More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5204 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  682    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  51.02 
 
 
325 aa  319  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  45.94 
 
 
328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  44.65 
 
 
323 aa  298  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  44.65 
 
 
323 aa  297  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2212  hypothetical protein  69.7 
 
 
383 aa  295  6e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366732  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  45.79 
 
 
327 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  47.3 
 
 
327 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  44.3 
 
 
326 aa  279  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  44.18 
 
 
315 aa  277  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3035  hypothetical protein  45.89 
 
 
338 aa  275  9e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208714  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  42.47 
 
 
324 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  40.06 
 
 
327 aa  265  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  42.23 
 
 
333 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1801  hypothetical protein  42.9 
 
 
331 aa  259  6e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000114766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  41.44 
 
 
318 aa  252  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  40.13 
 
 
332 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0720  hypothetical protein  39.33 
 
 
377 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  38.59 
 
 
336 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  39.23 
 
 
331 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5765  hypothetical protein  39.25 
 
 
326 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1953  hypothetical protein  35.69 
 
 
331 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4263  hypothetical protein  37.54 
 
 
324 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4279  hypothetical protein  34.68 
 
 
339 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557506  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  34.78 
 
 
350 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  34.86 
 
 
324 aa  189  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  34.72 
 
 
322 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  37.16 
 
 
321 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  37.74 
 
 
333 aa  184  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  35.23 
 
 
321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  32.45 
 
 
324 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  32.45 
 
 
324 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  32.45 
 
 
324 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  33.13 
 
 
326 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  34 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  34.94 
 
 
327 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  34.92 
 
 
327 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  37.7 
 
 
336 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  34.34 
 
 
329 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  35.5 
 
 
332 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3683  twin-arginine translocation pathway signal  33.02 
 
 
326 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0852906  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  33.9 
 
 
322 aa  170  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5248  extra-cytoplasmic solute receptor  39.77 
 
 
333 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0821441  normal  0.224057 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  34.94 
 
 
351 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  36.72 
 
 
338 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6345  hypothetical protein  33.11 
 
 
330 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  31.69 
 
 
318 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  36.11 
 
 
347 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  30.62 
 
 
324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  35.27 
 
 
341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  34.02 
 
 
322 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0267  hypothetical protein  34.63 
 
 
337 aa  166  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.717963  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  33.22 
 
 
322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  32.65 
 
 
356 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  33.22 
 
 
340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  35.33 
 
 
366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0709  hypothetical protein  33.02 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  34.75 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  34.58 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  35.52 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  31.97 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  33.02 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  32.92 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  32.13 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  34.48 
 
 
323 aa  164  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  36.79 
 
 
332 aa  164  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  29.41 
 
 
326 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  33.02 
 
 
328 aa  163  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1371  hypothetical protein  33.74 
 
 
342 aa  163  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3593  hypothetical protein  32.55 
 
 
328 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  34.32 
 
 
334 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3173  hypothetical protein  33.92 
 
 
328 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3537  hypothetical protein  34.53 
 
 
322 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4109  extra-cytoplasmic solute receptor  36.6 
 
 
334 aa  162  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305056  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  34.72 
 
 
325 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  32.89 
 
 
325 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4543  hypothetical protein  34.34 
 
 
323 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00792277  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  35.32 
 
 
358 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  33.67 
 
 
333 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0230  hypothetical protein  33.75 
 
 
325 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.297897  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  32.08 
 
 
326 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  35.31 
 
 
324 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  30.56 
 
 
325 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  30.27 
 
 
323 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  31.5 
 
 
333 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4415  extra-cytoplasmic solute receptor  39.41 
 
 
320 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.597884  normal  0.464948 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  31.68 
 
 
326 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  34.67 
 
 
328 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  31.8 
 
 
332 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  34.65 
 
 
325 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  31.68 
 
 
320 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  34.64 
 
 
327 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6179  hypothetical protein  30.77 
 
 
323 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  33.55 
 
 
322 aa  159  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  33.54 
 
 
321 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0962  hypothetical protein  32.26 
 
 
325 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1686  hypothetical protein  34.01 
 
 
331 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.893749  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2535  hypothetical protein  38.82 
 
 
324 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.188346  normal  0.11919 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  32.01 
 
 
330 aa  159  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  33.44 
 
 
340 aa  159  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>