164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5265 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3124  hypothetical protein  78.12 
 
 
512 aa  830  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2815  hypothetical protein  57.23 
 
 
513 aa  639  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5265  hypothetical protein  100 
 
 
515 aa  1070  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0727  hypothetical protein  76.09 
 
 
516 aa  836  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0778  hypothetical protein  75.44 
 
 
517 aa  838  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2915  hypothetical protein  76.1 
 
 
535 aa  827  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.376798 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2510  hypothetical protein  76.09 
 
 
516 aa  836  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1784  hypothetical protein  76.65 
 
 
515 aa  832  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.170054  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0175  hypothetical protein  75.69 
 
 
512 aa  826  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.653266  hitchhiker  1.00045e-06 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0799  EvpB family type VI secretion protein  76.09 
 
 
514 aa  837  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.380485  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3260  EvpB family type VI secretion protein  71.95 
 
 
512 aa  777  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177977  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3650  EvpB family type VI secretion protein  77.78 
 
 
516 aa  843  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.453281 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0624  hypothetical protein  93.01 
 
 
525 aa  1008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0350498 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0160  hypothetical protein  56.29 
 
 
504 aa  569  1e-161  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.586065  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2026  hypothetical protein  47.57 
 
 
499 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.383781  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2124  hypothetical protein  47.57 
 
 
499 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0716  hypothetical protein  47.57 
 
 
508 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1673  hypothetical protein  47.57 
 
 
508 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393568  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0605  hypothetical protein  47.57 
 
 
508 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0279  hypothetical protein  48.45 
 
 
492 aa  463  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0743  hypothetical protein  47.57 
 
 
499 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0585282  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0534  hypothetical protein  47.67 
 
 
760 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.897456  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0091  hypothetical protein  46.46 
 
 
492 aa  455  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0869  hypothetical protein  46.9 
 
 
508 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0030  hypothetical protein  45.36 
 
 
492 aa  451  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.599961  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1197  hypothetical protein  47.02 
 
 
493 aa  449  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.73618  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2528  EvpB family type VI secretion protein  44.91 
 
 
491 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3173  hypothetical protein  48.01 
 
 
494 aa  451  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1123  putative type VI secretion protein VasR  48 
 
 
491 aa  446  1e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34753  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3732  hypothetical protein  46.02 
 
 
493 aa  446  1e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5594  hypothetical protein  45.8 
 
 
491 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3254  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  46.02 
 
 
492 aa  444  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43030  hypothetical protein  45.13 
 
 
491 aa  441  1e-122  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2806  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  45.35 
 
 
492 aa  440  1e-122  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3614  hypothetical protein  45.13 
 
 
491 aa  441  1e-122  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227382  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1071  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  45.35 
 
 
492 aa  441  1e-122  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5432  hypothetical protein  44.91 
 
 
492 aa  442  1e-122  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.682692  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0314  hypothetical protein  45.35 
 
 
493 aa  430  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000440  uncharacterized protein ImpC  44.29 
 
 
491 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338672  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0239  hypothetical protein  45.74 
 
 
491 aa  431  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3904  hypothetical protein  45.35 
 
 
493 aa  430  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0387  EvpB family type VI secretion protein  45.35 
 
 
493 aa  430  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2544  hypothetical protein  45.96 
 
 
491 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00544949  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0237  hypothetical protein  45.74 
 
 
491 aa  431  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05862  hypothetical protein  43.61 
 
 
491 aa  424  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0046  hypothetical protein  44.59 
 
 
492 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3225  EvpB family type VI secretion protein  44.22 
 
 
496 aa  417  1e-115  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1229  hypothetical protein  44.87 
 
 
490 aa  416  1e-115  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.159101 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2269  hypothetical protein  46.96 
 
 
499 aa  415  1e-115  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256541  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1110  type VI secretion protein, EvpB/family  44.87 
 
 
490 aa  415  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1182  EvpB family type VI secretion protein  42.29 
 
 
482 aa  412  1e-114  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2623  hypothetical protein  43.11 
 
 
496 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2126  hypothetical protein  42.89 
 
 
496 aa  408  1e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0122  hypothetical protein  46.15 
 
 
499 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4954  hypothetical protein  46.5 
 
 
500 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0134  hypothetical protein  46.39 
 
 
499 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.831371  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0158  hypothetical protein  46.39 
 
 
499 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1606  hypothetical protein  46.39 
 
 
499 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3634  hypothetical protein  46.62 
 
 
496 aa  401  1e-110  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0294891  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2963  hypothetical protein  46.62 
 
 
496 aa  401  1e-110  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3643  hypothetical protein  46.62 
 
 
496 aa  401  1e-110  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.012047  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3659  hypothetical protein  46.62 
 
 
496 aa  401  1e-110  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233212  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2929  EvpB family type VI secretion protein  46.15 
 
 
496 aa  399  1e-110  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0212184  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01964  hypothetical protein  45.69 
 
 
496 aa  399  1e-110  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.470165  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0446  EvpB family type VI secretion protein  45.69 
 
 
496 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0234232  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2872  hypothetical protein  44.88 
 
 
500 aa  397  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2323  hypothetical protein  45.22 
 
 
498 aa  396  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0970803  normal  0.0167765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2509  EvpB family type VI secretion protein  46.03 
 
 
500 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0777489  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2176  hypothetical protein  44.73 
 
 
494 aa  399  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.22545e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2765  EvpB family type VI secretion protein  45.79 
 
 
500 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0505652  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1368  hypothetical protein  44.88 
 
 
500 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1480  EvpB family type VI secretion protein  44.88 
 
 
500 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0403  EvpB family type VI secretion protein  45.69 
 
 
496 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  5.70497e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1682  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  42.98 
 
 
497 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.509952  normal  0.0159997 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0382  hypothetical protein  45.69 
 
 
496 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0468  hypothetical protein  45.69 
 
 
496 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  2.82714e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2638  hypothetical protein  45.69 
 
 
496 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000879955  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2460  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  44.76 
 
 
499 aa  396  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3560  hypothetical protein  45.69 
 
 
496 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00109925  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02046  EvpB  44.24 
 
 
498 aa  398  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.422176  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4914  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  45.48 
 
 
496 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  3.26238e-06  normal  0.0140639 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3908  EvpB family type VI secretion protein  44.99 
 
 
497 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.38023 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1477  hypothetical protein  45.09 
 
 
499 aa  391  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.640314  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0012  hypothetical protein  41.42 
 
 
482 aa  392  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3099  hypothetical protein  45.56 
 
 
500 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0981  hypothetical protein  44.52 
 
 
497 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2094  putative cytoplasmic protein  45.22 
 
 
497 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2623  hypothetical protein  45.56 
 
 
500 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3004  hypothetical protein  43.93 
 
 
501 aa  391  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6674  EvpB family type VI secretion protein  43.97 
 
 
499 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.585519  normal  0.849864 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6113  EvpB family type VI secretion protein  44.76 
 
 
497 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.32673 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3851  EvpB family type VI secretion protein  41.31 
 
 
497 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538189  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1530  hypothetical protein  42.32 
 
 
491 aa  388  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.704852  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1209  hypothetical protein  44.76 
 
 
499 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3026  hypothetical protein  41.58 
 
 
494 aa  388  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00788252  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0242  hypothetical protein  44.99 
 
 
499 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2184  hypothetical protein  44.76 
 
 
499 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968524  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1910  hypothetical protein  44.76 
 
 
499 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0333  hypothetical protein  44.99 
 
 
499 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0922  hypothetical protein  44.76 
 
 
499 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>