More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5185 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5185  cold-shock DNA-binding protein family protein  100 
 
 		 67 aa  137  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5171  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  97.01 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.515643  normal  0.7858 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1374  cold-shock DNA-binding domain protein  97.01 
 
 		 67 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215281  normal  0.985957 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1310  cold-shock DNA-binding domain protein  97.01 
 
 		 67 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00171676  normal  0.537383 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3156  cold shock-like transcription regulator protein  92.54 
 
 		 67 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4151  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  83.58 
 
 		 67 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19776  normal  0.285903 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4951  cold-shock DNA-binding protein family protein  80.6 
 
 		 67 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0530166  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6014  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.64 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5764  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.21 
 
 		 170 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008002 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6028  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.64 
 
 		 67 aa  100  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2596  cold-shock DNA-binding protein family protein  72.73 
 
 		 67 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2727  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.73 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5581  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.15 
 
 		 67 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4409  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.21 
 
 		 67 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5095  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.21 
 
 		 67 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2951  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.21 
 
 		 77 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.15288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5798  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.15 
 
 		 67 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.992183 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6907  cold-shock DNA-binding domain protein  71.21 
 
 		 67 aa  97.4  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240211  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5269  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 		 67 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859722 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0430  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.66 
 
 		 67 aa  97.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000180464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3528  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 		 67 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00720053  normal  0.332876 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1388  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.66 
 
 		 67 aa  97.1  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000202704  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2780  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.66 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000626517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7382  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6765  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 		 67 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.929729  normal  0.307986 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0679  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 		 68 aa  95.9  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.233328  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1668  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.18 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000281076  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5169  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.7 
 
 		 67 aa  95.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4361  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.18 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2202  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 		 67 aa  94.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2061  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.66 
 
 		 67 aa  94.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.131927 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2503  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 68 aa  95.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000079429  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3900  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.18 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.878106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4995  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5888  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232235  normal  0.225892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0913  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.18 
 
 		 67 aa  93.6  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.587921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5816  major cold shock protein  64.18 
 
 		 67 aa  93.6  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5524  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337597  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6397  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.257839 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0002  cold shock-like transcription regulator protein  68.18 
 
 		 67 aa  93.6  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.0000000106276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4522  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.044588  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3895  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2791  cold-shock domain-contain protein  65.67 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.827238  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5838  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.284132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5340  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 83 aa  93.2  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5342  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.67 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0855  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.67 
 
 		 68 aa  92.8  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.563444  normal  0.445485 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3782  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0399631  normal  0.208523 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3609  cold shock transcription regulator protein  65.67 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4166  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.18 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.745487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2894  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0694911  normal  0.905374 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3591  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1151  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114699  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1449  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.67 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3184  cold-shock domain-contain protein  65.67 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2936  cold-shock domain-contain protein  65.67 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0476  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.528893 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2202  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.69 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1750  cold-shock domain-contain protein  65.67 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4464  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3622  cold-shock domain-contain protein  65.67 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5818  cold-shock DNA-binding protein family  66.67 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2602  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0673828  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3904  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0408  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125835  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0434  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.325578  normal  0.535982 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3598  CspE-related protein  65.67 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.164204  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0503  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0167  cold-shock domain-contain protein  62.69 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1853  cold-shock domain-contain protein  62.69 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537737  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0567  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 68 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000101913  hitchhiker  0.000143899 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0899  cold-shock domain-contain protein  62.69 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0388  cold shock transcription regulator protein  62.69 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1681  cold-shock DNA-binding domain protein  65.15 
 
 		 69 aa  92  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248337  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1002  cold-shock domain-contain protein  62.69 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229308  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1944  hypothetical protein  62.69 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0798  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.23 
 
 		 68 aa  92  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000106482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0482  cold-shock domain-contain protein  62.69 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3078  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1442  cold-shock domain-contain protein  62.69 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3167  cold-shock DNA-binding domain protein  69.23 
 
 		 68 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493488  hitchhiker  0.00220171 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0676  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.69 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197262  normal  0.753603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1374  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 		 67 aa  91.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.287556  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0613  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.25 
 
 		 71 aa  91.7  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.513087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0586  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.18 
 
 		 67 aa  90.9  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3483  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.62 
 
 		 70 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.207055  normal  0.0338515 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4386  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 		 67 aa  90.9  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4276  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 		 67 aa  90.9  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1929  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.62 
 
 		 70 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00237274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2160  cold-shock protein, DNA-binding  65.62 
 
 		 70 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1855  cold acclimation protein B  66.67 
 
 		 69 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0386681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21760  cold acclimation protein B  66.67 
 
 		 69 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.342335  normal  0.456476 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2702  cold shock-like transcription regulator protein  83.67 
 
 		 54 aa  89.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0531  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.62 
 
 		 70 aa  90.1  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0526  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.62 
 
 		 70 aa  90.1  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0898507  hitchhiker  0.00873644 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1097  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.19 
 
 		 67 aa  89.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.24529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3392  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.67 
 
 		 68 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0948  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.69 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360484  normal  0.128926 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1909  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.06 
 
 		 69 aa  89  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00215125  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>