More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5022 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  100 
 
 
396 aa  802    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  78.97 
 
 
392 aa  632  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  47.85 
 
 
373 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  46.58 
 
 
393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  44.59 
 
 
393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  41.06 
 
 
396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  42.78 
 
 
393 aa  280  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  43.95 
 
 
391 aa  276  5e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.13 
 
 
402 aa  269  7e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3004  3-oxoadipate enol-lactonase  42.38 
 
 
390 aa  266  5e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  51.39 
 
 
269 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  49.62 
 
 
263 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  49.62 
 
 
263 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  50.8 
 
 
262 aa  257  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  48.26 
 
 
270 aa  252  7e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  47.86 
 
 
259 aa  252  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  48.85 
 
 
262 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  48.28 
 
 
263 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  41.87 
 
 
397 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  47.89 
 
 
263 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  48.29 
 
 
263 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  47.89 
 
 
263 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  46.54 
 
 
270 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  46.15 
 
 
270 aa  247  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  40.57 
 
 
386 aa  245  9e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  37.08 
 
 
397 aa  245  9e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.27 
 
 
393 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.27 
 
 
393 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.27 
 
 
393 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.27 
 
 
393 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.27 
 
 
393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  47.89 
 
 
263 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41 
 
 
393 aa  244  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  49.42 
 
 
265 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  48.79 
 
 
258 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  43.58 
 
 
261 aa  240  4e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0302  carboxymuconolactone decarboxylase  38.28 
 
 
389 aa  239  6.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0830882  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  48.8 
 
 
265 aa  239  8e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  46.36 
 
 
263 aa  239  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  48.46 
 
 
261 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  48.46 
 
 
266 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  47.69 
 
 
261 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02840  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  47.89 
 
 
263 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373342 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  47.69 
 
 
261 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  48.08 
 
 
266 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  47.31 
 
 
261 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1182  3-oxoadipate enol-lactonase  44.32 
 
 
265 aa  230  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  43.95 
 
 
255 aa  228  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  46.54 
 
 
261 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  46.54 
 
 
261 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  46.54 
 
 
261 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  44.79 
 
 
263 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  44.79 
 
 
263 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  43.15 
 
 
261 aa  222  7e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0618  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.29 
 
 
400 aa  221  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  43.85 
 
 
261 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  43.85 
 
 
261 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  43.85 
 
 
261 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.85 
 
 
261 aa  219  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  43.85 
 
 
261 aa  219  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  43.85 
 
 
261 aa  219  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  44.83 
 
 
263 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  42.8 
 
 
258 aa  216  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.69 
 
 
261 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  43.36 
 
 
261 aa  206  6e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  78.57 
 
 
128 aa  206  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  76.98 
 
 
128 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  76.98 
 
 
128 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0058  4-carboxymuconolactone decarboxylase  76.38 
 
 
128 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161595  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  76.98 
 
 
128 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  40.31 
 
 
260 aa  202  8e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3125  carboxymuconolactone decarboxylase  76.98 
 
 
129 aa  202  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5750  4-carboxymuconolactone decarboxylase  76.98 
 
 
129 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5109  4-carboxymuconolactone decarboxylase  76.98 
 
 
129 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4316  4-carboxymuconolactone decarboxylase  75.38 
 
 
131 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146371  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0647  4-carboxymuconolactone decarboxylase (PcaC)  76.98 
 
 
130 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.153527 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  40.77 
 
 
271 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  75.59 
 
 
128 aa  201  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1487  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  75.59 
 
 
128 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1204  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  75.59 
 
 
128 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0071  4-carboxymuconolactone decarboxylase  75.59 
 
 
128 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499909  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1557  4-carboxymuconolactone decarboxylase  75.59 
 
 
128 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0060  4-carboxymuconolactone decarboxylase  75.59 
 
 
128 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4461  4-carboxymuconolactone decarboxylase  72.8 
 
 
128 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.273934 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2904  3-oxoadipate enol-lactonase  41.67 
 
 
377 aa  197  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475956  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  42.23 
 
 
265 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  70.83 
 
 
133 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  69.35 
 
 
129 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  40 
 
 
260 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  40.38 
 
 
260 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  71.67 
 
 
130 aa  190  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  71.67 
 
 
130 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  71.67 
 
 
130 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  69.17 
 
 
133 aa  189  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  66.67 
 
 
130 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  75 
 
 
132 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3040  3-oxoadipate enol-lactonase  41.37 
 
 
253 aa  188  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  74.19 
 
 
131 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  65.89 
 
 
132 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  40.08 
 
 
256 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>