145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5281 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  303  4e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  44.88 
 
 
138 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6482  hypothetical protein  40.68 
 
 
146 aa  91.3  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  38.46 
 
 
132 aa  84  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  38.46 
 
 
132 aa  83.6  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  38.14 
 
 
132 aa  83.2  1e-15  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  36.75 
 
 
132 aa  83.2  1e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  33.6 
 
 
130 aa  79.7  1e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  37.61 
 
 
139 aa  79  2e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  34.17 
 
 
129 aa  77.8  5e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  34.71 
 
 
130 aa  77.4  5e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  36.75 
 
 
132 aa  76.6  1e-13  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  5.85754e-05  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  39.5 
 
 
120 aa  74.7  3e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  41.67 
 
 
120 aa  75.1  3e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  33.9 
 
 
130 aa  74.7  4e-13  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  33.05 
 
 
130 aa  74.3  5e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  31.25 
 
 
133 aa  74.3  6e-13  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  33.98 
 
 
133 aa  73.6  8e-13  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  35 
 
 
128 aa  72.8  2e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  37.7 
 
 
140 aa  72  2e-12  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  36.89 
 
 
143 aa  72  3e-12  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  37.93 
 
 
136 aa  71.6  3e-12  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  35.77 
 
 
138 aa  71.6  4e-12  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  70.5  8e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  32.77 
 
 
143 aa  70.5  8e-12  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  34.27 
 
 
143 aa  70.1  9e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  33.88 
 
 
144 aa  70.1  9e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  35.42 
 
 
319 aa  69.7  1e-11  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  34.96 
 
 
138 aa  68.9  2e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  34.96 
 
 
138 aa  68.9  2e-11  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  34.15 
 
 
142 aa  66.6  1e-10  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  30.43 
 
 
141 aa  64.7  4e-10  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  30.84 
 
 
140 aa  63.5  8e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  36.22 
 
 
149 aa  63.5  8e-10  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  26.43 
 
 
143 aa  63.2  1e-09  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5554  hypothetical protein  34.23 
 
 
157 aa  62.4  2e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  34.75 
 
 
319 aa  62  2e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  33.05 
 
 
140 aa  62.4  2e-09  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  32.41 
 
 
132 aa  62  3e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  29.27 
 
 
311 aa  60.8  5e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  32.48 
 
 
321 aa  60.8  6e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  34.09 
 
 
144 aa  59.7  1e-08  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  35.34 
 
 
155 aa  60.1  1e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6844  hypothetical protein  36.97 
 
 
121 aa  59.7  1e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  33.33 
 
 
312 aa  58.2  4e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  35.59 
 
 
135 aa  58.2  4e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  33 
 
 
129 aa  57.8  5e-08  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  35.92 
 
 
146 aa  57.8  5e-08  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0428  hypothetical protein  40.22 
 
 
131 aa  57.4  6e-08  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0261769  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  27.42 
 
 
137 aa  56.2  1e-07  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  31.93 
 
 
123 aa  56.6  1e-07  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  34.94 
 
 
182 aa  56.6  1e-07  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  36.96 
 
 
152 aa  56.6  1e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  36.96 
 
 
152 aa  56.6  1e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  35 
 
 
142 aa  56.6  1e-07  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  31.76 
 
 
576 aa  55.8  2e-07  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0984  hypothetical protein  40.22 
 
 
132 aa  55.8  2e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  36.96 
 
 
152 aa  55.8  2e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  31.15 
 
 
151 aa  55.8  2e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  36.96 
 
 
152 aa  55.1  3e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  30.5 
 
 
145 aa  55.1  3e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  36.96 
 
 
152 aa  55.1  3e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  36.96 
 
 
152 aa  55.1  3e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  30.5 
 
 
145 aa  55.1  3e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  36.96 
 
 
152 aa  55.1  3e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  30.97 
 
 
150 aa  55.1  3e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  37.62 
 
 
135 aa  55.1  3e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  34.75 
 
 
324 aa  55.5  3e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  36.96 
 
 
152 aa  55.1  3e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  36.96 
 
 
152 aa  55.1  3e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  30.5 
 
 
145 aa  55.1  3e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  29.73 
 
 
129 aa  54.7  4e-07  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  33.9 
 
 
317 aa  54.7  4e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  33.73 
 
 
189 aa  54.3  6e-07  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  31.82 
 
 
130 aa  53.9  7e-07  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  33.9 
 
 
318 aa  53.9  7e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  33.9 
 
 
318 aa  53.9  7e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  26.53 
 
 
128 aa  53.5  9e-07  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  32.19 
 
 
311 aa  53.5  9e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1027  hypothetical protein  31.53 
 
 
175 aa  53.5  1e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  30.53 
 
 
137 aa  53.1  1e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  32.32 
 
 
130 aa  53.1  1e-06  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  27.66 
 
 
129 aa  53.1  1e-06  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3541  hypothetical protein  32.03 
 
 
156 aa  52.8  2e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0915855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  33.07 
 
 
317 aa  52.8  2e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  27.01 
 
 
137 aa  52  3e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  27.13 
 
 
137 aa  50.8  5e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  30.3 
 
 
130 aa  51.2  5e-06  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  26.61 
 
 
137 aa  51.2  5e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  34.96 
 
 
137 aa  51.2  5e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  31.13 
 
 
144 aa  50.4  7e-06  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  38.75 
 
 
141 aa  50.4  8e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.909625 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1145  protein of unknown function DUF35  35.16 
 
 
133 aa  50.1  9e-06  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0574924  hitchhiker  7.46026e-05 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0343  hypothetical protein  35.14 
 
 
119 aa  50.1  1e-05  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619973  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  25.81 
 
 
137 aa  49.7  1e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  28.95 
 
 
178 aa  49.7  1e-05  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  33.63 
 
 
132 aa  49.7  1e-05  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2366  hypothetical protein  31.78 
 
 
152 aa  49.3  2e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206302  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  29.41 
 
 
152 aa  49.3  2e-05  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  24.8 
 
 
135 aa  49.3  2e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0775897 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>