More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5143 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5143  major facilitator transporter  100 
 
 
482 aa  960    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3410  major facilitator superfamily MFS_1  64.27 
 
 
484 aa  582  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1408  major facilitator transporter  56.75 
 
 
484 aa  544  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000966462  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  29.11 
 
 
464 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 
451 aa  166  9e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 
473 aa  161  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.45 
 
 
461 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 
451 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 
488 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  27.94 
 
 
492 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  27.61 
 
 
472 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  27.61 
 
 
472 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  27.61 
 
 
472 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  27.42 
 
 
472 aa  150  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  26.19 
 
 
447 aa  149  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 
466 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 
470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 
435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  29.2 
 
 
448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  27.56 
 
 
477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  26.84 
 
 
472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  27.23 
 
 
487 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.43 
 
 
450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  27.23 
 
 
475 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 
450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
451 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  29.07 
 
 
462 aa  148  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  28.7 
 
 
462 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  28.7 
 
 
472 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  28.7 
 
 
472 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  28.7 
 
 
472 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 
456 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  28.47 
 
 
472 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  28.07 
 
 
474 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  31.33 
 
 
438 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  28.07 
 
 
474 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  27.01 
 
 
475 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  28.4 
 
 
459 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  28.39 
 
 
472 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  28.25 
 
 
472 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 
433 aa  143  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  27.84 
 
 
474 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  27.6 
 
 
476 aa  143  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  26.3 
 
 
455 aa  143  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
473 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  26.86 
 
 
455 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 
447 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  27.17 
 
 
473 aa  141  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.93 
 
 
474 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 
458 aa  141  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 
494 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 
456 aa  140  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  30.28 
 
 
494 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.73 
 
 
468 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  28.6 
 
 
463 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  26.96 
 
 
470 aa  139  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  27.02 
 
 
434 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 
459 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.36 
 
 
468 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  26.68 
 
 
432 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1414  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 
444 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  25.62 
 
 
474 aa  136  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  26.74 
 
 
435 aa  136  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  26.68 
 
 
432 aa  136  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  26.79 
 
 
432 aa  136  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  26.79 
 
 
434 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  28.67 
 
 
450 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 
460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  26.39 
 
 
457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  26.91 
 
 
432 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473861 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 
448 aa  134  5e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  27.25 
 
 
473 aa  134  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  30.54 
 
 
477 aa  134  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 
465 aa  133  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  28.67 
 
 
467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  26.05 
 
 
460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  25.12 
 
 
456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 
472 aa  131  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.86 
 
 
462 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  29.2 
 
 
467 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 
461 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  27.51 
 
 
434 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 
459 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  25.94 
 
 
477 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.06 
 
 
472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1898  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 
448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2576  major facilitator transporter  27.27 
 
 
475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 
446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  28.54 
 
 
453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  26.54 
 
 
478 aa  128  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  27.33 
 
 
472 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  26.54 
 
 
478 aa  128  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 
471 aa  128  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  27.5 
 
 
430 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  26.54 
 
 
478 aa  128  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  26.54 
 
 
478 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  26.54 
 
 
478 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  26.54 
 
 
478 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  26.54 
 
 
478 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  27.29 
 
 
438 aa  127  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>