More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4975 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
660 aa  1325    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.99 
 
 
663 aa  597  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658614  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4406  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.02 
 
 
653 aa  543  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.38 
 
 
680 aa  335  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 
955 aa  317  5e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 
1297 aa  304  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 
865 aa  303  7.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.18 
 
 
934 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.69 
 
 
889 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 
708 aa  290  6e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 
1331 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 
1478 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1191  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.77 
 
 
697 aa  287  5e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604254  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 
1391 aa  286  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.56 
 
 
1965 aa  286  8e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.55 
 
 
628 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  36.93 
 
 
678 aa  283  7.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.95 
 
 
1501 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.01 
 
 
1419 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 
1002 aa  281  4e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.86 
 
 
696 aa  278  3e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 
1808 aa  276  9e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  42.42 
 
 
725 aa  273  9e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.11 
 
 
1287 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3270  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 
796 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.498059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.53 
 
 
1184 aa  266  7e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05068  composite two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  40.42 
 
 
676 aa  266  8.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.68 
 
 
1407 aa  266  8.999999999999999e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1492  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.91 
 
 
606 aa  265  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216645  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 
701 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.03 
 
 
678 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 
587 aa  263  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.03 
 
 
631 aa  263  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  30.3 
 
 
659 aa  261  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  39.46 
 
 
1131 aa  261  4e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 
882 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 
653 aa  260  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1458  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.56 
 
 
585 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.75 
 
 
1557 aa  259  9e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  36.89 
 
 
1399 aa  259  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.07 
 
 
1431 aa  258  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1302  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  40.78 
 
 
1220 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.772751 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0447  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.04 
 
 
662 aa  254  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 
1548 aa  254  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  33.83 
 
 
1384 aa  252  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.23 
 
 
1330 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 
720 aa  249  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.25 
 
 
1380 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4696  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  40 
 
 
1214 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.61 
 
 
1408 aa  245  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.35 
 
 
1068 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2452  histidine kinase  40.43 
 
 
459 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137495  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.29 
 
 
1371 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 
1287 aa  240  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  36.8 
 
 
519 aa  239  9e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5978  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 
656 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.410257  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 
1261 aa  236  8e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3889  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
794 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
794 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410783  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0992  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 
663 aa  234  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374279  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3990  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.78 
 
 
666 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4377  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.78 
 
 
666 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.53 
 
 
672 aa  233  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.934605  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.15 
 
 
1361 aa  229  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.62 
 
 
803 aa  229  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 
1255 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3793  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 
664 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.191798 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4258  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.89 
 
 
663 aa  224  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267585 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0667  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 
703 aa  223  6e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.47 
 
 
1152 aa  223  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4245  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.34 
 
 
654 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5642  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.32 
 
 
768 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_003296  RS02235  composite two-component sensor kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  35.64 
 
 
796 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1870  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 
657 aa  220  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240453  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6390  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 
770 aa  221  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.186908 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 
716 aa  219  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.749109 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.52 
 
 
768 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479069  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.7 
 
 
781 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 
776 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.92 
 
 
664 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.78 
 
 
835 aa  217  5.9999999999999996e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4695  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.42 
 
 
526 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.756017  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1811  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 
1085 aa  216  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.532209 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2317  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 
657 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.553373  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1375  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.19 
 
 
768 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6454  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.19 
 
 
768 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.19 
 
 
844 aa  214  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.69 
 
 
911 aa  212  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1756  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.68 
 
 
844 aa  211  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1922  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.41 
 
 
558 aa  210  7e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1979  sensory box histidine kinase/response regulator  35.73 
 
 
771 aa  210  8e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1289  sensory box histidine kinase/response regulator  35.73 
 
 
772 aa  210  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2264  sensory box histidine kinase/response regulator  35.73 
 
 
771 aa  210  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.87596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1000  sensory box histidine kinase/response regulator  35.73 
 
 
771 aa  210  8e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.52 
 
 
791 aa  210  8e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1379  sensory box histidine kinase/response regulator  35.66 
 
 
769 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1997  histidine kinase/response regulator hybrid protein  43.8 
 
 
558 aa  210  9e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.947527  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 
906 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3159  sensory box histidine kinase/response regulator  35.73 
 
 
771 aa  209  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882119  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 
1223 aa  209  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>