More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4957 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  666    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  82.94 
 
 		 339 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  51.83 
 
 		 322 aa  345  7e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  53.8 
 
 		 332 aa  339  5e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2965  hypothetical protein  57.33 
 
 		 353 aa  338  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  54.03 
 
 		 325 aa  328  9e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  53.14 
 
 		 326 aa  328  9e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  52.01 
 
 		 337 aa  328  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  52.67 
 
 		 333 aa  324  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  49.01 
 
 		 349 aa  317  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2068  hypothetical protein  52.04 
 
 		 342 aa  312  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  50.33 
 
 		 333 aa  310  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  51.16 
 
 		 314 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  48.31 
 
 		 339 aa  308  6.999999999999999e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  48.66 
 
 		 333 aa  308  8e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  50.15 
 
 		 331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  47.02 
 
 		 334 aa  297  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  48.57 
 
 		 325 aa  296  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  49.85 
 
 		 330 aa  291  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  49.34 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  47.49 
 
 		 336 aa  290  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  49.49 
 
 		 333 aa  290  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  45.81 
 
 		 328 aa  288  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  49.54 
 
 		 330 aa  288  8e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  45.62 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  46.75 
 
 		 333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  48.37 
 
 		 333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  48.32 
 
 		 332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  47.71 
 
 		 339 aa  281  8.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  44.72 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  48.22 
 
 		 360 aa  279  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  50 
 
 		 330 aa  279  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  46.06 
 
 		 328 aa  278  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4430  hypothetical protein  47.83 
 
 		 328 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.840915  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  48.65 
 
 		 331 aa  277  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  45.43 
 
 		 339 aa  276  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  48.67 
 
 		 330 aa  276  5e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  48.67 
 
 		 330 aa  276  5e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  42.14 
 
 		 325 aa  275  7e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  46.01 
 
 		 332 aa  275  8e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  47.54 
 
 		 328 aa  275  9e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  45.6 
 
 		 323 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5000  hypothetical protein  47.7 
 
 		 325 aa  273  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  47.19 
 
 		 332 aa  272  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  45.21 
 
 		 330 aa  272  7e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  44.14 
 
 		 344 aa  271  9e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3526  hypothetical protein  46.18 
 
 		 371 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  45.48 
 
 		 345 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  45.85 
 
 		 325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  45.48 
 
 		 345 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  45.54 
 
 		 328 aa  269  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  46.86 
 
 		 332 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  45.54 
 
 		 328 aa  269  4e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  44.14 
 
 		 331 aa  268  5.9999999999999995e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  44.67 
 
 		 330 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  44.14 
 
 		 331 aa  268  7e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  45.27 
 
 		 326 aa  267  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  47.8 
 
 		 349 aa  267  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  47.04 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  45.9 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  42.09 
 
 		 325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  42.95 
 
 		 325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  48.16 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  42.9 
 
 		 332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  43.38 
 
 		 330 aa  266  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  47.16 
 
 		 339 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  43.85 
 
 		 346 aa  266  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2040  hypothetical protein  42.64 
 
 		 332 aa  266  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  46.18 
 
 		 330 aa  266  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  45.64 
 
 		 339 aa  265  5.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  46.22 
 
 		 358 aa  265  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  44.97 
 
 		 327 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  49.5 
 
 		 323 aa  265  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  45.39 
 
 		 323 aa  265  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  45.39 
 
 		 336 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  44.37 
 
 		 321 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  46.39 
 
 		 348 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  46.31 
 
 		 327 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  46.33 
 
 		 314 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  44.48 
 
 		 324 aa  263  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  48.97 
 
 		 332 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  46.5 
 
 		 335 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  44.01 
 
 		 353 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  42.41 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  47.26 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  44.34 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  42.67 
 
 		 325 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4432  hypothetical protein  45.93 
 
 		 324 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65696  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  43.33 
 
 		 328 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  44.01 
 
 		 322 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  44.24 
 
 		 324 aa  259  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  46.31 
 
 		 322 aa  258  9e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  45.9 
 
 		 335 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  44.85 
 
 		 335 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  43.71 
 
 		 320 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  48.47 
 
 		 386 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  45.3 
 
 		 338 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  43.25 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  44.04 
 
 		 353 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  44.52 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>