More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4871 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4871  porin  100 
 
 		 371 aa  741    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0000247804  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3567  porin  73.46 
 
 		 363 aa  535  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000504769  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  70.28 
 
 		 365 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1084  porin transmembrane protein  72.38 
 
 		 364 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00229533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3704  outer membrane porin  69.48 
 
 		 363 aa  496  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0181941 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5510  porin  70.93 
 
 		 372 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  57.07 
 
 		 373 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3117  porin  55.68 
 
 		 375 aa  403  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0494554  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3809  porin  55.08 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261808  normal  0.302186 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0265  porin  55.01 
 
 		 373 aa  381  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0179073  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1374  porin  49.72 
 
 		 368 aa  352  4e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4539  porin  52.86 
 
 		 382 aa  351  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.516976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1352  porin  52.75 
 
 		 377 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5460  porin  50 
 
 		 382 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.376591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4912  porin  49.72 
 
 		 382 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.203081  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0054  outer membrane protein (porin)  50.42 
 
 		 382 aa  332  6e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.914863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0181  outer membrane protein (porin)  49.19 
 
 		 385 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6973  porin  51.21 
 
 		 376 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4597  porin  49.72 
 
 		 382 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000189593 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5227  porin  49.72 
 
 		 382 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5632  porin  49.72 
 
 		 382 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0304788  decreased coverage  0.00129343 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4019  porin Gram-negative type  48.15 
 
 		 379 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000808591  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02151  porin signal peptide protein  50.7 
 
 		 374 aa  318  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3218  porin  49.19 
 
 		 373 aa  315  7e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.819696  normal  0.0778047 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1072  outer membrane porin  47.45 
 
 		 379 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2365  porin  47.45 
 
 		 379 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3196  outer membrane protein (porin)  48.34 
 
 		 361 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00143868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4878  porin  46.95 
 
 		 382 aa  309  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311549  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0633  putative outer membrane porin  47.72 
 
 		 379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1796  putative outer membrane porin  47.72 
 
 		 379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0933184  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0832  putative outer membrane porin  47.72 
 
 		 379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2109  outer membrane protein (porin)  47.44 
 
 		 362 aa  293  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0416  outer membrane protein (porin)  45.73 
 
 		 364 aa  290  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.441779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4595  outer membrane protein (porin)  45.6 
 
 		 364 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1076  outer membrane protein (porin)  46.38 
 
 		 362 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.441264  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1076  outer membrane protein (porin)  46.38 
 
 		 362 aa  281  9e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0592135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5128  outer membrane protein (porin)  45.33 
 
 		 364 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3528  OmpC family outer membrane porin  44.95 
 
 		 372 aa  278  9e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.169266 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  43.23 
 
 		 353 aa  215  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  42.24 
 
 		 351 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  40.22 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  36.96 
 
 		 355 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  39.27 
 
 		 386 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  39.47 
 
 		 377 aa  196  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  39.01 
 
 		 386 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  38.36 
 
 		 353 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  40.56 
 
 		 352 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  38.01 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  37.5 
 
 		 362 aa  190  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  37.31 
 
 		 371 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  35.98 
 
 		 367 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  37.13 
 
 		 355 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  37.13 
 
 		 355 aa  186  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  38.89 
 
 		 358 aa  186  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6305  porin  36.49 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  38.27 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  38.75 
 
 		 401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  36.48 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  39.4 
 
 		 355 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1599  putative outer membrane porin signal peptide protein  37.8 
 
 		 386 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102431  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  37.53 
 
 		 352 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  38.68 
 
 		 354 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  38.68 
 
 		 354 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1733  porin  37.59 
 
 		 398 aa  176  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0848216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4991  porin  36.45 
 
 		 393 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156454  normal  0.214455 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  38.59 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3855  porin  37.16 
 
 		 388 aa  172  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  37.43 
 
 		 368 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  35.9 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  35.1 
 
 		 367 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2134  porin  37.66 
 
 		 387 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543846  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  35.18 
 
 		 392 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  35.18 
 
 		 392 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1737  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  35.79 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  36.41 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5288  outer membrane porin  36.34 
 
 		 386 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_003296  RS01789  porin protein  38.51 
 
 		 273 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  33.09 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2990  porin  35.88 
 
 		 387 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0177619  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  35.86 
 
 		 383 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4800  porin  35.73 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0160312  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5712  porin  34.95 
 
 		 378 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4702  porin  33.87 
 
 		 383 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3786  putative outer membrane porin  34.34 
 
 		 391 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4416  porin Gram-negative type  34.79 
 
 		 354 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4306  porin Gram-negative type  34.79 
 
 		 354 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  35.68 
 
 		 350 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  32.82 
 
 		 358 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6031  porin  33.68 
 
 		 383 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00960697  normal  0.0888656 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  32.66 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5757  outer membrane porin  35.25 
 
 		 387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5031  porin  33.33 
 
 		 357 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  32.47 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  32.47 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  34.01 
 
 		 384 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2282  porin  33.51 
 
 		 357 aa  144  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  33.5 
 
 		 383 aa  143  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  34.29 
 
 		 361 aa  142  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4876  porin  31.96 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0061  porin  32.73 
 
 		 363 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0431794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>