116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4692 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 		 324 aa  642    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  44.97 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  43.03 
 
 		 366 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  41.96 
 
 		 371 aa  229  6e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3229  BNR domain-containing protein  37.37 
 
 		 338 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.94 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  31.58 
 
 		 897 aa  96.7  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  32.57 
 
 		 661 aa  85.1  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  32.29 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.45 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  30.45 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.6 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  31.63 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  29.57 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  30.67 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  33.04 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.36 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  29.74 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  30.22 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  31.12 
 
 		 340 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3779  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.38 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00208447  decreased coverage  0.000226347 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.43 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  30.12 
 
 		 365 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1157  hypothetical protein  28.09 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0584  hypothetical protein  29.63 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0424726  hitchhiker  0.000233592 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2128  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.09 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.437316  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4345  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.59 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6841  hypothetical protein  30 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109659  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  31.5 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  33.68 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.61 
 
 		 369 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3425  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.23 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000735114  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0623  hypothetical protein  29.77 
 
 		 614 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000504443  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3143  BNR domain-containing protein  23.33 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.980109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2748  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.34 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000496778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0887  hypothetical protein  28.96 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0720354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  28.12 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  27.59 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0132  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.05 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5038  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.02 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4061  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  29.68 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369281  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5822  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.02 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0966  hypothetical protein  29.84 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4357  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.54 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  27.52 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  30.1 
 
 		 320 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2271  hypothetical protein  27.05 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2810  glycosyl hydrolase  25.99 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0399  photosystem II stability/assembly factor-like protein  29.39 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3921  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.77 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2065  uncharacterized protein related to photosystem II stability/assembly factor  25 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2478  BNR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183941  normal  0.0107385 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2223  BNR repeat-containing protein  24.22 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110156  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3430  BNR repeat-containing protein  26.54 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0324966  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1590  BNR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2667  hypothetical protein  25.63 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.166994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  24.51 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4028  glycosyl hydrolase, BNR repeat  30.3 
 
 		 355 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0574682  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0201  Ycf48-like protein  27.62 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.345386  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6866  glycosyl hydrolase  23.64 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0347916  normal  0.0962421 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2000  BNR repeat-containing protein  24.89 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0797  hypothetical protein  32.97 
 
 		 1140 aa  60.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3201  BNR domain-containing protein  25 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.305002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4958  hypothetical protein  29.32 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.75067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3239  hypothetical protein  31.84 
 
 		 931 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1940  BNR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.242255  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1219  metallophosphoesterase  28.81 
 
 		 759 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1238  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  30.9 
 
 		 2082 aa  55.8  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  27.06 
 
 		 698 aa  55.8  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0646  hypothetical protein  25 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0104627  normal  0.241315 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1207  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.23 
 
 		 616 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1807  BNR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.120061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47413  predicted protein  25.26 
 
 		 408 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2245  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.37 
 
 		 352 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000222416  hitchhiker  0.00000000000000277962 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2138  BNR repeat-containing protein  22.76 
 
 		 342 aa  53.9  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  26.29 
 
 		 742 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1856  Ycf48-like protein  27.22 
 
 		 339 aa  53.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0816  Ycf48-like protein  27.04 
 
 		 334 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2227  Ycf48-like protein  25.71 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537914  normal  0.190318 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03761  Ycf48-like protein  25.62 
 
 		 338 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.156925 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6617  oxidoreductase, putative  24.61 
 
 		 341 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1662  Ycf48-like protein  26.96 
 
 		 338 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243445  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  31.48 
 
 		 1030 aa  50.1  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0228  Ycf48-like protein  26.36 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3373  oxidoreductase  26.1 
 
 		 372 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25281  Ycf48-like protein  25.78 
 
 		 335 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0852  hypothetical protein  23.5 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03221  Ycf48-like protein  24.68 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2949  hypothetical protein  21.19 
 
 		 714 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.211867 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1525  Rhs family-like protein  32 
 
 		 3794 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14033 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1678  BNR repeat-containing protein  22.57 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4148  Ycf48-like protein  22.86 
 
 		 336 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2442  BNR repeat-containing protein  29.08 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4188  Ycf48-like protein  22.86 
 
 		 336 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1178  Ycf48-like protein  24.27 
 
 		 349 aa  47.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03191  Ycf48-like protein  24.59 
 
 		 338 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1909  BNR repeat protein  28.24 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00042683  normal  0.120925 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1783  BNR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 336 aa  47  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329524  normal  0.195549 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>