More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5178 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  100 
 
 
457 aa  912  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  62.56 
 
 
455 aa  539  1e-152  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  61.57 
 
 
455 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  60.54 
 
 
459 aa  533  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  60.53 
 
 
472 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  60.09 
 
 
472 aa  521  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  60.09 
 
 
474 aa  518  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  60.9 
 
 
474 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  60.9 
 
 
474 aa  516  1e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  60.81 
 
 
474 aa  516  1e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  60.22 
 
 
478 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  60.22 
 
 
478 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  60.22 
 
 
478 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  61.04 
 
 
473 aa  514  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  60.22 
 
 
478 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  60.22 
 
 
478 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  59.91 
 
 
476 aa  510  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  60 
 
 
478 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  60.22 
 
 
478 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  58.08 
 
 
467 aa  494  1e-138  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  60.54 
 
 
473 aa  481  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  55.93 
 
 
451 aa  472  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  50.56 
 
 
451 aa  447  1e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.78504e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  49.9 
 
 
514 aa  428  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1010  major facilitator family transporter  60.06 
 
 
398 aa  401  1e-110  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  43.95 
 
 
509 aa  345  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  36.38 
 
 
451 aa  300  5e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.15751e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  36.78 
 
 
447 aa  290  4e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  7.87137e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  37.05 
 
 
456 aa  285  1e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  35.87 
 
 
438 aa  263  5e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  34.59 
 
 
456 aa  260  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  35.05 
 
 
399 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  7.25853e-08  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  34.88 
 
 
399 aa  257  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  8.69498e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  34.65 
 
 
399 aa  256  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.14177e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  34.65 
 
 
399 aa  255  9e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  4.80591e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  34.65 
 
 
399 aa  255  9e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  34.65 
 
 
399 aa  255  9e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  2.22558e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  34.65 
 
 
399 aa  255  9e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 
398 aa  255  1e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  34.35 
 
 
399 aa  255  1e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.05464e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  34.11 
 
 
399 aa  254  2e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.59613e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  34.11 
 
 
399 aa  253  4e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.23204e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  36.24 
 
 
473 aa  253  5e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  33.18 
 
 
399 aa  253  7e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.33422e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  36.38 
 
 
470 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  35.78 
 
 
477 aa  247  3e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.16 
 
 
468 aa  246  7e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  1.98546e-05  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  37.26 
 
 
435 aa  245  1e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 
447 aa  243  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 
465 aa  243  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 
398 aa  242  9e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  5.27195e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  34.16 
 
 
485 aa  240  3e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  35.97 
 
 
445 aa  235  1e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  34.14 
 
 
459 aa  233  6e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  35.99 
 
 
449 aa  233  7e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  31.65 
 
 
526 aa  224  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  33.48 
 
 
463 aa  219  9e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  31.4 
 
 
459 aa  218  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  32.02 
 
 
460 aa  216  8e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  33.85 
 
 
464 aa  215  1e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  34.78 
 
 
437 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  30.93 
 
 
438 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 
466 aa  211  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  33.64 
 
 
434 aa  210  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  30.05 
 
 
438 aa  208  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  32.2 
 
 
437 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  32.36 
 
 
461 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  32.37 
 
 
436 aa  206  5e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  33.33 
 
 
436 aa  205  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  32.15 
 
 
436 aa  205  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 
404 aa  203  6e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 
462 aa  201  2e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.82 
 
 
450 aa  199  8e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.44 
 
 
462 aa  199  1e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  32.4 
 
 
492 aa  198  2e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 
447 aa  196  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  34.16 
 
 
478 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  32.29 
 
 
468 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 
446 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  33.33 
 
 
436 aa  193  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  31.43 
 
 
479 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  31.43 
 
 
479 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  32.23 
 
 
480 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  32.23 
 
 
480 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  32.23 
 
 
480 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.17 
 
 
461 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 
471 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  31.39 
 
 
467 aa  191  3e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  31.39 
 
 
467 aa  191  3e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  32.8 
 
 
469 aa  190  5e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  32.9 
 
 
471 aa  189  6e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  29.42 
 
 
458 aa  187  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  31.26 
 
 
460 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 
479 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  31.63 
 
 
480 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  31.63 
 
 
480 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  33.5 
 
 
415 aa  187  4e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  33.92 
 
 
464 aa  186  8e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  31.58 
 
 
479 aa  185  1e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  29.89 
 
 
467 aa  185  2e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>