163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4786 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  299  7.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  49.6 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  48.06 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  48.41 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  47.24 
 
 		 130 aa  133  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  50.77 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  50.39 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  48.84 
 
 		 132 aa  129  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  50.78 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  48.06 
 
 		 132 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  46.09 
 
 		 130 aa  126  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  50.81 
 
 		 132 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  47.62 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  38.76 
 
 		 143 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  42.74 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  43.65 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  39.09 
 
 		 141 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  34.38 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  42.2 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  42.2 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  35.88 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  34.65 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  42.42 
 
 		 129 aa  83.6  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  36.72 
 
 		 136 aa  83.6  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  35.43 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  35.43 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  41.28 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  34.62 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  32.41 
 
 		 321 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  35.38 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  39.09 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  39.39 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  34.35 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  37.78 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  33.86 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  33.86 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  32.56 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  34.75 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  35.77 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  36.36 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  34.21 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  32.58 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  33.04 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  36.44 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  31.25 
 
 		 311 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  33.88 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  33.07 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  35.51 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  35.51 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  35.51 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  30.65 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  34.21 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  28.46 
 
 		 548 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  34.71 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  33.07 
 
 		 139 aa  67  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1073  hypothetical protein  35.63 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  35.29 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  30.23 
 
 		 550 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  30.23 
 
 		 550 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  28.46 
 
 		 548 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  30.4 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  32.03 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  32.46 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  32.46 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  31.01 
 
 		 550 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  26.36 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  31.06 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0317  protein of unknown function DUF35  26.32 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  30.84 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2360  hypothetical protein  35.2 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  29.66 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  29.69 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  30.53 
 
 		 141 aa  60.1  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6482  hypothetical protein  32.5 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  31.62 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  26.61 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  32.23 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  29.57 
 
 		 541 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  31.5 
 
 		 417 aa  57.8  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  29.51 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1009  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  57  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51200  hypothetical protein  34.48 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.719355  hitchhiker  0.00000582925 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  30.97 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  31.4 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  32.08 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  31.03 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  30.71 
 
 		 417 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  32.63 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  31.3 
 
 		 324 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4369  hypothetical protein  31.3 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  28.68 
 
 		 312 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  30.25 
 
 		 317 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  30.25 
 
 		 318 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  35.48 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  30.25 
 
 		 317 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>