More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4866 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 731 aa  1467    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  53.52 
 
 		 723 aa  661    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  55.24 
 
 		 705 aa  716    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  44.09 
 
 		 720 aa  538  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  42.92 
 
 		 709 aa  492  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  41.88 
 
 		 700 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  41.38 
 
 		 712 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  40.14 
 
 		 726 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  41.88 
 
 		 700 aa  469  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  41.74 
 
 		 700 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  41.74 
 
 		 700 aa  469  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  41.74 
 
 		 700 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  41.74 
 
 		 700 aa  469  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  41.59 
 
 		 700 aa  465  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  41.45 
 
 		 700 aa  464  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  41.59 
 
 		 700 aa  465  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  41.69 
 
 		 715 aa  459  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  40.61 
 
 		 728 aa  458  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  40.17 
 
 		 681 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  41.85 
 
 		 697 aa  451  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  39.48 
 
 		 706 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  39.34 
 
 		 706 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  39.45 
 
 		 742 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  39.34 
 
 		 706 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  39.48 
 
 		 706 aa  449  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  39.23 
 
 		 721 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  39.91 
 
 		 694 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  38.93 
 
 		 706 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  38.05 
 
 		 706 aa  424  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  38.15 
 
 		 710 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  38.06 
 
 		 743 aa  414  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  40.2 
 
 		 723 aa  409  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  36.8 
 
 		 701 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3353  TonB-dependent receptor plug  37.74 
 
 		 736 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130298  normal  0.417052 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  34.24 
 
 		 675 aa  346  8e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  34.67 
 
 		 691 aa  332  1e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  32.53 
 
 		 688 aa  326  1e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  32.73 
 
 		 705 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 		 678 aa  278  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 680 aa  228  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 770 aa  169  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 742 aa  161  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 736 aa  159  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 780 aa  157  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 730 aa  155  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 700 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 734 aa  153  8.999999999999999e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  26.64 
 
 		 727 aa  153  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 733 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 757 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 717 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 715 aa  147  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 681 aa  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 698 aa  145  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  25.97 
 
 		 712 aa  144  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 713 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  24.9 
 
 		 701 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 716 aa  138  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 737 aa  138  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  22.16 
 
 		 762 aa  137  7.000000000000001e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0808  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 714 aa  135  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 702 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 726 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 682 aa  134  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0733  tonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 680 aa  130  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 706 aa  127  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 681 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1763  TonB-dependent receptor plug  24.2 
 
 		 703 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0187171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  25.54 
 
 		 797 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 688 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  21.47 
 
 		 696 aa  116  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5661  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 769 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 757 aa  111  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1449  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 740 aa  110  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.389596 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 678 aa  109  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2902  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 791 aa  108  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.119413 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2625  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 657 aa  107  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.980205  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5774  TonB-dependent receptor plug  23.57 
 
 		 690 aa  104  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.872771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1025  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 791 aa  103  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4173  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 739 aa  102  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1794  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 664 aa  101  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 698 aa  99  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  26.2 
 
 		 809 aa  99  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 700 aa  97.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 782 aa  95.9  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  25.58 
 
 		 809 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.6 
 
 		 750 aa  94.7  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  24.62 
 
 		 695 aa  92.8  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  25.4 
 
 		 809 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 692 aa  91.3  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1760  TonB-dependent heme receptor  21.76 
 
 		 664 aa  91.7  5e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 		 809 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1543  TonB-dependent receptor plug  24.8 
 
 		 712 aa  90.5  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 720 aa  90.5  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 836 aa  90.1  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 769 aa  90.1  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 695 aa  90.1  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 721 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  24.8 
 
 		 727 aa  89  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  25.15 
 
 		 782 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>