More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4841 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4841  2,3-dimethylmalate lyase  100 
 
 		 284 aa  566  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5990  2,3-dimethylmalate lyase  61.48 
 
 		 292 aa  353  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0806  isocitrate lyase family protein  61.48 
 
 		 287 aa  352  4e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1933  isocitrate lyase family protein  63.03 
 
 		 299 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1916  isocitrate lyase family protein  60.99 
 
 		 287 aa  348  6e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326533 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3767  2,3-dimethylmalate lyase  59.15 
 
 		 289 aa  333  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0689  methylisocitrate lyase  61.15 
 
 		 292 aa  328  8e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0396  methylisocitrate lyase  50.56 
 
 		 285 aa  264  1e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  47.96 
 
 		 311 aa  259  3e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2154  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  44.84 
 
 		 289 aa  258  8e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.908949 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  46.47 
 
 		 304 aa  257  2e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  46.1 
 
 		 306 aa  256  4e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  48.15 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.649003 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0279  2,3-dimethylmalate lyase  49.61 
 
 		 274 aa  249  5e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.577564  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3579  PEP phosphonomutase  46.71 
 
 		 286 aa  241  7.999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00948814  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1632  2,3-dimethylmalate lyase  48.71 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.171622 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2082  2,3-dimethylmalate lyase  48.34 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4291  2,3-dimethylmalate lyase  51.64 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.268229 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5405  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  47.78 
 
 		 293 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00321329  normal  0.260192 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1203  2,3-dimethylmalate lyase  47.41 
 
 		 293 aa  234  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00337991  normal  0.996052 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4474  2,3-dimethylmalate lyase  46.34 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4757  2,3-dimethylmalate lyase  43.62 
 
 		 287 aa  233  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000491467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  46.95 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7954  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  47.87 
 
 		 288 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0256  putative methylisocitrate lyase  41.49 
 
 		 288 aa  229  3e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.764901 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2513  2,3-dimethylmalate lyase  45.26 
 
 		 293 aa  229  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4268  2,3-dimethylmalate lyase  43.97 
 
 		 291 aa  228  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485286  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1614  2,3-dimethylmalate lyase  54.93 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.863287  normal  0.36405 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0101  methylisocitrate lyase  46.84 
 
 		 308 aa  223  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1130  2,3-dimethylmalate lyase  45.2 
 
 		 287 aa  222  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  43.06 
 
 		 287 aa  221  8e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  41.99 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  41.99 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5166  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  41.99 
 
 		 292 aa  219  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.919323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0661  2,3-dimethylmalate lyase  40.62 
 
 		 310 aa  219  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.428755 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3949  isocitrate lyase family protein  41.64 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0204  2,3-dimethylmalate lyase  49.36 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1072  2-methylisocitrate lyase  45.7 
 
 		 301 aa  216  5e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0864  2,3-dimethylmalate lyase  44.49 
 
 		 289 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000979692  hitchhiker  0.000000949403 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0800  methylisocitrate lyase  42.54 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0629223  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4140  2-methylisocitrate lyase  41.85 
 
 		 292 aa  208  9e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0315  2-methylisocitrate lyase  44.14 
 
 		 292 aa  208  9e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3644  2-methylisocitrate lyase  41.85 
 
 		 292 aa  208  9e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3825  2-methylisocitrate lyase  44.14 
 
 		 292 aa  208  9e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2209  2-methylisocitrate lyase  45.17 
 
 		 294 aa  208  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.629465  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4021  2-methylisocitrate lyase  41.48 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3945  2-methylisocitrate lyase  41.48 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4047  2-methylisocitrate lyase  41.48 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0345  2-methylisocitrate lyase  43.36 
 
 		 292 aa  206  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3629  2-methylisocitrate lyase  43.75 
 
 		 292 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1459  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  43.33 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1110  2-methylisocitrate lyase  39.86 
 
 		 296 aa  203  2e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.452189 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0461  2,3-dimethylmalate lyase  40.43 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0071  2-methylisocitrate lyase  42.36 
 
 		 296 aa  202  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3294  2-methylisocitrate lyase  42.37 
 
 		 294 aa  202  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.203078 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2775  2,3-dimethylmalate lyase  41.96 
 
 		 287 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0458  2,3-dimethylmalate lyase  40.78 
 
 		 296 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4791  2,3-dimethylmalate lyase  44.44 
 
 		 307 aa  202  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0925  2-methylisocitrate lyase  39.42 
 
 		 292 aa  201  8e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1311  2-methylisocitrate lyase  39.05 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0110415  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2822  2-methylisocitrate lyase  41.8 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03370  2-methylisocitrate lyase  40.93 
 
 		 291 aa  199  6e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3496  methylisocitrate lyase  43.12 
 
 		 314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2400  2-methylisocitrate lyase  41.3 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.951557  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1857  2-methylisocitrate lyase  40.23 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0509  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  41.2 
 
 		 289 aa  196  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2111  2-methylisocitrate lyase  40.93 
 
 		 292 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.12913  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0054  2-methylisocitrate lyase  37.59 
 
 		 297 aa  195  7e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1657  2,3-dimethylmalate lyase  41.64 
 
 		 306 aa  195  7e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  0.68628 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0659  2,3-dimethylmalate lyase  39.78 
 
 		 322 aa  195  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858206 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3861  2-methylisocitrate lyase  39.18 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0052  2-methylisocitrate lyase  38.15 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1092  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  40.28 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.301564  normal  0.346372 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3975  2-methylisocitrate lyase  39.18 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.583072 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1869  2-methylisocitrate lyase  38.77 
 
 		 292 aa  193  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1197  2-methylisocitrate lyase  40.82 
 
 		 297 aa  193  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2320  2,3-dimethylmalate lyase  48.91 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0895569  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2605  2-methylisocitrate lyase  44.1 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  hitchhiker  0.000512853 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3436  2-methylisocitrate lyase  42.8 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00574123  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2499  2-methylisocitrate lyase  44.34 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.741837  normal  0.047618 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0283  putative methylisocitrate lyase  44.24 
 
 		 289 aa  192  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.548186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40267  predicted protein  38.49 
 
 		 323 aa  192  6e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.158521  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1820  2-methylisocitrate lyase  39.45 
 
 		 292 aa  192  7e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0952  2-methylisocitrate lyase  39.22 
 
 		 298 aa  191  8e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1726  methylisocitrate lyase  43.59 
 
 		 302 aa  191  8e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2334  2-methylisocitrate lyase  42.41 
 
 		 296 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474392  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0141  2-methylisocitrate lyase  38.46 
 
 		 297 aa  191  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.758126  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0408  2-methylisocitrate lyase  43.19 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000002587 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0420  2-methylisocitrate lyase  43.19 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0232158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2648  methylisocitrate lyase  41.88 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.843725  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0462  2-methylisocitrate lyase  43.19 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.237337  hitchhiker  0.00000000745318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1935  2-methylisocitrate lyase  42.41 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146073  hitchhiker  0.00000021306 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0402  2-methylisocitrate lyase  43.19 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1664  2-methylisocitrate lyase  39.77 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1775  2-methylisocitrate lyase  42.41 
 
 		 296 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367112  hitchhiker  0.000175442 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1177  2-methylisocitrate lyase  40.62 
 
 		 290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.984478  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0122  2-methylisocitrate lyase  41.27 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.528863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2158  methylisocitrate lyase  40.84 
 
 		 302 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081733  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0400  2-methylisocitrate lyase  42.8 
 
 		 295 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0664462  hitchhiker  0.000000000169441 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0819  2-methylisocitrate lyase  40.62 
 
 		 290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>