  34.23 
 
 		 356 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4800  porin  34.62 
 
 		 367 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0160312  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5150  porin  34.23 
 
 		 356 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  34.23 
 
 		 356 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  34.18 
 
 		 390 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5588  porin  30.8 
 
 		 359 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406297 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  37.21 
 
 		 401 aa  87  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>