More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4834 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  59.23 
 
 
1139 aa  1229    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  57.7 
 
 
1138 aa  1184    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  57.03 
 
 
1141 aa  1217    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  100 
 
 
1149 aa  2323    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  56.61 
 
 
1148 aa  1210    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  56.82 
 
 
1151 aa  1210    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  56.43 
 
 
1151 aa  1199    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.09 
 
 
1117 aa  559  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  35.57 
 
 
1122 aa  530  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  32.69 
 
 
1105 aa  525  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  31.07 
 
 
1048 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  38.86 
 
 
1063 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  32.45 
 
 
1377 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  32.47 
 
 
1134 aa  379  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  33.86 
 
 
1093 aa  373  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  29.43 
 
 
1403 aa  366  1e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  30.22 
 
 
1037 aa  348  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.81 
 
 
1089 aa  333  9e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.3 
 
 
1081 aa  328  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  28.63 
 
 
1402 aa  325  4e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  30.78 
 
 
1043 aa  322  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.97 
 
 
1080 aa  321  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.2 
 
 
1055 aa  304  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.13 
 
 
1291 aa  303  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  29.74 
 
 
1050 aa  296  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.74 
 
 
1050 aa  296  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.82 
 
 
1175 aa  293  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.94 
 
 
1053 aa  291  6e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.79 
 
 
1014 aa  288  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  28.04 
 
 
1046 aa  288  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  30.33 
 
 
1065 aa  287  8e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  31.08 
 
 
1227 aa  281  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  31.05 
 
 
1126 aa  275  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  29.2 
 
 
1160 aa  268  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  27.71 
 
 
1398 aa  264  8.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  29.08 
 
 
1123 aa  258  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  26.88 
 
 
1055 aa  258  7e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  28.05 
 
 
1142 aa  248  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.13 
 
 
1429 aa  238  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28 
 
 
1360 aa  237  8e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.8 
 
 
1403 aa  235  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  26.74 
 
 
1094 aa  233  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.68 
 
 
1422 aa  229  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.02 
 
 
1441 aa  219  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.6 
 
 
1295 aa  219  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.63 
 
 
1023 aa  218  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  29.6 
 
 
1198 aa  218  5.9999999999999996e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  29.29 
 
 
1271 aa  213  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  27.89 
 
 
1349 aa  210  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  29.19 
 
 
1027 aa  209  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  28.48 
 
 
1027 aa  207  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  28.48 
 
 
1027 aa  207  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  30.23 
 
 
1067 aa  204  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 
1348 aa  202  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.23 
 
 
1087 aa  201  7e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  26.61 
 
 
1358 aa  200  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.09 
 
 
1226 aa  198  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.4 
 
 
1285 aa  193  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  27.85 
 
 
1204 aa  189  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  26.76 
 
 
1342 aa  188  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  26.65 
 
 
1349 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  26.65 
 
 
1349 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 
1298 aa  183  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  26.91 
 
 
1353 aa  179  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  25.25 
 
 
1311 aa  178  6e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.93 
 
 
1096 aa  175  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  25.25 
 
 
1133 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0619  protein kinase domain-containing protein  27.81 
 
 
1359 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.646002  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0634  putative serine/threonine protein kinase  27.63 
 
 
1359 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4346  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.72 
 
 
1190 aa  159  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0801  protein kinase domain-containing protein  27.66 
 
 
1359 aa  159  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.423888  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0020  protein kinase domain-containing protein  27.55 
 
 
1213 aa  158  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2490  protein kinase domain-containing protein  27.55 
 
 
1359 aa  157  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.460465  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2217  protein kinase domain-containing protein  27.55 
 
 
1350 aa  157  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0639983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2866  protein kinase domain-containing protein  27.55 
 
 
1359 aa  157  9e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  27.27 
 
 
1264 aa  154  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  27.09 
 
 
1029 aa  146  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  20.05 
 
 
1153 aa  141  8.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4787  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.59 
 
 
1190 aa  134  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313261 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 
665 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2055  ATPase-like protein  26.31 
 
 
1289 aa  129  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.125092  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  27.78 
 
 
1055 aa  129  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1214  adenylate/guanylate cyclase  25.41 
 
 
1130 aa  128  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  28.86 
 
 
972 aa  128  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  27.75 
 
 
956 aa  127  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1236  adenylate/guanylate cyclase  32.13 
 
 
320 aa  126  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.818625  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1253  putative adenylate/guanylate cyclase  32.13 
 
 
320 aa  126  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344364  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  32.69 
 
 
735 aa  126  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0329  ATPase-like protein  24.79 
 
 
1169 aa  125  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.257596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2514  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.74 
 
 
805 aa  125  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255798  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  30.75 
 
 
1007 aa  124  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  26.89 
 
 
1015 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.53 
 
 
1468 aa  122  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  25.1 
 
 
914 aa  119  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  27.37 
 
 
992 aa  119  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3632  serine/threonine protein kinase  28.23 
 
 
1340 aa  118  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419397 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  26.86 
 
 
1020 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  28.31 
 
 
1193 aa  117  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  26.12 
 
 
961 aa  116  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  32.69 
 
 
744 aa  115  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>